RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 LIMS2Q7Z4I7 341 aa24.01■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 TRIML1Q8N9V2 468 aa24.01■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 KREMEN2Q8NCW0 462 aa24.01■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 ZNF560Q96MR9 790 aa24.01■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa24.01■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 GDAP2Q9NXN4 497 aa24.01■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 MUC3AQ02505 3323 aa24.01■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 TTC28Q96AY4 2481 aa24■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 RFPL2O75678 378 aa24■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 ODC1P11926 461 aa24■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 WSCD1Q658N2 575 aa24■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 ZNF280DQ6N043 979 aa24■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 TTI2Q6NXR4 508 aa24■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa24■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 VNN1O95497 513 aa23.99■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 WEE2P0C1S8 567 aa23.99■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 LRRC63Q05C16 580 aa23.99■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 ITIH3Q06033 890 aa23.99■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 OVOS1Q6IE37 1185 aa23.99■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 TMC5Q6UXY8 1006 aa23.99■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 FAM186BQ8IYM0 893 aa23.99■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 ZNF461Q8TAF7 563 aa23.99■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 HPDLQ96IR7 371 aa23.99■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 MED15Q96RN5 788 aa23.99■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 TMEM209Q96SK2 561 aa23.99■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 MKNK1Q9BUB5 465 aa23.99■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 XYLT2Q9H1B5 865 aa23.99■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 SFXN1Q9H9B4 322 aa23.99■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 L1RE1Q9UN81 338 aa23.99■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 C2orf16Q68DN1 1984 aa23.98■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 DOCK6Q96HP0 2047 aa23.98■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 PSMA7O14818 248 aa23.98■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 IKBKBO14920 756 aa23.98■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 CETN3O15182 167 aa23.98■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 VNN2O95498 520 aa23.98■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 PPP1R2P41236 205 aa23.98■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 VAMP7P51809 220 aa23.98■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 ENPEPQ07075 957 aa23.98■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 BFSP1Q12934 665 aa23.98■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 GPR149Q86SP6 731 aa23.98■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 PDCL2Q8N4E4 241 aa23.98■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 OR10T2Q8NGX3 314 aa23.98■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa23.98■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 NELFBQ8WX92 580 aa23.98■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 NUP62CLQ9H1M0 184 aa23.98■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 NCOR1O75376 2440 aa23.98■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 ZMYND10O75800 440 aa23.97■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 OR4Q2P0C623 313 aa23.97■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 AP3M2P53677 418 aa23.97■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 ARPP19P56211 112 aa23.97■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 MYL6P60660 151 aa23.97■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 PPP3CAQ08209 521 aa23.97■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 STIM1Q13586 685 aa23.97■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 SOWAHAQ2M3V2 549 aa23.97■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 ZACNQ401N2 412 aa23.97■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 KLHL10Q6JEL2 608 aa23.97■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 FOXR2Q6PJQ5 311 aa23.97■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 SV2AQ7L0J3 742 aa23.97■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 USP37Q86T82 979 aa23.97■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 TSG101Q99816 390 aa23.97■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 DSEQ9UL01 958 aa23.97■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 SNX9Q9Y5X1 595 aa23.97■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa23.96■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 OR6C75A6NL08 312 aa23.96■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 SEC24AO95486 1093 aa23.96■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 STAU1O95793 577 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 TRIM49P0CI25 452 aa23.96■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 TRIM49CP0CI26 452 aa23.96■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 ATF2P15336 505 aa23.96■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa23.96■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 OSTM1Q86WC4 334 aa23.96■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa23.96■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 CD320Q9NPF0 282 aa23.96■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 DPP7Q9UHL4 492 aa23.96■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 GOLGA6L22H0YM25 854 aa23.95■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 GABRDO14764 452 aa23.95■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 MYO1EQ12965 1108 aa23.95■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 GPR17Q13304 367 aa23.95■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 TPGS2Q68CL5 300 aa23.95■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 LRRTM3Q86VH5 581 aa23.95■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 TOP6BLQ8N6T0 577 aa23.95■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 ELMO3Q96BJ8 720 aa23.95■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 PRKD2Q9BZL6 878 aa23.95■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa23.95■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 CTNND2Q9UQB3 1225 aa23.95■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 ARHGEF37A1IGU5 675 aa23.94■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 C8AP07357 584 aa23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms