RNA–Protein interactions for RNA: YGR215W

RSM27, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene RSM27, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RSM27	YGR215W	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	1.04	□□□□□ -2.24
RSM27	YGR215W	CBF1	P17106	351 aa		1.04	□□□□□ -2.24
RSM27	YGR215W	AIM2	P39721	246 aa		1.04	□□□□□ -2.24
RSM27	YGR215W	FUS2	Q05670	677 aa		1.04	□□□□□ -2.24
RSM27	YGR215W	YOL014W	Q08110	124 aa		1.04	□□□□□ -2.24
RSM27	YGR215W	COX8	P04039	78 aa		1.03	□□□□□ -2.24
RSM27	YGR215W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	1.03	□□□□□ -2.24
RSM27	YGR215W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	1.03	□□□□□ -2.24
RSM27	YGR215W	SER2	P42941	309 aa		1.03	□□□□□ -2.24
RSM27	YGR215W	YMR295C	Q03559	197 aa		1.03	□□□□□ -2.24
RSM27	YGR215W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	1.03	□□□□□ -2.24
RSM27	YGR215W	YER188C-A	P0C0V2	99 aa		1.02	□□□□□ -2.25
RSM27	YGR215W	CNB1	P25296	175 aa		1.02	□□□□□ -2.25
RSM27	YGR215W	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	1.02	□□□□□ -2.25
RSM27	YGR215W	RNH202	Q05635	350 aa		1.02	□□□□□ -2.25
RSM27	YGR215W	YAR023C	D6VPM8	179 aa		1.01	□□□□□ -2.25
RSM27	YGR215W	MRS1	P07266	363 aa		1.01	□□□□□ -2.25
RSM27	YGR215W	YER134C	P40081	178 aa		1.01	□□□□□ -2.25
RSM27	YGR215W	DAD4	P69851	72 aa		1.01	□□□□□ -2.25
RSM27	YGR215W	YPR013C	Q12145	317 aa		1.01	□□□□□ -2.25
RSM27	YGR215W	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		1.01	□□□□□ -2.25
RSM27	YGR215W	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		1	□□□□□ -2.25
RSM27	YGR215W	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		1	□□□□□ -2.25
RSM27	YGR215W	PAM17	P36147	197 aa		1	□□□□□ -2.25
RSM27	YGR215W	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	1	□□□□□ -2.25
RSM27	YGR215W	MMS2	P53152	137 aa		1	□□□□□ -2.25
RSM27	YGR215W	DYN3	Q04949	312 aa		1	□□□□□ -2.25
RSM27	YGR215W	YPK2	P18961	677 aa		0.99	□□□□□ -2.25
RSM27	YGR215W	RPB7	P34087	171 aa		0.99	□□□□□ -2.25
RSM27	YGR215W	MTW1	P39731	289 aa		0.99	□□□□□ -2.25
RSM27	YGR215W	HPA3	P39979	161 aa		0.99	□□□□□ -2.25
RSM27	YGR215W	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
RSM27	YGR215W	YLR460C	P54007	376 aa		0.99	□□□□□ -2.25
RSM27	YGR215W	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		0.99	□□□□□ -2.25
RSM27	YGR215W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	0.98	□□□□□ -2.25
RSM27	YGR215W	AIM36	Q03798	255 aa		0.98	□□□□□ -2.25
RSM27	YGR215W	UPS3	Q04006	179 aa		0.98	□□□□□ -2.25
RSM27	YGR215W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
RSM27	YGR215W	SHH3	Q04487	196 aa		0.97	□□□□□ -2.25
RSM27	YGR215W	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
RSM27	YGR215W	COA3	Q3E7B2	85 aa		0.97	□□□□□ -2.25
RSM27	YGR215W	IGO2	Q9P305	131 aa		0.97	□□□□□ -2.25
RSM27	YGR215W	STP22	P25604	385 aa		0.96	□□□□□ -2.26
RSM27	YGR215W	MGT1	P26188	188 aa		0.96	□□□□□ -2.26
RSM27	YGR215W	ARO7	P32178	256 aa		0.96	□□□□□ -2.26
RSM27	YGR215W	YNL033W	P53964	284 aa		0.96	□□□□□ -2.26
RSM27	YGR215W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	0.96	□□□□□ -2.26
RSM27	YGR215W	PHO85	P17157	305 aa		0.95	□□□□□ -2.26
RSM27	YGR215W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	0.95	□□□□□ -2.26
RSM27	YGR215W	CUP9	P41817	306 aa		0.95	□□□□□ -2.26
RSM27	YGR215W	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	0.95	□□□□□ -2.26
RSM27	YGR215W	YMR253C	Q04835	414 aa		0.95	□□□□□ -2.26
RSM27	YGR215W	YLR036C	Q07986	203 aa		0.95	□□□□□ -2.26
RSM27	YGR215W	TIR1	P10863	254 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RSM27	YGR215W	NTG1	P31378	399 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RSM27	YGR215W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
RSM27	YGR215W	UBC12	P52491	188 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RSM27	YGR215W	YNL184C	P53876	108 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RSM27	YGR215W	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
RSM27	YGR215W	NAT3	Q06504	195 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RSM27	YGR215W	SFK1	P35735	353 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RSM27	YGR215W	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
RSM27	YGR215W	MET31	Q03081	177 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RSM27	YGR215W	YLR031W	Q07978	186 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RSM27	YGR215W	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
RSM27	YGR215W	QCR7	P00128	127 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RSM27	YGR215W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
RSM27	YGR215W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	0.92	□□□□□ -2.26
RSM27	YGR215W	SNF4	P12904	322 aa		0.91	□□□□□ -2.26
RSM27	YGR215W	SPC25	P40014	221 aa		0.91	□□□□□ -2.26
RSM27	YGR215W	VPS71	Q03433	280 aa		0.91	□□□□□ -2.26
RSM27	YGR215W	YLR422W	Q06409	1932 aa		0.91	□□□□□ -2.26
RSM27	YGR215W	SEN2	P16658	377 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RSM27	YGR215W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
RSM27	YGR215W	YFL019C	P43576	117 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RSM27	YGR215W	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
RSM27	YGR215W	TDA4	P47153	279 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RSM27	YGR215W	ARO80	Q04052	950 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RSM27	YGR215W	YDR391C	Q04170	232 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RSM27	YGR215W	FYV12	Q08559	129 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RSM27	YGR215W	GET4	Q12125	312 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RSM27	YGR215W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RSM27	YGR215W	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
RSM27	YGR215W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	0.88	□□□□□ -2.27
RSM27	YGR215W	STF2	P16965	84 aa		0.87	□□□□□ -2.27
RSM27	YGR215W	YCR023C	P25351	611 aa		0.87	□□□□□ -2.27
RSM27	YGR215W	AHT1	P29589	182 aa		0.87	□□□□□ -2.27
RSM27	YGR215W	MRPL15	P36523	253 aa		0.87	□□□□□ -2.27
RSM27	YGR215W	FMP23	P38231	175 aa		0.87	□□□□□ -2.27
RSM27	YGR215W	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	0.87	□□□□□ -2.27
RSM27	YGR215W	SBH1	P52870	82 aa		0.87	□□□□□ -2.27
RSM27	YGR215W	PIR1	Q03178	341 aa		0.87	□□□□□ -2.27
RSM27	YGR215W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	0.87	□□□□□ -2.27
RSM27	YGR215W	LCL2	Q08045	131 aa		0.87	□□□□□ -2.27
RSM27	YGR215W	YOL024W	Q08172	172 aa		0.87	□□□□□ -2.27
RSM27	YGR215W	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
RSM27	YGR215W	RAD9	P14737	1309 aa		0.87	□□□□□ -2.27
RSM27	YGR215W	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
RSM27	YGR215W	TAR1	Q8TGM6	124 aa		0.86	□□□□□ -2.27
RSM27	YGR215W	TRX3	P25372	127 aa		0.85	□□□□□ -2.27

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