Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
Ssxb10Q6XAR7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Ssxb10Q6XAR7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Ssxb10Q6XAR7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Ssxb10Q6XAR7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Ssxb10Q6XAR7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Ssxb10Q6XAR7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ssxb10Q6XAR7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ssxb10Q6XAR7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Ssxb10Q6XAR7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ssxb10Q6XAR7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Ssxb10Q6XAR7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Ssxb10Q6XAR7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ssxb10Q6XAR7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Ssxb10Q6XAR7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Ssxb10Q6XAR7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ssxb10Q6XAR7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ssxb10Q6XAR7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ssxb10Q6XAR7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ssxb10Q6XAR7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Ssxb10Q6XAR7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ssxb10Q6XAR7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Ssxb10Q6XAR7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ssxb10Q6XAR7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Ssxb10Q6XAR7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ssxb10Q6XAR7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ssxb10Q6XAR7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
Ssxb10Q6XAR7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Ssxb10Q6XAR7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Ssxb10Q6XAR7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Ssxb10Q6XAR7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ssxb10Q6XAR7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ssxb10Q6XAR7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ssxb10Q6XAR7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Ssxb10Q6XAR7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Ssxb10Q6XAR7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Ssxb10Q6XAR7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ssxb10Q6XAR7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ssxb10Q6XAR7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ssxb10Q6XAR7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ssxb10Q6XAR7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ssxb10Q6XAR7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ssxb10Q6XAR7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ssxb10Q6XAR7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ssxb10Q6XAR7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Ssxb10Q6XAR7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ssxb10Q6XAR7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ssxb10Q6XAR7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ssxb10Q6XAR7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Ssxb10Q6XAR7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ssxb10Q6XAR7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ssxb10Q6XAR7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ssxb10Q6XAR7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ssxb10Q6XAR7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ssxb10Q6XAR7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ssxb10Q6XAR7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Ssxb10Q6XAR7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ssxb10Q6XAR7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ssxb10Q6XAR7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ssxb10Q6XAR7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ssxb10Q6XAR7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Ssxb10Q6XAR7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ssxb10Q6XAR7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ssxb10Q6XAR7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ssxb10Q6XAR7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ssxb10Q6XAR7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ssxb10Q6XAR7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ssxb10Q6XAR7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Ssxb10Q6XAR7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ssxb10Q6XAR7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ssxb10Q6XAR7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ssxb10Q6XAR7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ssxb10Q6XAR7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ssxb10Q6XAR7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ssxb10Q6XAR7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ssxb10Q6XAR7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ssxb10Q6XAR7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ssxb10Q6XAR7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ssxb10Q6XAR7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Ssxb10Q6XAR7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ssxb10Q6XAR7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ssxb10Q6XAR7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ssxb10Q6XAR7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ssxb10Q6XAR7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ssxb10Q6XAR7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ssxb10Q6XAR7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Ssxb10Q6XAR7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ssxb10Q6XAR7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ssxb10Q6XAR7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ssxb10Q6XAR7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ssxb10Q6XAR7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ssxb10Q6XAR7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ssxb10Q6XAR7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ssxb10Q6XAR7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ssxb10Q6XAR7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ssxb10Q6XAR7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ssxb10Q6XAR7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ssxb10Q6XAR7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ssxb10Q6XAR7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ssxb10Q6XAR7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
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