RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474181.1

UBE2Q1-203, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 2

Gene UBE2Q1, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-203ENST00000474181 MARCKSL1P49006 195 aa13.66□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 FCGRTP55899 365 aa13.66□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 BEX3Q00994 111 aa13.66□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 CRHR2Q13324 411 aa13.66□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 CUL1Q13616 776 aa13.66□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP13.66□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 SLC10A6Q3KNW5 377 aa13.66□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 DNAJC24Q6P3W2 148 aa13.66□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 C7orf31Q8N865 590 aa13.66□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 MAIP1Q8WWC4 291 aa13.66□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP13.66□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 KRT35Q92764 455 aa13.66□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 KAT2BQ92831 832 aa13.66□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 HPDLQ96IR7 371 aa13.66□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 RUNDC3BQ96NL0 473 aa13.66□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 OSMRQ99650 979 aa13.66□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 BCO2Q9BYV7 579 aa13.66□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 RAB17Q9H0T7 212 aa13.66□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa13.66□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 DPP3Q9NY33 737 aa13.66□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 SIX4Q9UIU6 781 aa13.66□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 PCDHGC3Q9UN70 934 aa13.66□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 DERAQ9Y315 318 aa13.66□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 HAS3O00219 553 aa13.65□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 PHF2O75151 1096 aa13.65□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 CFHP08603 1231 aa13.65□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 ITGA4P13612 1032 aa13.65□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 DARSP14868 501 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 CETN2P41208 172 aa13.65□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 SSR1P43307 286 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 PEX5P50542 639 aa13.65□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 TAP1Q03518 808 aa13.65□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 MYO1EQ12965 1108 aa13.65□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 SCARA3Q6AZY7 606 aa13.65□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa13.65□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 RUFY4Q6ZNE9 571 aa13.65□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 ERICH1Q86X53 443 aa13.65□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 BEST2Q8NFU1 509 aa13.65□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 FEZF2Q8TBJ5 459 aa13.65□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 WHAMMQ8TF30 809 aa13.65□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 DNAJB3Q8WWF6 145 aa13.65□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa13.65□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 CD101Q93033 1021 aa13.65□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 CAVIN3Q969G5 261 aa13.65□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa13.65□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 RUFY1Q96T51 708 aa13.65□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 SPC25Q9HBM1 224 aa13.65□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 MED4Q9NPJ6 270 aa13.65□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 FAM114A2Q9NRY5 505 aa13.65□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP13.65□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 IP6K2Q9UHH9 426 aa13.65□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 GJD2Q9UKL4 321 aa13.65□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 STRIP2Q9ULQ0 834 aa13.65□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 HPCAL4Q9UM19 191 aa13.65□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 NFU1Q9UMS0 254 aa13.65□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
UBE2Q1-203ENST00000474181 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa13.64□□□□□ -0.23
UBE2Q1-203ENST00000474181 ESYT3A0FGR9 886 aa13.64□□□□□ -0.23
UBE2Q1-203ENST00000474181 FAM187AA6NFU0 413 aa13.64□□□□□ -0.23
UBE2Q1-203ENST00000474181 TLR3O15455 904 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
UBE2Q1-203ENST00000474181 CA12O43570 354 aa13.64□□□□□ -0.23
UBE2Q1-203ENST00000474181 HSF2BPO75031 334 aa13.64□□□□□ -0.23
UBE2Q1-203ENST00000474181 GPR32O75388 356 aa13.64□□□□□ -0.23
UBE2Q1-203ENST00000474181 STAU1O95793 577 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
UBE2Q1-203ENST00000474181 MMP8P22894 467 aa13.64□□□□□ -0.23
UBE2Q1-203ENST00000474181 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
UBE2Q1-203ENST00000474181 CHRNA3P32297 505 aa13.64□□□□□ -0.23
UBE2Q1-203ENST00000474181 MAN1A1P33908 653 aa13.64□□□□□ -0.23
UBE2Q1-203ENST00000474181 CARSP49589 748 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
UBE2Q1-203ENST00000474181 DR1Q01658 176 aa13.64□□□□□ -0.23
UBE2Q1-203ENST00000474181 C2CD6Q53TS8 623 aa13.64□□□□□ -0.23
UBE2Q1-203ENST00000474181 DCUN1D2Q6PH85 259 aa13.64□□□□□ -0.23
UBE2Q1-203ENST00000474181 RHOT1Q8IXI2 618 aa13.64□□□□□ -0.23
UBE2Q1-203ENST00000474181 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa13.64□□□□□ -0.23
UBE2Q1-203ENST00000474181 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
UBE2Q1-203ENST00000474181 FAM71BQ8TC56 605 aa13.64□□□□□ -0.23
UBE2Q1-203ENST00000474181 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa13.64□□□□□ -0.23
UBE2Q1-203ENST00000474181 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
UBE2Q1-203ENST00000474181 SMYD3Q9H7B4 428 aa13.64□□□□□ -0.23
UBE2Q1-203ENST00000474181 VRTNQ9H8Y1 702 aa13.64□□□□□ -0.23
UBE2Q1-203ENST00000474181 SNTG2Q9NY99 539 aa13.64□□□□□ -0.23
UBE2Q1-203ENST00000474181 AMACRQ9UHK6 382 aa13.64□□□□□ -0.23
UBE2Q1-203ENST00000474181 USTQ9Y2C2 406 aa13.64□□□□□ -0.23
UBE2Q1-203ENST00000474181 PASKQ96RG2 1323 aa13.64□□□□□ -0.23
UBE2Q1-203ENST00000474181 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
UBE2Q1-203ENST00000474181 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
UBE2Q1-203ENST00000474181 M0QZ92 97 aa13.63□□□□□ -0.23
UBE2Q1-203ENST00000474181 TTI1O43156 1089 aa13.63□□□□□ -0.23
UBE2Q1-203ENST00000474181 PSTPIP1O43586 416 aa13.63□□□□□ -0.23
UBE2Q1-203ENST00000474181 XPOTO43592 962 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
UBE2Q1-203ENST00000474181 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
UBE2Q1-203ENST00000474181 ALDH1A1P00352 501 aa13.63□□□□□ -0.23
UBE2Q1-203ENST00000474181 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.1 ms