RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 NPEPPSP55786 919 aa11.05□□□□□ -0.64
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TRPS1-201ENST00000220888 CARNMT1Q8N4J0 409 aa11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 TEX9Q8N6V9 391 aa11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 JADE3Q92613 823 aa11.05□□□□□ -0.64
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TRPS1-201ENST00000220888 IGFLR1Q9H665 355 aa11.05□□□□□ -0.64
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TRPS1-201ENST00000220888 KRT20P35900 424 aa11.05□□□□□ -0.64
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TRPS1-201ENST00000220888 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
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TRPS1-201ENST00000220888 ZNF280DQ6N043 979 aa11.05□□□□□ -0.64
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TRPS1-201ENST00000220888 MMGT1Q8N4V1 131 aa11.04□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 GPT2Q8TD30 523 aa11.04□□□□□ -0.64
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TRPS1-201ENST00000220888 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa11.03□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 GJB4Q9NTQ9 266 aa11.03□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 DSEQ9UL01 958 aa11.03□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 FAM187AA6NFU0 413 aa11.03□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 CCDC85CA6NKD9 419 aa11.03□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 SEMA3FQ13275 785 aa11.03□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 RDM1Q8NG50 284 aa11.03□□□□□ -0.64
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