Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Snx5Q9D8U8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Snx5Q9D8U8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Snx5Q9D8U8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Snx5Q9D8U8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Snx5Q9D8U8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Snx5Q9D8U8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Snx5Q9D8U8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Snx5Q9D8U8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Snx5Q9D8U8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Snx5Q9D8U8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Snx5Q9D8U8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Snx5Q9D8U8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Snx5Q9D8U8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Snx5Q9D8U8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Snx5Q9D8U8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Snx5Q9D8U8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Snx5Q9D8U8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Snx5Q9D8U8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Snx5Q9D8U8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Snx5Q9D8U8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Snx5Q9D8U8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Snx5Q9D8U8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Snx5Q9D8U8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Snx5Q9D8U8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Snx5Q9D8U8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Snx5Q9D8U8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Snx5Q9D8U8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Snx5Q9D8U8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Snx5Q9D8U8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Snx5Q9D8U8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Snx5Q9D8U8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Snx5Q9D8U8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Snx5Q9D8U8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Snx5Q9D8U8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Snx5Q9D8U8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Snx5Q9D8U8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Snx5Q9D8U8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Snx5Q9D8U8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Snx5Q9D8U8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Snx5Q9D8U8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Snx5Q9D8U8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Snx5Q9D8U8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Snx5Q9D8U8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Snx5Q9D8U8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Snx5Q9D8U8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Snx5Q9D8U8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Snx5Q9D8U8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Snx5Q9D8U8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Snx5Q9D8U8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Snx5Q9D8U8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Snx5Q9D8U8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Snx5Q9D8U8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Snx5Q9D8U8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Snx5Q9D8U8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Snx5Q9D8U8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Snx5Q9D8U8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Snx5Q9D8U8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Snx5Q9D8U8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Snx5Q9D8U8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Snx5Q9D8U8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Snx5Q9D8U8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snx5Q9D8U8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Snx5Q9D8U8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Snx5Q9D8U8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Snx5Q9D8U8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Snx5Q9D8U8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Snx5Q9D8U8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Snx5Q9D8U8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Snx5Q9D8U8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Snx5Q9D8U8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snx5Q9D8U8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Snx5Q9D8U8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Snx5Q9D8U8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Snx5Q9D8U8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snx5Q9D8U8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Snx5Q9D8U8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Snx5Q9D8U8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Snx5Q9D8U8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snx5Q9D8U8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Snx5Q9D8U8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Snx5Q9D8U8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Snx5Q9D8U8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snx5Q9D8U8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snx5Q9D8U8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Snx5Q9D8U8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Snx5Q9D8U8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snx5Q9D8U8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snx5Q9D8U8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snx5Q9D8U8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snx5Q9D8U8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snx5Q9D8U8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snx5Q9D8U8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snx5Q9D8U8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snx5Q9D8U8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Snx5Q9D8U8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snx5Q9D8U8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snx5Q9D8U8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snx5Q9D8U8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snx5Q9D8U8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms