RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	ARL8A	Q96BM9	186 aa		5.49	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	TEPSIN	Q96N21	525 aa		5.49	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		5.49	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		5.49	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	EPC1	Q9H2F5	836 aa		5.49	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	BCO1	Q9HAY6	547 aa		5.49	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		5.49	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		5.49	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	TNN	Q9UQP3	1299 aa		5.49	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		5.49	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		5.49	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	LRRC37A3	O60309	1634 aa		5.48	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	MRC1	P22897	1456 aa		5.48	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	NRP1	O14786	923 aa		5.48	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	FOXS1	O43638	330 aa		5.48	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	ENDOD1	O94919	500 aa		5.48	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	GAST	P01350	101 aa		5.48	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	HOXB7	P09629	217 aa		5.48	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	SYN1	P17600	705 aa		5.48	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	CRHR1	P34998	444 aa		5.48	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	GRM7	Q14831	915 aa		5.48	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	LILRA6	Q6PI73	481 aa		5.48	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	USP45	Q70EL2	814 aa		5.48	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		5.48	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		5.48	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	FUK	Q8N0W3	1084 aa		5.48	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		5.48	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	NELFA	Q9H3P2	528 aa		5.48	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		5.48	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		5.48	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	RGS12	O14924	1447 aa		5.48	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	PALLD	Q8WX93	1383 aa		5.47	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	AMY1A	P04745	511 aa		5.47	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	MYB	P10242	640 aa		5.47	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	TRIM27	P14373	513 aa		5.47	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	MYL6B	P14649	208 aa		5.47	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	GZMK	P49863	264 aa		5.47	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	FOXL1	Q12952	345 aa		5.47	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		5.47	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		5.47	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		5.47	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	COPS6	Q7L5N1	327 aa		5.47	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		5.47	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	PRR18	Q8N4B5	295 aa		5.47	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		5.47	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	HPS3	Q969F9	1004 aa		5.47	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	IL17RA	Q96F46	866 aa		5.47	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	CEP95	Q96GE4	821 aa		5.47	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	BDH2	Q9BUT1	245 aa		5.47	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	STK31	Q9BXU1	1019 aa		5.47	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	5.47	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		5.47	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		5.46	□□□□□ -1.53
LINS1-210	ENST00000560934	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		5.46	□□□□□ -1.54
LINS1-210	ENST00000560934	PLSCR1	O15162	318 aa		5.46	□□□□□ -1.54
LINS1-210	ENST00000560934	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
LINS1-210	ENST00000560934	OFD1	O75665	1012 aa		5.46	□□□□□ -1.54
LINS1-210	ENST00000560934	STARD3NL	O95772	234 aa		5.46	□□□□□ -1.54
LINS1-210	ENST00000560934	HSPA6	P17066	643 aa		5.46	□□□□□ -1.54
LINS1-210	ENST00000560934	FPR1	P21462	350 aa		5.46	□□□□□ -1.54
LINS1-210	ENST00000560934	DSC2	Q02487	901 aa		5.46	□□□□□ -1.54
LINS1-210	ENST00000560934	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
LINS1-210	ENST00000560934	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	5.46	□□□□□ -1.54
LINS1-210	ENST00000560934	GTF2H3	Q13889	308 aa		5.46	□□□□□ -1.54
LINS1-210	ENST00000560934	TXNRD1	Q16881	649 aa		5.46	□□□□□ -1.54
LINS1-210	ENST00000560934	FBLN7	Q53RD9	439 aa		5.46	□□□□□ -1.54
LINS1-210	ENST00000560934	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		5.46	□□□□□ -1.54
LINS1-210	ENST00000560934	ANKS6	Q68DC2	871 aa		5.46	□□□□□ -1.54
LINS1-210	ENST00000560934	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
LINS1-210	ENST00000560934	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		5.46	□□□□□ -1.54
LINS1-210	ENST00000560934	SMIM5	Q71RC9	77 aa		5.46	□□□□□ -1.54
LINS1-210	ENST00000560934	RSPH3	Q86UC2	560 aa		5.46	□□□□□ -1.54
LINS1-210	ENST00000560934	XYLT1	Q86Y38	959 aa		5.46	□□□□□ -1.54
LINS1-210	ENST00000560934	DRC7	Q8IY82	874 aa		5.46	□□□□□ -1.54
LINS1-210	ENST00000560934	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		5.46	□□□□□ -1.54
LINS1-210	ENST00000560934	TTC8	Q8TAM2	541 aa		5.46	□□□□□ -1.54
LINS1-210	ENST00000560934	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		5.46	□□□□□ -1.54
LINS1-210	ENST00000560934	MVB12A	Q96EY5	273 aa		5.46	□□□□□ -1.54

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.4 ms