RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384713.1

SNORD56B-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 56B, humanhuman

BASIC

Gene SNORD56B, Length 71 nt, Biotype snoRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD56B-201ENST00000384713 NIF3L1Q9GZT8 377 aa-0.08□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 CNNM2Q9H8M5 875 aa-0.08□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 KANSL2Q9H9L4 492 aa-0.08□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 SLC24A3Q9HC58 644 aa-0.08□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 KCNMB3Q9NPA1 279 aa-0.08□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 GPRC5CQ9NQ84 441 aa-0.08□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa-0.08□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 DECR2Q9NUI1 292 aa-0.08□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 TMEM74BQ9NUR3 256 aa-0.08□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 TMEM184CQ9NVA4 438 aa-0.08□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 ANAPC11Q9NYG5 84 aa-0.08□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 FAM30AQ9NZY2 134 aa-0.08□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 DNAJB11Q9UBS4 358 aa-0.08□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 FAM8A1Q9UBU6 413 aa-0.08□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 MAN1B1Q9UKM7 699 aa-0.08□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa-0.08□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 MAST4O15021 2626 aa-0.08□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 POM121CA8CG34 1229 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 C9IYK1 514 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 TMEM232C9JQI7 657 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 GIPC1O14908 333 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 PROM1O43490 865 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 TLR2O60603 784 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 B4GALT2O60909 372 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 NXPH3O95157 252 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 KCNH1O95259 989 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 F13A1P00488 732 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 IGKV1D-16P01601 117 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 FAM163BP0C2L3 166 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 P0C879 139 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 SRGNP10124 158 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 FGFR4P22455 802 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 AOAHP28039 575 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 MC4RP32245 332 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 CDKN1AP38936 164 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 CASRP41180 1078 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 ECI1P42126 302 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 PCYT1AP49585 367 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 LUMP51884 338 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 FMO1Q01740 532 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 DUSP2Q05923 314 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 ITIH3Q06033 890 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 MTX1Q13505 466 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 PTGR1Q14914 329 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 PLCB4Q15147 1175 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 PTPRRQ15256 657 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 CYP2A13Q16696 494 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 GEN1Q17RS7 908 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 WSCD2Q2TBF2 565 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 TMEM30BQ3MIR4 351 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 ANKRD39Q53RE8 183 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 SPDYCQ5MJ68 293 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 Q5PR19 223 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 SNAP47Q5SQN1 464 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 NUGGCQ68CJ6 796 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 ABHD17CQ6PCB6 329 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 LRSAM1Q6UWE0 723 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 NAPRTQ6XQN6 538 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 TRIM72Q6ZMU5 477 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 ZNF813Q6ZN06 617 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 TRILQ7L0X0 811 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 OTOP3Q7RTS5 596 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 C16orf82Q7Z2V1 217 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 PIP4P1Q86T03 277 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 TICAM1Q8IUC6 712 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 PPIL6Q8IXY8 311 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 ZNF440Q8IYI8 595 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 NLGN4XQ8N0W4 816 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 CNBD1Q8NA66 436 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 CADM4Q8NFZ8 388 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 TRIM58Q8NG06 486 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 OR5AN1Q8NGI8 311 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 OR2L2Q8NH16 312 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 CYP2W1Q8TAV3 490 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 SH3TC2Q8TF17 1288 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 STAG1Q8WVM7 1258 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 GATAD2BQ8WXI9 593 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 TMEM125Q96AQ2 219 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 ATG4CQ96DT6 458 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD56B-201ENST00000384713 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms