RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427644.1

LIMD1-AS1-201, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMD1-AS1, Length 1,536 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CD52P31358 61 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PDE6CP51160 858 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CDR2Q01850 454 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ELF2Q15723 593 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TRIM60Q495X7 471 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C1orf127Q8N9H9 656 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TPCN2Q8NHX9 752 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CXorf38Q8TB03 319 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TLR10Q9BXR5 811 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 THAP2Q9H0W7 228 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 XYLT2Q9H1B5 865 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ISCUQ9H1K1 167 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GOLPH3Q9H4A6 298 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 UBN1Q9NPG3 1134 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SNX12Q9UMY4 172 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 POLIQ9UNA4 740 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 JRKLQ9Y4A0 524 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SAR1BQ9Y6B6 198 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RTN2O75298 545 aa10.51□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FTLP02792 175 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CFHP08603 1231 aa10.51□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CLTBP09497 229 aa10.51□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RFC2P35250 354 aa10.51□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NOP2P46087 812 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TLE2Q04725 743 aa10.51□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FAAP100Q0VG06 881 aa10.51□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TRPC3Q13507 836 aa10.51□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TMEM132DQ14C87 1099 aa10.51□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa10.51□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa10.51□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LRRC57Q8N9N7 239 aa10.51□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ANKRD7Q92527 254 aa10.51□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SEPT8Q92599 483 aa10.51□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CAPZA3Q96KX2 299 aa10.51□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NIF3L1Q9GZT8 377 aa10.51□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 OSGEPQ9NPF4 335 aa10.51□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FAM105AQ9NUU6 356 aa10.51□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TMEM39AQ9NV64 488 aa10.51□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SNTG2Q9NY99 539 aa10.51□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PARP2Q9UGN5 583 aa10.51□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CNTN6Q9UQ52 1028 aa10.51□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C2CD2Q9Y426 696 aa10.51□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IPPQ9Y573 584 aa10.51□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa10.51□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TANC1Q9C0D5 1861 aa10.51□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SCN1AP35498 2009 aa10.5□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ANKRD62A6NC57 917 aa10.5□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RECQL4O94761 1208 aa10.5□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ITGB3P05106 788 aa10.5□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KRT19P08727 400 aa10.5□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ITGA4P13612 1032 aa10.5□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ASPAP45381 313 aa10.5□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZNF132P52740 706 aa10.5□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RBM10P98175 930 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PTPROQ16827 1216 aa10.5□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa10.5□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZNF699Q32M78 642 aa10.5□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TEX35Q5T0J7 233 aa10.5□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 UBXN11Q5T124 520 aa10.5□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MEI1Q5TIA1 1274 aa10.5□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TMEM270Q6UE05 265 aa10.5□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CEP112Q8N8E3 955 aa10.5□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SLC35G2Q8TBE7 412 aa10.5□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 COG1Q8WTW3 980 aa10.5□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RFFLQ8WZ73 363 aa10.5□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SNX27Q96L92 541 aa10.5□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MMS19Q96T76 1030 aa10.5□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PSMB7Q99436 277 aa10.5□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 EPC1Q9H2F5 836 aa10.5□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 COG5Q9UP83 839 aa10.5□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HYOU1Q9Y4L1 999 aa10.5□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HES2Q9Y543 173 aa10.5□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 A0A0U1RQF3 1178 aa10.49□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 EFCAB8A8MWE9 144 aa10.49□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZNF623O75123 536 aa10.49□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 WEE2P0C1S8 567 aa10.49□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GZMAP12544 262 aa10.49□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CD58P19256 250 aa10.49□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CXCR5P32302 372 aa10.49□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RAP1GAPP47736 663 aa10.49□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SMYD5Q6GMV2 418 aa10.49□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ACAD10Q6JQN1 1059 aa10.49□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TRAF7Q6Q0C0 670 aa10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms