RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527449.1

RBM25-206, Transcript of RNA binding motif protein 25, human

TSL 1 (best)

Gene RBM25, Length 3,469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM25-206	ENST00000527449	OSER1	Q9NX31	292 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	SUN2	Q9UH99	717 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	RIPK2	O43353	540 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	B4GALT4	O60513	344 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	ERLIN2	O94905	339 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	ASMTL	O95671	621 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	AR	P10275	920 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	TMOD1	P28289	359 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	CA8	P35219	290 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	AFM	P43652	599 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	ASPA	P45381	313 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	NOMO3	P69849	1222 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	BNIP1	Q12981	228 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	SEMA3B	Q13214	749 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	TRADD	Q15628	312 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	PARP6	Q2NL67	630 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	TEX44	Q53QW1	395 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	NAA35	Q5VZE5	725 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	ZNF534	Q76KX8	674 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	BEND5	Q7L4P6	421 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	TTC30A	Q86WT1	665 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	APBB2	Q92870	758 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	CALML4	Q96GE6	196 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	SERPINB12	Q96P63	405 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	OLFM3	Q96PB7	478 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	NACC1	Q96RE7	527 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	AGPAT1	Q99943	283 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	PORCN	Q9H237	461 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	DERA	Q9Y315	318 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	NME7	Q9Y5B8	376 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449		A0A1B0GVG6	124 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	CAPN14	A8MX76	684 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	ZNF195	O14628	629 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	SRGAP2	O75044	1071 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	TOMM70	O94826	608 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	TGDS	O95455	350 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	AGT	P01019	485 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	MMP8	P22894	467 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	HOXC13	P31276	330 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	CAV1	Q03135	178 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	C2orf54	Q08AI8	447 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	UBE2S	Q16763	222 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	SLFN13	Q68D06	897 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	C16orf87	Q6PH81	154 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	RNF165	Q6ZSG1	346 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	TMEM110	Q86TL2	294 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	C7orf31	Q8N865	590 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	SPATA18	Q8TC71	538 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	VOPP1	Q96AW1	172 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RBM25-206	ENST00000527449	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		3.36	□□□□□ -1.87

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