RNA–Protein interactions for RNA: YPL060C-A

YPL060C-A, Transcript of TyA Gag protein, yeastyeast

Gene YPL060C-A, Length 3,315 nt, Biotype pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL060C-AYPL060C-A SLM6P38343 150 aa-0.6□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A RFC2P40348 353 aa-0.6□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A ABF2Q02486 183 aa-0.6□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A ACC1Q00955 2233 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A RAD9P14737 1309 aa-0.61□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A YLR236CA0A023PZG4 107 aa-0.61□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A POP4P38336 279 aa-0.61□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A SBH1P52870 82 aa-0.61□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A PRP11Q07350 266 aaPredicted RBP-0.61□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A ATG31Q12421 196 aa-0.61□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A FMP16Q12497 93 aa-0.61□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A PDR18P53756 1333 aa-0.61□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A SWE1P32944 819 aa-0.61□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A MAK5P38112 773 aaPredicted RBP-0.61□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A YNR077CP53758 84 aa-0.61□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A YLR036CQ07986 203 aa-0.61□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A MDM35O60200 86 aa-0.61□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A SSO1P32867 290 aa-0.61□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A LRP1P38801 184 aaKnown RBP-0.61□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A RIB4P50861 169 aaPredicted RBP-0.61□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A RTC4P53850 401 aa-0.61□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A HAP2P06774 265 aa-0.62□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A COA1P40452 197 aa-0.62□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A GEP7P53171 287 aa-0.62□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A FCY1Q12178 158 aa-0.62□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A YLR156WP0CE96 114 aa-0.62□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A YLR159WP0CE97 114 aa-0.62□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A YLR161WP0CE98 114 aa-0.62□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A SHQ1P40486 507 aaPredicted RBP-0.62□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A CUS2P53830 285 aaPredicted RBP-0.62□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A POP3P53833 195 aaPredicted RBP-0.62□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A YDR274CP87283 123 aa-0.62□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A MRPL25P23369 157 aa-0.63□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A YCR087C-AP37263 153 aa-0.63□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A MOB1P40484 314 aa-0.63□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A YRB2P40517 327 aa-0.63□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A YJR111CP47148 283 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A YPL229WQ99395 206 aa-0.63□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A IKI3Q06706 1349 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A SRL3P36167 246 aa-0.63□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A UMP1P38293 148 aa-0.63□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A CUP9P41817 306 aa-0.63□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A AVO2Q04749 426 aa-0.63□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A COA6Q3E846 104 aa-0.63□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A RPL25P04456 142 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A YCR090CP25654 182 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A IBA57P47158 497 aa-0.63□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A NOP13P53883 403 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.63□□□□□ -2.51not detected
YPL060C-AYPL060C-A FYV6P53913 173 aa-0.63□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A MGR2Q02889 113 aa-0.63□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A YFR032C-BQ8TGU2 87 aa-0.63□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A STF2P16965 84 aa-0.64□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A DCV1P43595 202 aa-0.64□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A FMP33P46998 180 aa-0.64□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A VPS55P47111 140 aa-0.64□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A SOL1P50278 321 aa-0.64□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A TMA20P89886 181 aaPredicted RBP-0.64□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A SPG3Q04398 127 aaPredicted RBP-0.64□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A CUR1Q06469 252 aa-0.64□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A YPR172WQ06608 200 aa-0.64□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A VAC14Q06708 880 aa-0.64□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A BET1P22804 142 aa-0.64□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A MRS4P23500 304 aa-0.64□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A TRM5P38793 499 aa-0.64□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A CTR2P38865 189 aa-0.64□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A CCS1P40202 249 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A BNA6P43619 295 aa-0.64□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A MRH4P53166 561 aa-0.64□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A EGD1Q02642 157 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A YMR099CQ03161 297 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A URA5P13298 226 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A GCN20P43535 752 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A NTG1P31378 399 aa-0.65□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A OSW5P40219 148 aa-0.65□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A YDL157CQ12082 118 aa-0.65□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A YPR013CQ12145 317 aa-0.65□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A ODC2Q99297 307 aa-0.65□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A PPA2P28239 310 aa-0.65□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A YBR285WP38354 144 aa-0.65□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A SDC1Q03323 175 aa-0.65□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A SME1Q12330 94 aaPredicted RBP-0.65□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A YCR001WP25347 104 aa-0.66□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A SER33P40510 469 aa-0.66□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A NUP84P52891 726 aa-0.66□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A LPP1Q04396 274 aa-0.66□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A YAR023CD6VPM8 179 aa-0.66□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A THO1P40040 218 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A GLG2P47011 380 aa-0.66□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A BOL2P53082 120 aa-0.66□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A PRO2P54885 456 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A VBA1Q04301 562 aa-0.66□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A REX3Q12090 404 aa-0.66□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A YDR010CQ12426 110 aa-0.66□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A SEC11P15367 167 aa-0.66□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A YHL042WP38729 150 aa-0.66□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A GVP36P40531 326 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A FRS2P15625 503 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A PRS2P38620 318 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A YFR035CP43608 114 aa-0.67□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A TMA22P47089 198 aaPredicted RBP-0.67□□□□□ -2.52
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