RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000086471.11

Suds3-201, Transcript of Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Suds3, Length 2,425 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suds3-201ENSMUST00000086471 Svs3bQ8BZH8 265 aa24.52■■□□□ 1.52
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ddx24Q9ESV0 857 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tspyl1O88852 379 aa24.51■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 IvlP48997 467 aa24.51■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tars2Q3UQ84 723 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Clul1Q3ZRW6 464 aa24.51■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Znf235Q61116 645 aa24.51■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Olfr30Q8VGD8 315 aa24.51■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Prc1Q99K43 603 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cuedc2Q9CXX9 284 aa24.51■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 HttP42859 3119 aa24.51■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mup10A2BIN1 180 aa24.51■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mup14A2CEK7 180 aa24.51■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mup19A9C497 187 aa24.51■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mup15A9R9W0 180 aa24.51■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mup17B5X0G2 180 aa24.51■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mup8E9PVW0 235 aa24.51■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gm4302E9PX25 294 aa24.51■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Vmn2r17E9PYF5 849 aa24.51■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mup7E9QA79 235 aa24.51■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mup6P02762 180 aa24.51■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mup1P11588 180 aa24.51■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mup2P11589 180 aa24.51■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Lmo2P25801 158 aa24.51■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mybl1P51960 751 aa24.51■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Atg9bQ6EBV9 922 aa24.51■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Camta2Q80Y50 1208 aa24.51■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Snrnp25Q8VIK1 123 aa24.51■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 GarsQ9CZD3 729 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Trpm5Q9JJH7 1158 aa24.51■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cfap221A9Q751 836 aa24.5■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Samd15F6XZJ7 620 aa24.5■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 SftpdP50404 374 aa24.5■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 HpseQ6YGZ1 535 aa24.5■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Dr1Q91WV0 176 aa24.5■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cyp39a1Q9JKJ9 470 aa24.5■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Pate3B3GLJ3 98 aa24.5■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 TnfP06804 235 aa24.5■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cetn1P41209 172 aa24.5■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Atp9bP98195 1146 aa24.5■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cd300aQ6SJQ0 318 aa24.5■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Amer2Q8CCJ4 672 aa24.5■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 CmasQ99KK2 432 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Nxnl2Q9D531 156 aa24.5■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 DpysQ9EQF5 519 aa24.5■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mgea5Q9EQQ9 916 aa24.5■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Angptl3Q9R182 455 aa24.5■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Lrrc74aA0A1Y7VMD6 494 aa24.49■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Osbpl9A2A8Z1 736 aa24.49■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gm3252E9PUT9 216 aa24.49■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gm3468E9QAJ8 216 aa24.49■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Kpna6O35345 536 aa24.49■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Becn2P0DM65 447 aa24.49■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Scp2P32020 547 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cyp2c38P56655 490 aa24.49■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Slc20a2Q80UP8 656 aa24.49■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Prpf4Q9DAW6 521 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Maged1Q9QYH6 775 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cep350E9Q309 3095 aa24.49■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Zfp990B1AVN5 605 aa24.49■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Dnajc21E9Q8D0 531 aa24.49■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Slc12a2P55012 1205 aa24.49■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Sparcl1P70663 650 aa24.49■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Zscan2Q07230 614 aa24.49■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Uimc1Q5U5Q9 727 aa24.49■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ttyh3Q6P5F7 524 aa24.49■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gpatch2lQ6PE65 482 aa24.49■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Kdm1bQ8CIG3 826 aa24.49■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ctage5Q8R311 779 aa24.49■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ddx56Q9D0R4 546 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ccdc91Q9D8L5 442 aa24.49■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Kcnd2Q9Z0V2 630 aa24.49■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Wdr81Q5ND34 1934 aa24.48■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Marcksl1P28667 200 aa24.48■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Sesn2P58043 480 aa24.48■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Psmc1P62192 440 aa24.48■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 YwhaeP62259 255 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Q3UE31 404 aa24.48■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Zdhhc24Q6IR37 284 aa24.48■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 IqceQ6PCQ0 778 aa24.48■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tspan18Q80WR1 248 aa24.48■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Zdhhc3Q8R173 299 aa24.48■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Krt17Q9QWL7 433 aa24.48■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ttc3O88196 1979 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 0610012G03RikA0A0J9YTR2 95 aa24.47■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Akr1b10G5E895 316 aa24.47■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Top6blJ3QMY9 579 aa24.47■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Krt19P19001 403 aa24.47■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 HelqQ2VPA6 1069 aa24.47■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ctnna2Q61301 953 aa24.47■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 CochQ62507 552 aa24.47■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Lsm8Q6ZWM4 96 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gpr151Q7TSN6 422 aa24.47■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Pum3Q8BKS9 647 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Fbxo38Q8BMI0 1194 aa24.47■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Fbxl5Q8C2S5 690 aa24.47■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gpc3Q8CFZ4 579 aa24.47■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 SfpqQ8VIJ6 699 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 GOLGA7BQ9D428 167 aa24.47■■□□□ 1.51
Suds3-201ENSMUST00000086471 Rdh14Q9ERI6 334 aa24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.9 ms