RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNG1Q9UIX4 513 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 YIPF1Q9Y548 306 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 ARID2Q68CP9 1835 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 VWA8A3KMH1 1905 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 COL4A2P08572 1712 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 OR6C75A6NL08 312 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 I3L4J1 428 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 K7ERI5 159 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 GIPC1O14908 333 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 ZBTB39O15060 712 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 XPOTO43592 962 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF40O75150 1001 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 ALDH1A2O94788 518 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 SEC24AO95486 1093 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 SPINK2P20155 84 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 PAX3P23760 479 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 AVPR1AP37288 418 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 TUFMP49411 452 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 NR1H3Q13133 447 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 RUNX3Q13761 415 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 CALCRLQ16602 461 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF423Q2M1K9 1284 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 ADCK5Q3MIX3 580 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 TCEAL6Q6IPX3 200 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 TXNDC11Q6PKC3 985 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 RABEPKQ7Z6M1 372 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 TSTD1Q8NFU3 115 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 WASF1Q92558 559 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 DDX12PQ92771 950 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 TCEAL3Q969E4 200 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 SPACA7Q96KW9 195 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 SUSD3Q96L08 255 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 ACAP3Q96P50 834 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 HSD17B14Q9BPX1 270 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 TCHPQ9BT92 498 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 SMOC1Q9H4F8 434 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 HSFX1Q9UBD0 423 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 ARHGEF35A5YM69 484 aa8.59□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 M0R2N6 131 aa8.59□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 MOSPD3O75425 235 aa8.59□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 RPS6KB1P23443 525 aa8.59□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 GABRR2P28476 465 aa8.59□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 GRM5P41594 1212 aa8.59□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 PSMD2Q13200 908 aa8.59□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 PDGFRLQ15198 375 aa8.59□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF568Q3ZCX4 644 aa8.59□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 PMS2CLQ68D20 193 aa8.59□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 KIAA1211LQ6NV74 962 aa8.59□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 PROSER1Q86XN7 944 aa8.59□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 CPA6Q8N4T0 437 aa8.59□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 DEFB124Q8NES8 71 aa8.59□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 PIGOQ8TEQ8 1089 aa8.59□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 HAS1Q92839 578 aa8.59□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 KIFAP3Q92845 792 aa8.59□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 PSMG2Q969U7 264 aa8.59□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 ZFYVE19Q96K21 471 aa8.59□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 DRC1Q96MC2 740 aa8.59□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 HHIPQ96QV1 700 aa8.59□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 P2RY13Q9BPV8 354 aa8.59□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa8.59□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 TUFT1Q9NNX1 390 aa8.59□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 WASF3Q9UPY6 502 aa8.59□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 TNFSF13BQ9Y275 285 aa8.59□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 UPK3BL1B0FP48 263 aa8.58□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 UPK3BL2E5RIL1 263 aa8.58□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 NEMFO60524 1076 aa8.58□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNE1P15382 129 aa8.58□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 HOXD12P35452 270 aa8.58□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 TXKP42681 527 aa8.58□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 SMARCB1Q12824 385 aa8.58□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 DUSP4Q13115 394 aa8.58□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 GPR17Q13304 367 aa8.58□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 MYBPC2Q14324 1141 aa8.58□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 DMC1Q14565 340 aa8.58□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM61Q5EBN2 209 aa8.58□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 SPDYCQ5MJ68 293 aa8.58□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 HAUS3Q68CZ6 603 aa8.58□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 DSTYKQ6XUX3 929 aa8.58□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa8.58□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 LPCAT2Q7L5N7 544 aa8.58□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 PDZD3Q86UT5 571 aa8.58□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 C3orf58Q8NDZ4 430 aa8.58□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 BEST2Q8NFU1 509 aa8.58□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 CEP76Q8TAP6 659 aa8.58□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 PIGKQ92643 395 aa8.58□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 TBC1D32Q96NH3 1257 aa8.58□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 AGXT2Q9BYV1 514 aa8.58□□□□□ -1.04
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