RNA–Protein interactions for RNA: YHR063C

PAN5, Transcript of 2-dehydropantoate 2-reductase, yeastyeast

Gene PAN5, Length 1,140 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PAN5YHR063C JEN1P36035 616 aa2.81□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C GOS1P38736 223 aa2.81□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C IPT1P38954 527 aa2.81□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C KRE29P40026 464 aa2.81□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C PAM16P42949 149 aa2.81□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C BRR6P53062 197 aa2.81□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C PGA1P53896 198 aa2.81□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C DML1Q03652 475 aa2.81□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C MIX14Q04341 121 aa2.81□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C YPR127WQ06494 345 aa2.81□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C YOR289WQ12012 251 aaPredicted RBP2.81□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C YPR063CQ12160 140 aa2.81□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C MED11Q99278 115 aa2.81□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C KIN28P06242 306 aa2.8□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C YHR214C-DP0CX93 97 aa2.8□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C MDH2P22133 377 aa2.8□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C RNA15P25299 296 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C MDH3P32419 343 aaKnown RBP RIP-Chip data2.8□□□□□ -1.96not detected
PAN5YHR063C YBR063CP38083 404 aa2.8□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C MIC12P38341 106 aa2.8□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C ARN2P38724 620 aa2.8□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C SMB1P40018 196 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C RFC4P40339 323 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C SDC1Q03323 175 aa2.8□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C CTR3Q06686 241 aa2.8□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C COQ10Q08058 207 aa2.8□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C YOL024WQ08172 172 aa2.8□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C SME1Q12330 94 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C IES3Q12345 250 aa2.8□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C TEL1P38110 2787 aa2.8□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C YFR010W-AP0C5N0 62 aa2.79□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C IDP1P21954 428 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C ATG15P25641 520 aa2.79□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C EHD3P28817 500 aa2.79□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C ARO7P32178 256 aa2.79□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C VPH2P32341 215 aa2.79□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C CBT1P36038 271 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C ECM4P36156 370 aa2.79□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C RPS20P38701 121 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C ERG28P40030 148 aa2.79□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C YJR012CP47087 207 aa2.79□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C UFD1P53044 361 aa2.79□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C TPN1P53099 579 aa2.79□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C YGL101WP53144 215 aa2.79□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C NQM1P53228 333 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C ASI3P53983 676 aa2.79□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C NUP49Q02199 472 aa2.79□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C MAK3Q03503 176 aa2.79□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C YDR249CQ03787 373 aa2.79□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C DPP1Q05521 289 aa2.79□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C PEX30Q06169 523 aa2.79□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C YPR147CQ06522 304 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C GRE1Q08969 168 aa2.79□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C YOR032W-AQ8TGS1 66 aa2.79□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C Q0144Q9ZZW2 109 aa2.79□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C PRP8P33334 2413 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C YAL064W-BO13512 126 aa2.78□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C PET494P07390 489 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C STE18P18852 110 aa2.78□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C PHO80P20052 293 aa2.78□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C APA2P22108 325 aa2.78□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C IFM1P25038 676 aa2.78□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C QRI5P32344 111 aa2.78□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C SDH4P37298 181 aa2.78□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C MNN5P46982 586 aa2.78□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C TMA20P89886 181 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C YPL039WQ03080 316 aa2.78□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C YDR102CQ03864 110 aa2.78□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C YMR252CQ04814 134 aa2.78□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C IRC19Q07843 230 aa2.78□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C YKL183C-AQ3E765 70 aa2.78□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C YAL063C-AQ3E791 96 aa2.78□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C YHR214C-EQ8TGK0 99 aa2.78□□□□□ -1.96
PAN5YHR063C YMR31P19955 123 aa2.77□□□□□ -1.97
PAN5YHR063C PRE7P23724 241 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
PAN5YHR063C YCR025CP25352 136 aa2.77□□□□□ -1.97
PAN5YHR063C HOM6P31116 359 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
PAN5YHR063C ALK2P32789 676 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
PAN5YHR063C RIO2P40160 425 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
PAN5YHR063C YJL218WP40892 196 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
PAN5YHR063C ADO1P47143 340 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
PAN5YHR063C CWC23P52868 283 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
PAN5YHR063C SAY1P53324 424 aa2.77□□□□□ -1.97
PAN5YHR063C PET191Q02772 108 aa2.77□□□□□ -1.97
PAN5YHR063C ARC18Q05933 178 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
PAN5YHR063C ATG17Q06410 417 aa2.77□□□□□ -1.97
PAN5YHR063C SEC16P48415 2195 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
PAN5YHR063C MEC1P38111 2368 aa2.76□□□□□ -1.97
PAN5YHR063C IPP1P00817 287 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
PAN5YHR063C YBR121C-AP0C5L4 52 aa2.76□□□□□ -1.97
PAN5YHR063C MRPS28P21771 286 aa2.76□□□□□ -1.97
PAN5YHR063C COX15P40086 486 aa2.76□□□□□ -1.97
PAN5YHR063C YNL194CP40169 301 aa2.76□□□□□ -1.97
PAN5YHR063C YML018CQ03730 393 aa2.76□□□□□ -1.97
PAN5YHR063C NMA1Q06178 401 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
PAN5YHR063C LOA1Q06508 300 aa2.76□□□□□ -1.97
PAN5YHR063C HEM25Q07534 307 aa2.76□□□□□ -1.97
PAN5YHR063C NIP7Q08962 181 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
PAN5YHR063C YCT1Q12235 531 aa2.76□□□□□ -1.97
PAN5YHR063C YEL009C-AA0A023PZF2 135 aa2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 27.5 ms