RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550734.5

CS-221, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-221ENST00000550734 ZNF720Q7Z2F6 126 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 HSCBQ8IWL3 235 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 CD302Q8IX05 232 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 ZNF461Q8TAF7 563 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 OLFML3Q9NRN5 406 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 FOXD4L1Q9NU39 408 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 GMEB2Q9UKD1 530 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 USP18Q9UMW8 372 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 FRMD3A2A2Y4 597 aa12.52□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 MYMKA6NI61 221 aa12.52□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 PODXLO00592 558 aa12.52□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 SPTLC2O15270 562 aa12.52□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 CEBPBP17676 345 aa12.52□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 TKTP29401 623 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 NMT1P30419 496 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 LRPAP1P30533 357 aa12.52□□□□□ -0.41
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CS-221ENST00000550734 ATL3Q6DD88 541 aa12.52□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 LAIR1Q6GTX8 287 aa12.52□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 SLFN12LQ6IEE8 588 aa12.52□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 TCEAL8Q8IYN2 117 aa12.52□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 DDX12PQ92771 950 aa12.52□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 BICD1Q96G01 975 aa12.52□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 SUSD3Q96L08 255 aa12.52□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 A0A087X0B3 334 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 WDR27A2RRH5 827 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 SLC30A4O14863 429 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 RETP07949 1114 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 CXCL8P10145 99 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 HARSP12081 509 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 ATF2P15336 505 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 PAX3P23760 479 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP12.51□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 ROR1Q01973 937 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 PPP2R3AQ06190 1150 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 SPEM2Q0P670 501 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 PPP2R5DQ14738 602 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 STK38Q15208 465 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 SEZ6Q53EL9 994 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 SFR1Q86XK3 245 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 NETO1Q8TDF5 533 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 IRF7Q92985 503 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 ASB16Q96NS5 453 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 MSTO1Q9BUK6 570 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 CUEDC2Q9H467 287 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 ASB7Q9H672 318 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 BRD9Q9H8M2 597 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 ZFP14Q9HCL3 533 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 DERAQ9Y315 318 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 LACTBL1A8MY62 500 aa12.5□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 M0QZQ0 153 aa12.5□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 ZNF197O14709 1029 aa12.5□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 XPOTO43592 962 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 CUTAO60888 179 aa12.5□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 F13A1P00488 732 aa12.5□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 LRG1P02750 347 aa12.5□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 PSMC3P17980 439 aa12.5□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 TNFSF9P41273 254 aa12.5□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 CCR2P41597 374 aa12.5□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP12.5□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 BRCC3P46736 316 aa12.5□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 CCR3P51677 355 aa12.5□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 ALCAMQ13740 583 aa12.5□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 GRM2Q14416 872 aa12.5□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 POSTNQ15063 836 aa12.5□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 E2F4Q16254 413 aa12.5□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 SPATA1Q5VX52 437 aa12.5□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 CNNM4Q6P4Q7 775 aa12.5□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 DYMQ7RTS9 669 aa12.5□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 APPL2Q8NEU8 664 aa12.5□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 FAM3CQ92520 227 aa12.5□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 TCEAL4Q96EI5 215 aa12.5□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 LRRC27Q9C0I9 530 aa12.5□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 ZHX3Q9H4I2 956 aa12.5□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 LMAN1LQ9HAT1 526 aa12.5□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 TRPV4Q9HBA0 871 aa12.5□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 KBTBD4Q9NVX7 518 aa12.5□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 RAB23Q9ULC3 237 aa12.5□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 MAFFQ9ULX9 164 aa12.5□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
CS-221ENST00000550734 NUB1Q9Y5A7 615 aa12.5□□□□□ -0.41
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