RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515854.5

ATP2C1-223, Transcript of ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 1, human

TSL 4

Gene ATP2C1, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP2C1-223	ENST00000515854	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	C7orf31	Q8N865	590 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	COG1	Q8WTW3	980 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	HES6	Q96HZ4	224 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	PBK	Q96KB5	322 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	CAPNS2	Q96L46	248 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	SCLT1	Q96NL6	688 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	ACAP3	Q96P50	834 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	OSMR	Q99650	979 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	BCO2	Q9BYV7	579 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	RNF186	Q9NXI6	227 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	SIX4	Q9UIU6	781 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	COG5	Q9UP83	839 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	DERA	Q9Y315	318 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	C2CD2	Q9Y426	696 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	NPTXR	O95502	500 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	PGK1	P00558	417 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	CALCA	P01258	141 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	ITGB3	P05106	788 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	TUBB	P07437	444 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	CFH	P08603	1231 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	MYBL1	P10243	752 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	RARB	P10826	455 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	CD46	P15529	392 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	COL9A1	P20849	921 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	GNA15	P30679	374 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	CXCR5	P32302	372 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	PAFAH1B1	P43034	410 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	ASPA	P45381	313 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	NOMO3	P69849	1222 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	RBP5	P82980	135 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	CENPC	Q03188	943 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	TRIM32	Q13049	653 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZBTB6	Q15916	424 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZNF699	Q32M78	642 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	XKR4	Q5GH76	650 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	UBXN11	Q5T124	520 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	NOTUM	Q6P988	496 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	TMEM270	Q6UE05	265 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	PEX26	Q7Z412	305 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	DAAM2	Q86T65	1068 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	RPAIN	Q86UA6	219 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	SESTD1	Q86VW0	696 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	CAGE1	Q8TC20	777 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZNF653	Q96CK0	615 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	TRIM11	Q96F44	468 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	EPC1	Q9H2F5	836 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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