RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550188.1

ARFGAP1-223, Transcript of ADP ribosylation factor GTPase activating protein 1, human

TSL 5

Gene ARFGAP1, Length 572 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARFGAP1-223	ENST00000550188	RBP5	P82980	135 aa		12.88	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	CYP24A1	Q07973	514 aa		12.88	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	PSMD6	Q15008	389 aa		12.88	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		12.88	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		12.88	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	METTL23	Q86XA0	190 aa		12.88	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		12.88	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		12.88	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	RDH13	Q8NBN7	331 aa		12.88	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	FNBP1	Q96RU3	617 aa		12.88	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	CGRRF1	Q99675	332 aa		12.88	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	RMND1	Q9NWS8	449 aa		12.88	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		12.88	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		12.88	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	CIT	O14578	2027 aa		12.88	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	PTPRJ	Q12913	1337 aa		12.88	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	NR3C1	P04150	777 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	BFSP1	Q12934	665 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	MYO1E	Q12965	1108 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	PNOC	Q13519	176 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	MYBPC2	Q14324	1141 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	NFKBIB	Q15653	356 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	CXorf38	Q8TB03	319 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	DMAC2	Q9NW81	257 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	SIX4	Q9UIU6	781 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	POLI	Q9UNA4	740 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	MUC3A	Q02505	3323 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	CCL16	O15467	120 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	LRG1	P02750	347 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	TNNI1	P19237	187 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	ADCY1	Q08828	1119 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	WSCD1	Q658N2	575 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	BORCS6	Q96GS4	357 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	FAM84A	Q96KN4	292 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	GSDMA	Q96QA5	445 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	12.86	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	PLXNA3	P51805	1871 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	HUS1	O60921	280 aa		12.85	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	SEC24A	O95486	1093 aa		12.85	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	OR4Q2	P0C623	313 aa		12.85	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	GPR17	Q13304	367 aa		12.85	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	NFIL3	Q16649	462 aa		12.85	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	PTPN21	Q16825	1174 aa		12.85	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		12.85	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		12.85	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		12.85	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	ELMOD1	Q8N336	334 aa		12.85	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		12.85	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	SPATA20	Q8TB22	786 aa		12.85	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	SMARCE1	Q969G3	411 aa		12.85	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	HPDL	Q96IR7	371 aa		12.85	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		12.85	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		12.85	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		12.85	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		12.85	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		12.85	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	VWA8	A3KMH1	1905 aa		12.85	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	FSHR	P23945	695 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	NR2F2	P24468	414 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	AP3M2	P53677	418 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	PLD1	Q13393	1074 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	SPATA18	Q8TC71	538 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	GPT2	Q8TD30	523 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ARFGAP1-223	ENST00000550188	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35

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