RNA–Protein interactions for RNA: YOL004W

SIN3, Transcript of Component of both the Rpd3S and Rpd3L histone deacetylase complexes, yeastyeast

Gene SIN3, Length 4,611 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SIN3YOL004W TRS65P32893 560 aa2.29□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W MRPL3P36516 390 aa2.29□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W VPS55P47111 140 aa2.29□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W BOL2P53082 120 aa2.29□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W AIM34Q03673 198 aa2.29□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W MRX9Q07349 420 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W YLR126CQ12288 251 aa2.29□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W CDC50P25656 391 aa2.29□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W SSH1P38353 490 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W MCM22P47167 239 aa2.29□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W COX12Q01519 83 aa2.29□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W NCE101Q02820 53 aa2.29□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W MCP1Q12106 302 aa2.29□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W PET54P10834 293 aa2.29□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W MDH2P22133 377 aa2.29□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W RCN1P36054 211 aa2.29□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W RPS29BP41058 56 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W VMA10P48836 114 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W NIF3P53081 288 aa2.29□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W TMA20P89886 181 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W LGE1Q02796 332 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W YML018CQ03730 393 aa2.29□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W UTP15Q04305 513 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W SNT309Q06091 175 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W NOC4Q06512 552 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W SPT3P06844 337 aa2.28□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W AQY1P0CD91 305 aa2.28□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W SEC17P32602 292 aa2.28□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W RRG9P40156 214 aa2.28□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W YKE4P40544 346 aa2.28□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W TES1P41903 349 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W YAE1P47118 141 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W BXI1P48558 297 aa2.28□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W MAL13P53338 473 aa2.28□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W SNO1Q03144 224 aa2.28□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W FSH2Q05015 223 aa2.28□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W YPL245WQ12179 454 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W LSO2Q3E772 92 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W IGO2Q9P305 131 aa2.28□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W HHF1P02309 103 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W COQ3P27680 312 aa2.28□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W SPS18P32572 300 aa2.28□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W ECM33P38248 429 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W RMD6P39975 231 aa2.28□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W PRM5P40476 318 aa2.28□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W YPS5P53057 165 aa2.28□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W TPS1Q00764 495 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W PKR1Q03880 122 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W SDH7Q04401 133 aa2.28□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W GCN3P14741 305 aa2.28□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W PTM1P32857 523 aa2.28□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W YNL208WP40159 199 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W SNM1P40993 198 aa2.28□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W GWT1P47026 490 aa2.28□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W NUP49Q02199 472 aa2.28□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W SEI1Q06058 285 aa2.28□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W YPR014CQ6B0W2 109 aa2.28□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W YMR105W-AQ8TGS8 64 aa2.28□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W GIT1P25346 518 aa2.27□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W LDS1P31379 325 aa2.27□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W WWM1P43582 211 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W BAT2P47176 376 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W YMR181CQ03231 154 aa2.27□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W YMD8Q03697 442 aa2.27□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W GRE1Q08969 168 aa2.27□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W YHR212W-AP0CX91 67 aa2.27□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W YGL034CP53186 121 aa2.27□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W ATP23P53722 227 aa2.27□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W YPD1Q07688 167 aa2.27□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W GAT3Q07928 141 aa2.27□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W YBR056W-AI2HB52 66 aa2.27□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W YEL075CP39972 122 aa2.27□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W TIS11P47977 285 aa2.27□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W MPA43P53583 542 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W RFU1Q08003 200 aa2.27□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W PRM4Q12498 284 aa2.27□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W YCR024C-BQ3E7Z8 88 aa2.27□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W FUN26P31381 517 aa2.27□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W EMC5P40540 141 aa2.27□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W YNR066CP53752 436 aa2.27□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W SEC13Q04491 297 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W YTH1Q06102 208 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W ATG39Q06159 398 aa2.27□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W CRC1Q12289 327 aa2.27□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W MCK1P21965 375 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W MRPL20P22354 195 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W SCO1P23833 295 aa2.26□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W PDR17P53844 350 aa2.26□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W DYN3Q04949 312 aa2.26□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W RRT7Q07829 113 aa2.26□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W FIT3Q08907 204 aa2.26□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W SPS2P08459 502 aa2.26□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W SNF4P12904 322 aa2.26□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W GLR1P41921 483 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W MOG1P47123 218 aa2.26□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W NQM1P53228 333 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W DXO1Q06349 442 aa2.26□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W SLO1Q3E784 85 aa2.26□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W YBL112CQ3E7Y4 105 aa2.26□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W RPL25P04456 142 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
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