RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352068.5

SNX15-201, Transcript of sorting nexin 15, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SNX15, Length 771 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15-201ENST00000352068 P2RY2P41231 377 aa13.44□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 CLCNKBP51801 687 aa13.44□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 PLD1Q13393 1074 aa13.44□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 UPP1Q16831 310 aa13.44□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 GPR155Q7Z3F1 870 aa13.44□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa13.44□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 CCDC136Q96JN2 1154 aa13.44□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 PI4K2AQ9BTU6 479 aa13.44□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 NFKBIZQ9BYH8 718 aa13.44□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 FBXL5Q9UKA1 691 aa13.44□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 MYO16Q9Y6X6 1858 aa13.44□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 NOTCH2Q04721 2471 aa13.44□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa13.43□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 ESYT2A0FGR8 921 aa13.43□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 I3L4J1 428 aa13.43□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 B4GALT5O43286 388 aa13.43□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 ALDH1A2O94788 518 aa13.43□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 BRCC3P46736 316 aa13.43□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 QARSP47897 775 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 USP11P51784 963 aa13.43□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 EPHB3P54753 998 aa13.43□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 PSMD2Q13200 908 aa13.43□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 CAMK2BQ13554 666 aa13.43□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 NBR1Q14596 966 aa13.43□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 EMC2Q15006 297 aa13.43□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa13.43□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 GPR158Q5T848 1215 aa13.43□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 FAM181AQ8N9Y4 354 aa13.43□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 MDGA1Q8NFP4 955 aa13.43□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 GJA10Q969M2 543 aa13.43□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 ZMYND12Q9H0C1 365 aa13.43□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 IL25Q9H293 177 aa13.43□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 ATXN3LQ9H3M9 355 aa13.43□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 EBF3Q9H4W6 596 aa13.43□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 TBX20Q9UMR3 447 aa13.43□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 CEP192Q8TEP8 1941 aa13.43□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 ARID2Q68CP9 1835 aa13.42□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 TBX3O15119 743 aa13.42□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 GJB3O75712 270 aa13.42□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 RECQL4O94761 1208 aa13.42□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 PRAMEF12O95522 483 aa13.42□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 MCM5P33992 734 aa13.42□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 CYP4A11Q02928 519 aa13.42□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 FUT2Q10981 343 aa13.42□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 CTXN3Q4LDR2 81 aa13.42□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 PCSK4Q6UW60 755 aa13.42□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 GAREM2Q75VX8 874 aa13.42□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 MICU3Q86XE3 530 aa13.42□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 OR2I1PQ8NGU4 316 aa13.42□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 WBP1Q96G27 269 aa13.42□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 TBC1D32Q96NH3 1257 aa13.42□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 MTRQ99707 1265 aa13.42□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 CXCL16Q9H2A7 254 aa13.42□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 TASP1Q9H6P5 420 aa13.42□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 C6orf50Q9HD87 102 aa13.42□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 YIPF1Q9Y548 306 aa13.42□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 ASB3Q9Y575 518 aa13.42□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa13.42□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa13.42□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 B8ZZF3 427 aa13.41□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 ERVH48-1M5A8F1 160 aa13.41□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 RRP8O43159 456 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 CBFA2T3O75081 653 aa13.41□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa13.41□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 OTUD6AQ7L8S5 288 aa13.41□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 C3orf58Q8NDZ4 430 aa13.41□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 RLN3Q8WXF3 142 aa13.41□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 CD101Q93033 1021 aa13.41□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 DNAJC25Q9H1X3 360 aa13.41□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 OSBPL3Q9H4L5 887 aa13.41□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 FLNCQ14315 2725 aa13.41□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 TRIP11Q15643 1979 aa13.41□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa13.4□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 ADAMTS3O15072 1205 aa13.4□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 AP5Z1O43299 807 aa13.4□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 EDIL3O43854 480 aa13.4□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 DKK1O94907 266 aa13.4□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 GNA11P29992 359 aa13.4□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 GJA4P35212 333 aa13.4□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 CSRP3P50461 194 aa13.4□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 PTH1RQ03431 593 aa13.4□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 CAPSQ13938 189 aa13.4□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 CRY1Q16526 586 aa13.4□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 Q4G0T1 1027 aa13.4□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 TRIM68Q6AZZ1 485 aa13.4□□□□□ -0.26
SNX15-201ENST00000352068 ZNF280DQ6N043 979 aa13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms