RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615025.4

TNS1-221, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TNS1, Length 6,488 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-221ENST00000615025 SLC18A3Q16572 532 aa11.47□□□□□ -0.57
TNS1-221ENST00000615025 ZNF484Q5JVG2 852 aa11.47□□□□□ -0.57
TNS1-221ENST00000615025 ARHGEF26Q96DR7 871 aa11.47□□□□□ -0.57
TNS1-221ENST00000615025 RUBCNLQ9H714 662 aa11.47□□□□□ -0.57
TNS1-221ENST00000615025 GPD1P21695 349 aa11.47□□□□□ -0.57
TNS1-221ENST00000615025 GGCXP38435 758 aa11.47□□□□□ -0.57
TNS1-221ENST00000615025 NPEPPSP55786 919 aa11.47□□□□□ -0.57
TNS1-221ENST00000615025 MAP3K10Q02779 954 aa11.47□□□□□ -0.57
TNS1-221ENST00000615025 PDCLQ13371 301 aa11.47□□□□□ -0.57
TNS1-221ENST00000615025 EDRF1Q3B7T1 1238 aa11.47□□□□□ -0.57
TNS1-221ENST00000615025 CHSY1Q86X52 802 aa11.47□□□□□ -0.57
TNS1-221ENST00000615025 CATSPER3Q86XQ3 398 aa11.47□□□□□ -0.57
TNS1-221ENST00000615025 ARRDC4Q8NCT1 418 aa11.47□□□□□ -0.57
TNS1-221ENST00000615025 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
TNS1-221ENST00000615025 LMTK2Q8IWU2 1503 aa11.47□□□□□ -0.57
TNS1-221ENST00000615025 GTF2H1P32780 548 aa11.47□□□□□ -0.57
TNS1-221ENST00000615025 ANTXR2P58335 489 aa11.47□□□□□ -0.57
TNS1-221ENST00000615025 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
TNS1-221ENST00000615025 BFSP2Q13515 415 aa11.47□□□□□ -0.57
TNS1-221ENST00000615025 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
TNS1-221ENST00000615025 GPAT2Q6NUI2 795 aa11.47□□□□□ -0.57
TNS1-221ENST00000615025 RGS9BPQ6ZS82 235 aa11.47□□□□□ -0.57
TNS1-221ENST00000615025 PTPRN2Q92932 1015 aa11.47□□□□□ -0.57
TNS1-221ENST00000615025 PALMDQ9NP74 551 aa11.47□□□□□ -0.57
TNS1-221ENST00000615025 HAUS5O94927 633 aa11.46□□□□□ -0.57
TNS1-221ENST00000615025 SRGNP10124 158 aa11.46□□□□□ -0.57
TNS1-221ENST00000615025 MMP14P50281 582 aa11.46□□□□□ -0.57
TNS1-221ENST00000615025 ARFIP2P53365 341 aa11.46□□□□□ -0.57
TNS1-221ENST00000615025 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
TNS1-221ENST00000615025 SLC25A41Q8N5S1 370 aa11.46□□□□□ -0.57
TNS1-221ENST00000615025 AGR3Q8TD06 166 aa11.46□□□□□ -0.57
TNS1-221ENST00000615025 KRT35Q92764 455 aa11.46□□□□□ -0.57
TNS1-221ENST00000615025 ZDHHC15Q96MV8 337 aa11.46□□□□□ -0.57
TNS1-221ENST00000615025 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
TNS1-221ENST00000615025 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
TNS1-221ENST00000615025 PGK2P07205 417 aa11.46□□□□□ -0.57
TNS1-221ENST00000615025 ETFBP38117 255 aa11.46□□□□□ -0.57
TNS1-221ENST00000615025 PPP2R2AP63151 447 aa11.46□□□□□ -0.57
TNS1-221ENST00000615025 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
TNS1-221ENST00000615025 FBXO28Q9NVF7 368 aa11.46□□□□□ -0.57
TNS1-221ENST00000615025 TBX20Q9UMR3 447 aa11.46□□□□□ -0.57
TNS1-221ENST00000615025 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa11.46□□□□□ -0.57
TNS1-221ENST00000615025 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
TNS1-221ENST00000615025 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
TNS1-221ENST00000615025 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
TNS1-221ENST00000615025 GALCP54803 685 aa11.46□□□□□ -0.57
TNS1-221ENST00000615025 GRIN1Q05586 938 aa11.46□□□□□ -0.57
TNS1-221ENST00000615025 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
TNS1-221ENST00000615025 OOSP2Q86WS3 158 aa11.46□□□□□ -0.57
TNS1-221ENST00000615025 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa11.46□□□□□ -0.57
TNS1-221ENST00000615025 CCDC78A2IDD5 438 aa11.46□□□□□ -0.58
TNS1-221ENST00000615025 H0Y626 953 aa11.46□□□□□ -0.58
TNS1-221ENST00000615025 FGFR4P22455 802 aa11.46□□□□□ -0.58
TNS1-221ENST00000615025 E2F4Q16254 413 aa11.46□□□□□ -0.58
TNS1-221ENST00000615025 COBLL1Q53SF7 1204 aa11.46□□□□□ -0.58
TNS1-221ENST00000615025 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.58
TNS1-221ENST00000615025 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.58
TNS1-221ENST00000615025 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.58
TNS1-221ENST00000615025 SENP2Q9HC62 589 aa11.46□□□□□ -0.58
TNS1-221ENST00000615025 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.58
TNS1-221ENST00000615025 RAB6BQ9NRW1 208 aa11.46□□□□□ -0.58
TNS1-221ENST00000615025 AMACRQ9UHK6 382 aa11.46□□□□□ -0.58
TNS1-221ENST00000615025 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.58
TNS1-221ENST00000615025 PDK1Q15118 436 aa11.46□□□□□ -0.58
TNS1-221ENST00000615025 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.58
TNS1-221ENST00000615025 C1orf146Q5VVC0 180 aa11.46□□□□□ -0.58
TNS1-221ENST00000615025 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa11.46□□□□□ -0.58
TNS1-221ENST00000615025 KIRREL3Q8IZU9 778 aa11.46□□□□□ -0.58
TNS1-221ENST00000615025 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa11.46□□□□□ -0.58
TNS1-221ENST00000615025 OPTNQ96CV9 577 aa11.46□□□□□ -0.58
TNS1-221ENST00000615025 PI4K2AQ9BTU6 479 aa11.46□□□□□ -0.58
TNS1-221ENST00000615025 FHOD1Q9Y613 1164 aa11.46□□□□□ -0.58
TNS1-221ENST00000615025 MSH4O15457 936 aa11.45□□□□□ -0.58
TNS1-221ENST00000615025 HOXA2O43364 376 aa11.45□□□□□ -0.58
TNS1-221ENST00000615025 STK4Q13043 487 aa11.45□□□□□ -0.58
TNS1-221ENST00000615025 TRIM60Q495X7 471 aa11.45□□□□□ -0.58
TNS1-221ENST00000615025 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa11.45□□□□□ -0.58
TNS1-221ENST00000615025 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
TNS1-221ENST00000615025 ACER1Q8TDN7 264 aa11.45□□□□□ -0.58
TNS1-221ENST00000615025 C17orf75Q9HAS0 396 aa11.45□□□□□ -0.58
TNS1-221ENST00000615025 LATS2Q9NRM7 1088 aa11.45□□□□□ -0.58
TNS1-221ENST00000615025 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa11.45□□□□□ -0.58
TNS1-221ENST00000615025 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa11.45□□□□□ -0.58
TNS1-221ENST00000615025 KRT87PA6NCN2 255 aa11.45□□□□□ -0.58
TNS1-221ENST00000615025 CDH18Q13634 790 aa11.45□□□□□ -0.58
TNS1-221ENST00000615025 SPDYAQ5MJ70 313 aa11.45□□□□□ -0.58
TNS1-221ENST00000615025 CCDC90BQ9GZT6 254 aa11.45□□□□□ -0.58
TNS1-221ENST00000615025 GIMAP4Q9NUV9 329 aa11.45□□□□□ -0.58
TNS1-221ENST00000615025 CFAP99D6REC4 459 aa11.45□□□□□ -0.58
TNS1-221ENST00000615025 FOXP2O15409 715 aa11.45□□□□□ -0.58
TNS1-221ENST00000615025 BRD2P25440 801 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
TNS1-221ENST00000615025 STAT4Q14765 748 aa11.45□□□□□ -0.58
TNS1-221ENST00000615025 PDIA6Q15084 440 aa11.45□□□□□ -0.58
TNS1-221ENST00000615025 KIZQ2M2Z5 673 aa11.45□□□□□ -0.58
TNS1-221ENST00000615025 CCDC144BQ3MJ40 725 aa11.45□□□□□ -0.58
TNS1-221ENST00000615025 DPF3Q92784 378 aa11.45□□□□□ -0.58
TNS1-221ENST00000615025 RRAGCQ9HB90 399 aa11.45□□□□□ -0.58
TNS1-221ENST00000615025 CPA4Q9UI42 421 aa11.45□□□□□ -0.58
TNS1-221ENST00000615025 PTPRMP28827 1452 aa11.45□□□□□ -0.58
TNS1-221ENST00000615025 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms