RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440016.6

HOXD-AS2-202, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 999 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ARPP19P56211 112 aa29.23■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CLDN10P78369 228 aa29.23■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 STIM1Q13586 685 aa29.23■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 OVOS1Q6IE37 1185 aa29.23■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TSG101Q99816 390 aa29.23■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CLSTN2Q9H4D0 955 aa29.23■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KIAA1468Q9P260 1216 aa29.23■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 WDR27A2RRH5 827 aa29.22■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RFPL2O75678 378 aa29.22■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 WEE2P0C1S8 567 aa29.22■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PPP1R2P41236 205 aa29.22■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PMS1P54277 932 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DLG4P78352 724 aa29.22■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ANKRD40Q6AI12 368 aa29.22■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TMC2Q8TDI7 906 aa29.22■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DSEQ9UL01 958 aa29.22■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TRIM49BA6NDI0 452 aa29.21■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PSMA7O14818 248 aa29.21■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CST3P01034 146 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MYO1EQ12965 1108 aa29.21■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GPR149Q86SP6 731 aa29.21■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FAM186BQ8IYM0 893 aa29.21■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ZNF461Q8TAF7 563 aa29.21■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 HPDLQ96IR7 371 aa29.21■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GDAP2Q9NXN4 497 aa29.21■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 C5orf42Q9H799 3197 aa29.2■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa29.2■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa29.2■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GOLGA6L22H0YM25 854 aa29.2■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CETN3O15182 167 aa29.2■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ZMYND10O75800 440 aa29.2■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ABLIM3O94929 683 aa29.2■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CCNE1P24864 410 aa29.2■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 AP3M2P53677 418 aa29.2■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LRRC63Q05C16 580 aa29.2■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LIN9Q5TKA1 542 aa29.2■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 WSCD1Q658N2 575 aa29.2■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa29.2■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 METTL23Q86XA0 190 aa29.2■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TRIML1Q8N9V2 468 aa29.2■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 EEF2KMTQ96G04 330 aa29.2■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RIPOR3Q96MK2 946 aa29.2■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa29.2■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PRKAG3Q9UGI9 489 aa29.2■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SNX9Q9Y5X1 595 aa29.2■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DENND4AQ7Z401 1863 aa29.2■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 OR6C75A6NL08 312 aa29.19■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PAPLNO95428 1278 aa29.19■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 C8AP07357 584 aa29.19■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CPB1P15086 417 aa29.19■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MTHFRP42898 656 aa29.19■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 VAMP7P51809 220 aa29.19■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ATAT1Q5SQI0 421 aa29.19■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MKNK1Q9BUB5 465 aa29.19■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 L1RE1Q9UN81 338 aa29.19■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 HUS1O60921 280 aa29.18■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 OR4Q2P0C623 313 aa29.18■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 BIRC3Q13489 604 aa29.18■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 C1orf220Q5T0J3 134 aa29.18■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TPGS2Q68CL5 300 aa29.18■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KLHL10Q6JEL2 608 aa29.18■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ADHFE1Q8IWW8 467 aa29.18■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SLC7A14Q8TBB6 771 aa29.18■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NECTIN4Q96NY8 510 aa29.18■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NUP62CLQ9H1M0 184 aa29.18■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PHACTR2O75167 634 aa29.17■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KRT13P13646 458 aa29.17■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ATF2P15336 505 aa29.17■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ZP2Q05996 745 aa29.17■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TRPC3Q13507 836 aa29.17■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PPM1LQ5SGD2 360 aa29.17■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PDCL2Q8N4E4 241 aa29.17■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 OR10T2Q8NGX3 314 aa29.17■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GPT2Q8TD30 523 aa29.17■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RTP3Q9BQQ7 232 aa29.17■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa29.17■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PRKD2Q9BZL6 878 aa29.17■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 POMKQ9H5K3 350 aa29.17■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 IKBKBO14920 756 aa29.16■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ENPEPQ07075 957 aa29.16■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 UVSSAQ2YD98 709 aa29.16■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CYP26C1Q6V0L0 522 aa29.16■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa29.16■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CCDC149Q6ZUS6 474 aa29.16■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 THEM5Q8N1Q8 247 aa29.16■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TOP6BLQ8N6T0 577 aa29.16■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NELFBQ8WX92 580 aa29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms