RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356128.4

TRAPPC3L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3 like, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3L, Length 2,421 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SREBF1P36956 1147 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CASP2P42575 452 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MAPK9P45984 424 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 USP11P51784 963 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 OAZ1P54368 228 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SESN3P58005 492 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KARSQ15046 597 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IL17AQ16552 155 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ATAT1Q5SQI0 421 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HYIQ5T013 277 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MCTP2Q6DN12 878 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NCAPH2Q6IBW4 605 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PCDH19Q8TAB3 1148 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZFP42Q96MM3 310 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLC2A13Q96QE2 648 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MMP19Q99542 508 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MCMBPQ9BTE3 642 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PORCNQ9H237 461 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CYP39A1Q9NYL5 469 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 OTOFQ9HC10 1997 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 A0A087WWV3 80 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 A6NCN8 305 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BIN1O00499 593 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 AQP7O14520 342 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FCER1AP12319 257 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HSD17B4P51659 736 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CCNA1P78396 465 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DEFB115Q30KQ5 88 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CEP55Q53EZ4 464 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RESP18Q5W5W9 173 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SEPT14Q6ZU15 432 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C11orf74Q86VG3 221 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RIOX2Q8IUF8 465 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EGFL6Q8IUX8 553 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DRC7Q8IY82 874 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CEP57L1Q8IYX8 460 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CHST13Q8NET6 341 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF577Q9BSK1 485 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RAB34Q9BZG1 259 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 WDR11Q9BZH6 1224 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GPRC5CQ9NQ84 441 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PXMP2Q9NR77 195 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RRN3Q9NYV6 651 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FBXO40Q9UH90 709 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MYPNQ86TC9 1320 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 A0A1W2PQ27 194 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 A0A1W2PQ64 194 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 A0A1W2PQD8 194 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FAM187AA6NFU0 413 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LRRC10BA6NIK2 292 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LINC01387J3KSC0 135 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TM4SF5O14894 197 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 OFD1O75665 1012 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CNMDO75829 334 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLC25A27O95847 323 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ARP10275 920 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CCND2P30279 289 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 STAT6P42226 847 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PRIM2P49643 509 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C19orf57Q0VDD7 668 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DPY19L1Q2PZI1 675 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LRCH2Q5VUJ6 765 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PPP4R3AQ6IN85 833 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ANKRD23Q86SG2 305 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DPP9Q86TI2 863 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CABP7Q86V35 215 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CCDC103Q8IW40 242 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C4orf32Q8N8J7 132 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RNF214Q8ND24 703 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LMBR1Q8WVP7 490 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KIAA1191Q96A73 305 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP7□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LAD1O00515 517 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EDIL3O43854 480 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ITGA4P13612 1032 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HOXC12P31275 282 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LONP1P36776 959 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CYP4A11Q02928 519 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SEMA5AQ13591 1074 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PGM5Q15124 567 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KIAA0753Q2KHM9 967 aa7□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms