RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 CYP2C8P10632 490 aa21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 IL10P22301 178 aa21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 KCNJ1P48048 391 aa21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 CARSP49589 748 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 SNX17Q15036 470 aa21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 DCAF6Q58WW2 860 aa21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 PARP9Q8IXQ6 854 aa21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 DPEP1P16444 411 aa21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 DDX5P17844 614 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 ICA1LQ8NDH6 482 aa21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 ADAM33Q9BZ11 813 aa21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 KDM4CQ9H3R0 1056 aa21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 CALML6Q8TD86 181 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 USP33Q8TEY7 942 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 RAD23BP54727 409 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 OCA2Q04671 838 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 ZBTB17Q13105 803 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 RBBP7Q16576 425 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 ZDHHC15Q96MV8 337 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 UNC45AQ9H3U1 944 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 PCDHB8Q9UN66 801 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 KBTBD13C9JR72 458 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 NDUFS3O75489 264 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 KCNV2Q8TDN2 545 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 ARL8AQ96BM9 186 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 FAM129AQ9BZQ8 928 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 MRGBPQ9NV56 204 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 OGTO15294 1046 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 GRIN3BO60391 1043 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 POLBP06746 335 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 HMOX2P30519 316 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 EPC2Q52LR7 807 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM65Q6PJ69 517 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 ANGPT2O15123 496 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 SREBF1P36956 1147 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 COBLL1Q53SF7 1204 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 GNASQ5JWF2 1037 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 TTC30AQ86WT1 665 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 MFN1Q8IWA4 741 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 SAMD3Q8N6K7 520 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 SLC7A14Q8TBB6 771 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 KBTBD4Q9NVX7 518 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 KDSRQ06136 332 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 PTK7Q13308 1070 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 ACAD10Q6JQN1 1059 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 CERKQ8TCT0 537 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 ACER1Q8TDN7 264 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 RUSC1Q9BVN2 902 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 RUBCNLQ9H714 662 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 STK25O00506 426 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 TAF6P49848 677 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 CUL2Q13617 745 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 ICE2Q659A1 982 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 YY1AP1Q9H869 796 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 HPSEQ9Y251 543 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 FIGNQ5HY92 759 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 FNTAP49354 379 aa21.2■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 ITGA8P53708 1063 aa21.2■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 NFIAQ12857 509 aa21.2■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 RAB42Q8N4Z0 105 aa21.2■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 NUDT12Q9BQG2 462 aa21.2■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 A0A087X0T9 212 aa21.2■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 FAM228BP0C875 321 aa21.2■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 TTC30BQ8N4P2 665 aa21.2■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 UBA3Q8TBC4 463 aa21.2■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 FAM200BP0CF97 657 aa21.2■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 STIP1P31948 543 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 IL31Q6EBC2 164 aa21.2■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 MED24O75448 989 aa21.2■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 HMBSP08397 361 aa21.2■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 BRD2P25440 801 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms