RNA–Protein interactions for RNA: YMR001C-A

YMR001C-A, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR001C-A, Length 231 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR001C-AYMR001C-A YOL013W-AP0C272 63 aaPredicted RBP-0.4□□□□□ -2.47
YMR001C-AYMR001C-A GCN3P14741 305 aa-0.4□□□□□ -2.47
YMR001C-AYMR001C-A YCR001WP25347 104 aa-0.4□□□□□ -2.47
YMR001C-AYMR001C-A ERG10P41338 398 aaKnown RBP-0.4□□□□□ -2.47
YMR001C-AYMR001C-A SBH2P52871 88 aa-0.4□□□□□ -2.47
YMR001C-AYMR001C-A SHH3Q04487 196 aa-0.4□□□□□ -2.47
YMR001C-AYMR001C-A YAR023CD6VPM8 179 aa-0.41□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A YPK2P18961 677 aa-0.41□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A ETR1P38071 380 aa-0.41□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A HMF1P40037 129 aaKnown RBP-0.41□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A ARP3P47117 449 aaKnown RBP-0.41□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A YNL033WP53964 284 aa-0.41□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A YDC1Q02896 317 aa-0.41□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A YMR099CQ03161 297 aaKnown RBP-0.41□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A RRP17Q04031 235 aaPredicted RBP-0.41□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A GGA1Q06336 557 aa-0.41□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A KEI1Q06346 221 aa-0.41□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A RRT8Q08219 342 aa-0.41□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A STF2P16965 84 aa-0.42□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A YCR023CP25351 611 aa-0.42□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A YBL010CP32788 280 aa-0.42□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A RIB7P33312 244 aa-0.42□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A BMH2P34730 273 aaKnown RBP-0.42□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A PAM17P36147 197 aa-0.42□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A YKR070WP36151 352 aaKnown RBP-0.42□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A YER134CP40081 178 aa-0.42□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A MGA1P53050 456 aa-0.42□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A UPS1Q05776 175 aa-0.42□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A RPL28P02406 149 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A MATALPHA1P0CY06 175 aa-0.43□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A HMLALPHA1P0CY07 175 aa-0.43□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A YGL235WP53071 178 aa-0.43□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A PDR17P53844 350 aa-0.43□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A YCR016WP25617 290 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A YUH1P35127 236 aa-0.44□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A MPM1P40364 252 aa-0.44□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A SER2P42941 309 aa-0.44□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A SNF4P12904 322 aa-0.45□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A YMR31P19955 123 aa-0.45□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A VMA6P32366 345 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A PTC1P35182 281 aa-0.45□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A AIM2P39721 246 aa-0.45□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A MDM32Q12171 622 aa-0.45□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A ADF1Q2V2Q1 113 aa-0.45□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A YLR422WQ06409 1932 aa-0.45□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A TIR1P10863 254 aa-0.46□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A MER1P16523 270 aa-0.46□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A MGT1P26188 188 aa-0.46□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A TRM5P38793 499 aa-0.46□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A MTW1P39731 289 aa-0.46□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A CUP9P41817 306 aa-0.46□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A SKI6P46948 246 aaPredicted RBP-0.46□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A IRC18P47056 224 aa-0.46□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A YKR005CQ02203 525 aa-0.46□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A PET117Q02771 107 aa-0.46□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A YMR253CQ04835 414 aa-0.46□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A THP2O13539 261 aaKnown RBP-0.47□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A CNB1P25296 175 aa-0.47□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A MSN4P33749 630 aa-0.47□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A MIC12P38341 106 aa-0.47□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A PDS1P40316 373 aaPredicted RBP-0.47□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A YLR307C-AQ3E825 87 aa-0.47□□□□□ -2.48
YMR001C-AYMR001C-A RIF1P29539 1916 aa-0.48□□□□□ -2.49
YMR001C-AYMR001C-A RHO1P06780 209 aaKnown RBP-0.48□□□□□ -2.49
YMR001C-AYMR001C-A RPL43AP0CX25 92 aaKnown RBP-0.48□□□□□ -2.49
YMR001C-AYMR001C-A RPL43BP0CX26 92 aa-0.48□□□□□ -2.49
YMR001C-AYMR001C-A IDP1P21954 428 aaKnown RBP-0.48□□□□□ -2.49
YMR001C-AYMR001C-A SHB17P36136 271 aaKnown RBP-0.48□□□□□ -2.49
YMR001C-AYMR001C-A YOR015WQ12169 119 aa-0.48□□□□□ -2.49
YMR001C-AYMR001C-A DGK1Q12382 290 aa-0.48□□□□□ -2.49
YMR001C-AYMR001C-A YMR030W-AQ3E760 96 aa-0.48□□□□□ -2.49
YMR001C-AYMR001C-A RPL24BP24000 155 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
YMR001C-AYMR001C-A ADO1P47143 340 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
YMR001C-AYMR001C-A FUS2Q05670 677 aa-0.49□□□□□ -2.49
YMR001C-AYMR001C-A TAO3P40468 2376 aa-0.5□□□□□ -2.49
YMR001C-AYMR001C-A SPC25P40014 221 aa-0.5□□□□□ -2.49
YMR001C-AYMR001C-A YGL230CP53074 147 aa-0.5□□□□□ -2.49
YMR001C-AYMR001C-A PIR1Q03178 341 aa-0.5□□□□□ -2.49
YMR001C-AYMR001C-A YOL014WQ08110 124 aa-0.5□□□□□ -2.49
YMR001C-AYMR001C-A YBR121C-AP0C5L4 52 aa-0.51□□□□□ -2.49
YMR001C-AYMR001C-A PRE1P22141 198 aaKnown RBP-0.51□□□□□ -2.49
YMR001C-AYMR001C-A YHP1Q04116 353 aa-0.51□□□□□ -2.49
YMR001C-AYMR001C-A NAT3Q06504 195 aa-0.51□□□□□ -2.49
YMR001C-AYMR001C-A YKL183C-AQ3E765 70 aa-0.51□□□□□ -2.49
YMR001C-AYMR001C-A BLM10P43583 2143 aa-0.52□□□□□ -2.49
YMR001C-AYMR001C-A MBF1O14467 151 aaKnown RBP-0.52□□□□□ -2.49
YMR001C-AYMR001C-A YLR157W-EP0CF00 54 aa-0.52□□□□□ -2.49
YMR001C-AYMR001C-A MAK31P23059 88 aa-0.52□□□□□ -2.49
YMR001C-AYMR001C-A PPA2P28239 310 aa-0.52□□□□□ -2.49
YMR001C-AYMR001C-A RTC3P38804 111 aaPredicted RBP-0.52□□□□□ -2.49
YMR001C-AYMR001C-A NSE4P43124 402 aa-0.52□□□□□ -2.49
YMR001C-AYMR001C-A YML100W-AQ8TGT0 57 aa-0.52□□□□□ -2.49
YMR001C-AYMR001C-A TAF14P35189 244 aa-0.53□□□□□ -2.49
YMR001C-AYMR001C-A YMR141CP40211 102 aa-0.53□□□□□ -2.49
YMR001C-AYMR001C-A GPI14P47088 403 aaKnown RBP-0.53□□□□□ -2.49
YMR001C-AYMR001C-A HHT1P61830 136 aa-0.53□□□□□ -2.49
YMR001C-AYMR001C-A YLR036CQ07986 203 aa-0.53□□□□□ -2.49
YMR001C-AYMR001C-A FCY1Q12178 158 aa-0.53□□□□□ -2.49
YMR001C-AYMR001C-A CCS1P40202 249 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
YMR001C-AYMR001C-A POG1P40473 351 aa-0.54□□□□□ -2.5
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 48.8 ms