RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063006.11

Ccdc42-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Ccdc42, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PirQ9D711 290 aa9.81□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 LrmdaQ9D9B4 229 aa9.81□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Scyl3Q9DBQ7 735 aa9.81□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 ParvaQ9EPC1 372 aa9.81□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cables1Q9ESJ1 568 aa9.81□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tacc3Q9JJ11 631 aa9.81□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Trpm5Q9JJH7 1158 aa9.81□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Atad5Q4QY64 1826 aa9.81□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Lrrc63A6H694 637 aa9.8□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 DgkhD3YXJ0 1156 aa9.8□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Scgb2b7D3YYY1 112 aa9.8□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Prdm15E9Q8T2 1174 aa9.8□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm5160F8VPN3 147 aa9.8□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ccl26F8VQM2 93 aa9.8□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gucy1b3O54865 620 aa9.8□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Adam15O88839 864 aa9.8□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gnl1P36916 607 aa9.8□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cd86P42082 309 aa9.8□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PkmP52480 531 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Scarf2P59222 833 aa9.8□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dlg3P70175 849 aa9.8□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sh3bp2Q06649 559 aa9.8□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Palb2Q3U0P1 1104 aa9.8□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Snx25Q3ZT31 840 aa9.8□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mtus1Q5HZI1 1210 aa9.8□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cyfip2Q5SQX6 1253 aa9.8□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 FntaQ61239 377 aa9.8□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fscn1Q61553 493 aa9.8□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Oca2Q62052 833 aa9.8□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Q66JV7 365 aa9.8□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ehbp1Q69ZW3 1231 aa9.8□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gja6Q6S5G4 283 aa9.8□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 C2cd5Q7TPS5 1016 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 R3hdm2Q80TM6 1044 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rhbdf2Q80WQ6 827 aa9.8□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pramel7Q810Y8 479 aa9.8□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc7a14Q8BXR1 771 aa9.8□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Map1sQ8C052 973 aa9.8□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fam126bQ8C729 530 aa9.8□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ccdc134Q8C7V8 229 aa9.8□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc15a5Q8CBB2 566 aa9.8□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Znf467Q8JZL0 594 aa9.8□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vmn1r191Q8K4D0 298 aa9.8□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PhykplQ8R1K4 467 aa9.8□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Csde1Q91W50 798 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dr1Q91WV0 176 aa9.8□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dnajc14Q921R4 703 aa9.8□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 VasnQ9CZT5 673 aa9.8□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Syf2Q9D198 242 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rfx5Q9JL61 658 aa9.8□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 B4galt5Q9JMK0 388 aa9.8□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Maged1Q9QYH6 775 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 CenphQ9QYM8 241 aa9.8□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Myo5aQ99104 1853 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Col6a3E9PWQ3 3284 aa9.79□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm6657A0A1B0GRJ3 277 aa9.79□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 6030498E09RikB1AX85 169 aa9.79□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Abcb5B5X0E4 1255 aa9.79□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Serpinb6bO08804 377 aa9.79□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Guca2bO09051 106 aa9.79□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dpysl4O35098 572 aa9.79□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Prom1O54990 867 aa9.79□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 AcrP23578 436 aa9.79□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ptk2P34152 1090 aa9.79□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Usp4P35123 962 aa9.79□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ndufs6P52503 116 aa9.79□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cyp2c38P56655 490 aa9.79□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 SbdsP70122 250 aa9.79□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Plk1Q07832 603 aa9.79□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Agbl1Q09M05 972 aa9.79□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cdca2Q14B71 982 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nek10Q3UGM2 1111 aa9.79□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ccdc33Q3ULW6 985 aa9.79□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tspyl3Q3UYP3 334 aa9.79□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ndufaf2Q59J78 168 aa9.79□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mybpc2Q5XKE0 1136 aa9.79□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Anks6Q6GQX6 883 aa9.79□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zfp943Q6NZP4 507 aa9.79□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mpp4Q6P7F1 635 aa9.79□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gucy2gQ6TL19 1100 aa9.79□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ssxb10Q6XAR7 170 aa9.79□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ublcp1Q8BGR9 318 aa9.79□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rufy1Q8BIJ7 712 aa9.79□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pum3Q8BKS9 647 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ttc39bQ8BYY4 617 aa9.79□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Kct2Q8K201 259 aa9.79□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zdhhc3Q8R173 299 aa9.79□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mtss1Q8R1S4 759 aa9.79□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Oit3Q8R4V5 546 aa9.79□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Lmcd1Q8VEE1 365 aa9.79□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Caskin2Q8VHK1 1201 aa9.79□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 VillQ91YD6 859 aa9.79□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dpp3Q99KK7 738 aa9.79□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tas1r1Q99PG6 842 aa9.79□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cep19Q9CQA8 163 aa9.79□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dph5Q9CWQ0 281 aa9.79□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fam212aQ9CX62 282 aa9.79□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Lman1Q9D0F3 517 aa9.79□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Stx17Q9D0I4 301 aa9.79□□□□□ -0.84
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mrpl2Q9D773 306 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.3 ms