RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555516.6

TRIP11-204, Transcript of thyroid hormone receptor interactor 11, human

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene TRIP11, Length 564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRIP11-204	ENST00000555516	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TRIP11-204	ENST00000555516	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TRIP11-204	ENST00000555516	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TRIP11-204	ENST00000555516	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRIP11-204	ENST00000555516	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRIP11-204	ENST00000555516	PDPR	Q8NCN5	879 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRIP11-204	ENST00000555516	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRIP11-204	ENST00000555516	SNX19	Q92543	992 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRIP11-204	ENST00000555516	RAB24	Q969Q5	203 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRIP11-204	ENST00000555516	PBK	Q96KB5	322 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRIP11-204	ENST00000555516	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRIP11-204	ENST00000555516	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRIP11-204	ENST00000555516	KLC4	Q9NSK0	619 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRIP11-204	ENST00000555516	INTU	Q9ULD6	942 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRIP11-204	ENST00000555516	IPP	Q9Y573	584 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRIP11-204	ENST00000555516	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TRIP11-204	ENST00000555516	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TRIP11-204	ENST00000555516	DRD4	P21917	467 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRIP11-204	ENST00000555516	ITIH3	Q06033	890 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRIP11-204	ENST00000555516	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TRIP11-204	ENST00000555516	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TRIP11-204	ENST00000555516	POC1B	Q8TC44	478 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRIP11-204	ENST00000555516	TMX3	Q96JJ7	454 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRIP11-204	ENST00000555516	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRIP11-204	ENST00000555516	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TRIP11-204	ENST00000555516	EDNRB	P24530	442 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRIP11-204	ENST00000555516	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TRIP11-204	ENST00000555516	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TRIP11-204	ENST00000555516	TLE1	Q04724	770 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRIP11-204	ENST00000555516	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TRIP11-204	ENST00000555516	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRIP11-204	ENST00000555516	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TRIP11-204	ENST00000555516	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRIP11-204	ENST00000555516	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TRIP11-204	ENST00000555516	HAPLN3	Q96S86	360 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRIP11-204	ENST00000555516	TDP1	Q9NUW8	608 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRIP11-204	ENST00000555516	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRIP11-204	ENST00000555516	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRIP11-204	ENST00000555516	CD1A	P06126	327 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRIP11-204	ENST00000555516	RHO	P08100	348 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRIP11-204	ENST00000555516	PIGF	Q07326	219 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRIP11-204	ENST00000555516	ZNF626	Q68DY1	528 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRIP11-204	ENST00000555516	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRIP11-204	ENST00000555516	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRIP11-204	ENST00000555516	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRIP11-204	ENST00000555516	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRIP11-204	ENST00000555516	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRIP11-204	ENST00000555516	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRIP11-204	ENST00000555516	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRIP11-204	ENST00000555516	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRIP11-204	ENST00000555516	ETAA1	Q9NY74	926 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRIP11-204	ENST00000555516	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRIP11-204	ENST00000555516	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRIP11-204	ENST00000555516	ANXA1	P04083	346 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRIP11-204	ENST00000555516	PRR35	P0CG20	571 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRIP11-204	ENST00000555516	NPTX2	P47972	431 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRIP11-204	ENST00000555516	TCF15	Q12870	199 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRIP11-204	ENST00000555516	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TRIP11-204	ENST00000555516	RAB39A	Q14964	217 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRIP11-204	ENST00000555516	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
TRIP11-204	ENST00000555516	MTX3	Q5HYI7	312 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRIP11-204	ENST00000555516	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRIP11-204	ENST00000555516	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRIP11-204	ENST00000555516	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
TRIP11-204	ENST00000555516	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRIP11-204	ENST00000555516	REPS1	Q96D71	796 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRIP11-204	ENST00000555516	ALG8	Q9BVK2	526 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRIP11-204	ENST00000555516	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TRIP11-204	ENST00000555516	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRIP11-204	ENST00000555516	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TRIP11-204	ENST00000555516	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRIP11-204	ENST00000555516	HMGXB3	Q12766	1538 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRIP11-204	ENST00000555516	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TRIP11-204	ENST00000555516	TARM1	B6A8C7	271 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRIP11-204	ENST00000555516	TOR1B	O14657	336 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRIP11-204	ENST00000555516	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRIP11-204	ENST00000555516	NDUFS2	O75306	463 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRIP11-204	ENST00000555516	C5AR1	P21730	350 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRIP11-204	ENST00000555516	HSD3B2	P26439	372 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRIP11-204	ENST00000555516	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRIP11-204	ENST00000555516	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRIP11-204	ENST00000555516	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRIP11-204	ENST00000555516	NEK8	Q86SG6	692 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRIP11-204	ENST00000555516	JADE3	Q92613	823 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRIP11-204	ENST00000555516	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRIP11-204	ENST00000555516	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRIP11-204	ENST00000555516	PADI4	Q9UM07	663 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRIP11-204	ENST00000555516	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRIP11-204	ENST00000555516	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRIP11-204	ENST00000555516	SMARCA2	P51531	1590 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRIP11-204	ENST00000555516	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRIP11-204	ENST00000555516	NES	P48681	1621 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRIP11-204	ENST00000555516	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRIP11-204	ENST00000555516	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TRIP11-204	ENST00000555516	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRIP11-204	ENST00000555516		A0A0B4J269	797 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRIP11-204	ENST00000555516	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRIP11-204	ENST00000555516	ZNF213	O14771	459 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRIP11-204	ENST00000555516	JUP	P14923	745 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRIP11-204	ENST00000555516	RGS19	P49795	217 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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