RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000041730.10

Lmx1b-201, Transcript of LIM homeobox transcription factor 1-beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Lmx1b, Length 4,790 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Cd44P15379 778 aa14.66□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Rab17P35292 214 aa14.66□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Krt80Q0VBK2 452 aa14.66□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Bcap29Q61334 240 aa14.66□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Tpd52Q62393 224 aa14.66□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Letm2Q7TNU7 480 aa14.66□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Raver2Q7TPD6 673 aa14.66□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Alkbh8Q80Y20 664 aa14.66□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Ttc30a1Q99J38 664 aa14.66□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Ubxn11Q9D572 484 aa14.66□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Gcnt4E9Q649 455 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Zfp850J3QPC5 689 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Abcb1bP06795 1276 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Pms2P54279 859 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Npas2P97460 816 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 GrapQ9CX99 217 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Ybx3Q9JKB3 361 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Chek2Q9Z265 546 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Krt16Q9Z2K1 469 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Gm3095E9Q058 166 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Ccng1P51945 294 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 E2f5Q61502 335 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Capn11Q6J756 714 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Acot5Q6Q2Z6 421 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Cnksr2Q80YA9 1032 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Rusc1Q8BG26 893 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Ccdc90bQ8C3X2 256 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Fcho1Q8K285 873 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Dqx1Q924H9 718 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Bap1Q99PU7 728 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Ccdc194A0A140LIT1 234 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Zfp651E9PZ11 729 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Gm8298J3QPI0 401 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Foxm1O08696 760 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 LmnaP48678 665 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Psma2P49722 234 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Q14AM7 275 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Syce2Q505B8 171 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Kcnt1Q6ZPR4 1224 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Tmco6Q8BQX5 494 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Znf426Q8R1D1 550 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Nme5Q99MH5 211 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Rassf7Q9DD19 359 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Maged2Q9ER67 616 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Drg2Q9QXB9 364 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Slc6a16A0A1L1SR47 742 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Arhgef37A1IGU4 676 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Map7d3A2AEY4 876 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Msh2P43247 935 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Hspa4lP48722 838 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 NfiaQ02780 532 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Aars2Q14CH7 980 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Supt20hQ7TT00 530 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Mtss1Q8R1S4 759 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Sh3bp5lQ99LH9 392 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Sertad2Q9JJG5 309 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Dnajc12Q9R022 198 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 BcamQ9R069 622 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Gm5737A0A140LI11 423 aa14.64□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Cyp4f17G3UW78 524 aa14.64□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Fgf15O35622 218 aa14.64□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Actr2P61161 394 aa14.64□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Atxn7l3bQ3UD01 97 aa14.64□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Grid1Q61627 1009 aa14.64□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Papd5Q68ED3 633 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Sv2cQ69ZS6 727 aa14.64□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Dnajc6Q80TZ3 938 aa14.64□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 MtbpQ8BJS8 894 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 CopaQ8CIE6 1224 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Clptm1Q8VBZ3 664 aa14.64□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Msi2Q920Q6 346 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Cyp4f16Q99N17 524 aa14.64□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Rnf25Q9QZR0 456 aa14.64□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Nme3Q9WV85 169 aa14.64□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 EloblA6PWE0 161 aa14.64□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 R3hdm1E9Q9Q2 1135 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Rad51ap2G3UW63 976 aa14.64□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Pja1O55176 578 aa14.64□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Cdh16O88338 830 aa14.64□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Mxi1P50540 228 aa14.64□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Calb2Q08331 271 aa14.64□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 TraddQ3U0V2 310 aa14.64□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Pkn3Q8K045 878 aa14.64□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Zbtb44Q8R0A2 453 aa14.64□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Pglyrp2Q8VCS0 530 aa14.64□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Ascc2Q91WR3 749 aa14.64□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Bhmt2Q91WS4 363 aa14.64□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Homer3Q99JP6 356 aa14.64□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Them5Q9CQJ0 248 aa14.64□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Dnajc19Q9CQV7 116 aa14.64□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Micu3Q9CTY5 523 aa14.64□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Rab11fip1Q9D620 645 aa14.64□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Snx5Q9D8U8 404 aa14.64□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Robo1O89026 1612 aa14.64□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 AdgbG3UZ78 1657 aa14.64□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Gm5689F6Y2A6 97 aa14.64□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Tekt5G5E8A8 557 aa14.64□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Efna5O08543 228 aa14.64□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Mdm4O35618 489 aa14.64□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 ChrngP04760 519 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 32.7 ms