RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325438.12

PACS2-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS2, Length 3,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2-201ENST00000325438 ETNPPLQ8TBG4 499 aa25.21■■□□□ 1.63
PACS2-201ENST00000325438 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
PACS2-201ENST00000325438 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
PACS2-201ENST00000325438 EXOC7Q9UPT5 735 aa25.21■■□□□ 1.63
PACS2-201ENST00000325438 LRRC42Q9Y546 428 aa25.21■■□□□ 1.63
PACS2-201ENST00000325438 NDUFB10O96000 172 aa25.21■■□□□ 1.63
PACS2-201ENST00000325438 GZMAP12544 262 aa25.21■■□□□ 1.63
PACS2-201ENST00000325438 ARL4CP56559 192 aa25.21■■□□□ 1.63
PACS2-201ENST00000325438 MAPK6Q16659 721 aa25.21■■□□□ 1.63
PACS2-201ENST00000325438 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
PACS2-201ENST00000325438 GORASP1Q9BQQ3 440 aa25.21■■□□□ 1.63
PACS2-201ENST00000325438 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
PACS2-201ENST00000325438 DBNDD1Q9H9R9 158 aa25.21■■□□□ 1.63
PACS2-201ENST00000325438 IFT122Q9HBG6 1241 aa25.21■■□□□ 1.63
PACS2-201ENST00000325438 SPOPLQ6IQ16 392 aa25.21■■□□□ 1.63
PACS2-201ENST00000325438 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
PACS2-201ENST00000325438 SEL1LQ9UBV2 794 aa25.21■■□□□ 1.63
PACS2-201ENST00000325438 TJP1Q07157 1748 aa25.21■■□□□ 1.63
PACS2-201ENST00000325438 A6NHS1 94 aa25.2■■□□□ 1.63
PACS2-201ENST00000325438 PSMD6Q15008 389 aa25.2■■□□□ 1.63
PACS2-201ENST00000325438 PLA2G4FQ68DD2 849 aa25.2■■□□□ 1.63
PACS2-201ENST00000325438 GALNT15Q8N3T1 639 aa25.2■■□□□ 1.63
PACS2-201ENST00000325438 EFCAB3Q8N7B9 438 aa25.2■■□□□ 1.63
PACS2-201ENST00000325438 WDR60Q8WVS4 1066 aa25.2■■□□□ 1.63
PACS2-201ENST00000325438 PAFAH2Q99487 392 aa25.2■■□□□ 1.63
PACS2-201ENST00000325438 TUBB6Q9BUF5 446 aa25.2■■□□□ 1.63
PACS2-201ENST00000325438 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 DENND3A2RUS2 1198 aa25.2■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 FSCN2O14926 492 aa25.2■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 ASMTLO95671 621 aa25.2■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 C1orf186Q6ZWK4 172 aa25.2■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 GLIS1Q8NBF1 620 aa25.2■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 KREMEN1Q96MU8 473 aa25.2■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 GSC2O15499 205 aa25.2■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 MAP3K6O95382 1288 aa25.2■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 MCL1Q07820 350 aa25.2■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 ASPHQ12797 758 aa25.2■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 ZFPM1Q8IX07 1006 aa25.2■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 POU5F2Q8N7G0 328 aa25.2■■□□□ 1.62
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PACS2-201ENST00000325438 KMT5AQ9NQR1 393 aa25.2■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 SENP1Q9P0U3 644 aa25.2■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 OAS1P00973 400 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 RFX1P22670 979 aa25.19■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 NEK3P51956 506 aa25.19■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 SOX10P56693 466 aa25.19■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 TRIP10Q15642 601 aa25.19■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 KCNT1Q5JUK3 1230 aa25.19■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 RFX6Q8HWS3 928 aa25.19■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 ATP11CQ8NB49 1132 aa25.19■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 PYDC1Q8WXC3 89 aa25.19■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 LAMB4A4D0S4 1761 aa25.19■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 PIK3CDO00329 1044 aa25.19■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 NT5C2P49902 561 aa25.19■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 SLC45A4Q5BKX6 768 aa25.19■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 DNAJC24Q6P3W2 148 aa25.19■■□□□ 1.62
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PACS2-201ENST00000325438 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 CCDC17Q96LX7 622 aa25.19■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 WDR11Q9BZH6 1224 aa25.19■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 CLIC5Q9NZA1 410 aa25.19■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 ZNF333Q96JL9 665 aa25.19■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 EPAS1Q99814 870 aa25.19■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 HERPUD2Q9BSE4 406 aa25.19■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 WFS1O76024 890 aa25.18■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 AMPD1P23109 780 aa25.18■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 MED21Q13503 144 aa25.18■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 PRKAG3Q9UGI9 489 aa25.18■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 E2F8A0AVK6 867 aa25.18■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 E7ENQ6 273 aa25.18■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 H7C0C1 242 aa25.18■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 ATP5OP48047 213 aa25.18■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 TAS2R40P59535 323 aa25.18■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 DSG1Q02413 1049 aa25.18■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 MMEL1Q495T6 779 aa25.18■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa25.18■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 ANKRD27Q96NW4 1050 aa25.18■■□□□ 1.62
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PACS2-201ENST00000325438 PTK7Q13308 1070 aa25.17■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 CEP55Q53EZ4 464 aa25.17■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 FBXO36Q8NEA4 188 aa25.17■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 SEMA4DQ92854 862 aa25.17■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 UNC45AQ9H3U1 944 aa25.17■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 NARFQ9UHQ1 456 aa25.17■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 PGM3O95394 542 aa25.17■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 PACSIN3Q9UKS6 424 aa25.17■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 TBX3O15119 743 aa25.17■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 GSTA2P09210 222 aa25.17■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 PYGBP11216 843 aa25.17■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 RINLQ6ZS11 566 aa25.17■■□□□ 1.62
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