RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264266.12

MFSD1-201, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MFSD1, Length 1,594 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1-201ENST00000264266 PDE6CP51160 858 aa20.17■□□□□ 0.82
MFSD1-201ENST00000264266 C1orf127Q8N9H9 656 aa20.17■□□□□ 0.82
MFSD1-201ENST00000264266 NOX5Q96PH1 765 aa20.17■□□□□ 0.82
MFSD1-201ENST00000264266 NIF3L1Q9GZT8 377 aa20.17■□□□□ 0.82
MFSD1-201ENST00000264266 XYLT2Q9H1B5 865 aa20.17■□□□□ 0.82
MFSD1-201ENST00000264266 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
MFSD1-201ENST00000264266 DERAQ9Y315 318 aa20.17■□□□□ 0.82
MFSD1-201ENST00000264266 GPR182O15218 404 aa20.16■□□□□ 0.82
MFSD1-201ENST00000264266 EFCAB14O75071 495 aa20.16■□□□□ 0.82
MFSD1-201ENST00000264266 MOCS3O95396 460 aa20.16■□□□□ 0.82
MFSD1-201ENST00000264266 CDR2Q01850 454 aa20.16■□□□□ 0.82
MFSD1-201ENST00000264266 TMEM132DQ14C87 1099 aa20.16■□□□□ 0.82
MFSD1-201ENST00000264266 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
MFSD1-201ENST00000264266 ZNF677Q86XU0 584 aa20.16■□□□□ 0.82
MFSD1-201ENST00000264266 HERC6Q8IVU3 1022 aa20.16■□□□□ 0.82
MFSD1-201ENST00000264266 UBR7Q8N806 425 aa20.16■□□□□ 0.82
MFSD1-201ENST00000264266 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
MFSD1-201ENST00000264266 ALS2CR12Q96Q35 445 aa20.16■□□□□ 0.82
MFSD1-201ENST00000264266 SNTG2Q9NY99 539 aa20.16■□□□□ 0.82
MFSD1-201ENST00000264266 SIX4Q9UIU6 781 aa20.16■□□□□ 0.82
MFSD1-201ENST00000264266 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
MFSD1-201ENST00000264266 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa20.16■□□□□ 0.82
MFSD1-201ENST00000264266 MRFAP1Q9Y605 127 aa20.16■□□□□ 0.82
MFSD1-201ENST00000264266 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa20.16■□□□□ 0.82
MFSD1-201ENST00000264266 UQCRHLA0A096LP55 91 aa20.15■□□□□ 0.82
MFSD1-201ENST00000264266 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
MFSD1-201ENST00000264266 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
MFSD1-201ENST00000264266 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
MFSD1-201ENST00000264266 ANO9A1A5B4 782 aa20.15■□□□□ 0.82
MFSD1-201ENST00000264266 AMHP03971 560 aa20.15■□□□□ 0.82
MFSD1-201ENST00000264266 UQCRHP07919 91 aa20.15■□□□□ 0.82
MFSD1-201ENST00000264266 GZMAP12544 262 aa20.15■□□□□ 0.82
MFSD1-201ENST00000264266 DNAJB2P25686 324 aa20.15■□□□□ 0.82
MFSD1-201ENST00000264266 ATICP31939 592 aa20.15■□□□□ 0.82
MFSD1-201ENST00000264266 YARSP54577 528 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
MFSD1-201ENST00000264266 GALCP54803 685 aa20.15■□□□□ 0.82
MFSD1-201ENST00000264266 FMO1Q01740 532 aa20.15■□□□□ 0.82
MFSD1-201ENST00000264266 ZNF699Q32M78 642 aa20.15■□□□□ 0.82
MFSD1-201ENST00000264266 CXorf38Q8TB03 319 aa20.15■□□□□ 0.82
MFSD1-201ENST00000264266 ADAM2Q99965 735 aa20.15■□□□□ 0.82
MFSD1-201ENST00000264266 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
MFSD1-201ENST00000264266 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
MFSD1-201ENST00000264266 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa20.15■□□□□ 0.82
MFSD1-201ENST00000264266 CHD9Q3L8U1 2897 aa20.14■□□□□ 0.82
MFSD1-201ENST00000264266 SLU7O95391 586 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 TMEM253P0C7T8 217 aa20.14■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 UBXN11Q5T124 520 aa20.14■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 SNX27Q96L92 541 aa20.14■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 PCDHB18PQ96TA0 734 aa20.14■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 ISCUQ9H1K1 167 aa20.14■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 VRTNQ9H8Y1 702 aa20.14■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 ACP6Q9NPH0 428 aa20.14■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 ITGA11Q9UKX5 1188 aa20.14■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 TTC3P53804 2025 aa20.13■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 LCHNA4D1U4 455 aa20.13■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 ANKRD62A6NC57 917 aa20.13■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 ENPP3O14638 875 aa20.13■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 BUB1O43683 1085 aa20.13■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 RTN2O75298 545 aa20.13■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 CLSTN1O94985 981 aa20.13■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 MMEP08473 750 aa20.13■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 TAF3Q5VWG9 929 aa20.13■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 ALKAL1Q6UXT8 129 aa20.13■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 PALB2Q86YC2 1186 aa20.13■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 ZBED2Q9BTP6 218 aa20.13■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 FTHL17Q9BXU8 183 aa20.13■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 TAS2R14Q9NYV8 317 aa20.13■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 CHD7Q9P2D1 2997 aa20.13■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 CDC23Q9UJX2 597 aa20.13■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 JRKLQ9Y4A0 524 aa20.13■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 TLL1O43897 1013 aa20.12■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 ARHGEF15O94989 841 aa20.12■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 GJB5O95377 273 aa20.12■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 STAU1O95793 577 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 ITGB3P05106 788 aa20.12■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 KRT19P08727 400 aa20.12■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 RBP5P82980 135 aa20.12■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 AMPD2Q01433 879 aa20.12■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 TMEM270Q6UE05 265 aa20.12■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 DNAAF5Q86Y56 855 aa20.12■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 KIF12Q96FN5 646 aa20.12■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 TSPAN18Q96SJ8 248 aa20.12■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa20.12■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 DPP3Q9NY33 737 aa20.12■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 CNTN3Q9P232 1028 aa20.12■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa20.12■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 COL4A6Q14031 1691 aa20.12■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 TMCO5BA8MYB1 307 aa20.12■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 CTIFO43310 598 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 ZNF132P52740 706 aa20.12■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 DSC3Q14574 896 aa20.12■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 ZBTB6Q15916 424 aa20.12■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 ZNF667Q5HYK9 610 aa20.12■□□□□ 0.81
MFSD1-201ENST00000264266 Q7L0L9 218 aa20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms