RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493427.1

ABCD4-215, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 4

Gene ABCD4, Length 736 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-215	ENST00000493427	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	LGMN	Q99538	433 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	BARHL2	Q9NY43	387 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	NFASC	O94856	1347 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	ARL5C	A6NH57	179 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	IFNAR1	P17181	557 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	P2RY2	P41231	377 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	NAPA	P54920	295 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	CLDN6	P56747	220 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	RTL10	Q7L3V2	364 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	ZFP42	Q96MM3	310 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	PNMA5	Q96PV4	448 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	CSRNP2	Q9H175	543 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427		A0A087WZ62	844 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	ADAMTS3	O15072	1205 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	MYO1E	Q12965	1108 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	PSMD2	Q13200	908 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	DRP2	Q13474	957 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	SMCO2	A6NFE2	343 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	PRRG1	O14668	218 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	NDUFV2	P19404	249 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	ADCY7	P51828	1080 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	BROX	Q5VW32	411 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	ERICH1	Q86X53	443 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	ESYT2	A0FGR8	921 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	DPYSL4	O14531	572 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	MAFG	O15525	162 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	SUV39H1	O43463	412 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	BRINP1	O60477	761 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	ITGA4	P13612	1032 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	TNFRSF8	P28908	595 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	STK3	Q13188	491 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	FBXO43	Q4G163	708 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	UBXN11	Q5T124	520 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	PGBD1	Q96JS3	809 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	CDC6	Q99741	560 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	RNF39	Q9H2S5	420 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	KIF4A	O95239	1232 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	DRD1	P21728	446 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	UCN	P55089	124 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	PLCB2	Q00722	1185 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	TLE1	Q04724	770 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	GRIK2	Q13002	908 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	PTPA	Q15257	358 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	ANO3	Q9BYT9	981 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	IL21R	Q9HBE5	538 aa		13.59	□□□□□ -0.23

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms