RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 HUS1O60921 280 aa24■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 LILRB3O75022 631 aa24■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 AFPP02771 609 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 RPL17P18621 184 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 NRIP1P48552 1158 aa24■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 MYL7Q01449 175 aa24■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa24■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 GLYCTKQ8IVS8 523 aa24■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 FBXL13Q8NEE6 735 aa24■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 PPM1EQ8WY54 764 aa24■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 MMS19Q96T76 1030 aa24■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 PI4K2AQ9BTU6 479 aa24■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa24■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 IMPG2Q9BZV3 1241 aa24■■□□□ 1.43
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HOXD4-201ENST00000306324 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 COL6A3P12111 3177 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 STAU1O95793 577 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 CNPP09543 421 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 TYMPP19971 482 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 TNNC1P63316 161 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 NCAPHQ15003 741 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 TCP11X2Q5H9J9 407 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF667Q5HYK9 610 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 WSCD1Q658N2 575 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 METTL23Q86XA0 190 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 GPR65Q8IYL9 337 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 IGFLR1Q9H665 355 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 DSEQ9UL01 958 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 SMTNL1A8MU46 457 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 BECN2A8MW95 431 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 LRRN2O75325 713 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
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HOXD4-201ENST00000306324 CREMQ03060 361 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 CDKAL1Q5VV42 579 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 OVOS1Q6IE37 1185 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 SPOPLQ6IQ16 392 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC150Q8NCX0 1101 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 SEMA4DQ92854 862 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 KLHL5Q96PQ7 755 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 RXFP1Q9HBX9 757 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 RAB20Q9NX57 234 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 L1RE1Q9UN81 338 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 H7C4K7 107 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 TEX28O15482 410 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 ASS1P00966 412 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 CYP11A1P05108 521 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 KLRC2P26717 231 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP23.97■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 CETN1Q12798 172 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 MAN2A1Q16706 1144 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 CTXN3Q4LDR2 81 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF280DQ6N043 979 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 LRSAM1Q6UWE0 723 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 PDCL2Q8N4E4 241 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 TOP6BLQ8N6T0 577 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 TAF4BQ92750 862 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 VRTNQ9H8Y1 702 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 FNIP2Q9P278 1114 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 MTRRQ9UBK8 725 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 POLIQ9UNA4 740 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 BRWD1Q9NSI6 2320 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 OAZ2O95190 189 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 ADH1AP07327 375 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 NDUFV1P49821 464 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 NOP14P78316 857 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 HYAL1Q12794 435 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 SOWAHAQ2M3V2 549 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 CLSTN3Q9BQT9 956 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 CBX8Q9HC52 389 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 COQ4Q9Y3A0 265 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 CDY1Q9Y6F8 540 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 PES1O00541 588 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 CAVIN2O95810 425 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 P4HA1P13674 534 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 DUSP6Q16828 381 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 DPH6Q7L8W6 267 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 ADGRF2Q8IZF7 708 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM86AQ8N2M4 240 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 TSPY26PQ9H489 355 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 FBXL5Q9UKA1 691 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 BACE2Q9Y5Z0 518 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 P4HA2O15460 535 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 OR1D2P34982 312 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 ARPP19P56211 112 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 IQCB1Q15051 598 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 WDR44Q5JSH3 913 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 LUZP1Q86V48 1076 aa23.94■■□□□ 1.42
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