RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025262.5

Ltb-201, Transcript of Lymphotoxin-beta, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ltb, Length 1,160 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tmem132aQ922P8 1018 aa20.6■□□□□ 0.89
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mrpl9Q99N94 265 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
Ltb-201ENSMUST00000025262 Apobec2Q9WV35 224 aa20.6■□□□□ 0.89
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sept5Q9Z2Q6 369 aa20.6■□□□□ 0.89
Ltb-201ENSMUST00000025262 MndalD0QMC3 538 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
Ltb-201ENSMUST00000025262 Calhm3J3QMI4 347 aa20.59■□□□□ 0.89
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ptch2O35595 1182 aa20.59■□□□□ 0.89
Ltb-201ENSMUST00000025262 C4bpaP08607 469 aa20.59■□□□□ 0.89
Ltb-201ENSMUST00000025262 Epha2Q03145 977 aa20.59■□□□□ 0.89
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pnma5Q5DTT8 618 aa20.59■□□□□ 0.89
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rpf1Q7TND5 349 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tmem169Q8BG50 297 aa20.59■□□□□ 0.89
Ltb-201ENSMUST00000025262 Prkag3Q8BGM7 489 aa20.59■□□□□ 0.89
Ltb-201ENSMUST00000025262 OgtQ8CGY8 1046 aa20.59■□□□□ 0.89
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gramd1aQ8VEF1 722 aa20.59■□□□□ 0.89
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mtfr1Q99MB2 328 aa20.59■□□□□ 0.89
Ltb-201ENSMUST00000025262 2310002L09RikQ9D7L5 217 aa20.59■□□□□ 0.89
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tspan3Q9QY33 253 aa20.59■□□□□ 0.89
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ndrg2Q9QYG0 371 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ace3D0G895 737 aa20.58■□□□□ 0.89
Ltb-201ENSMUST00000025262 Senp1P59110 640 aa20.58■□□□□ 0.89
Ltb-201ENSMUST00000025262 Polr3bP59470 1133 aa20.58■□□□□ 0.89
Ltb-201ENSMUST00000025262 Wbp2P97765 261 aa20.58■□□□□ 0.89
Ltb-201ENSMUST00000025262 Usp49Q6P9L4 685 aa20.58■□□□□ 0.89
Ltb-201ENSMUST00000025262 Olfr389Q7TRX7 312 aa20.58■□□□□ 0.89
Ltb-201ENSMUST00000025262 Zbtb42Q811H0 420 aa20.58■□□□□ 0.89
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cstf2Q8BIQ5 580 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
Ltb-201ENSMUST00000025262 Znf830Q8R1N0 363 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
Ltb-201ENSMUST00000025262 PrebQ9WUQ2 417 aa20.58■□□□□ 0.89
Ltb-201ENSMUST00000025262 Plcb1Q9Z1B3 1216 aa20.58■□□□□ 0.89
Ltb-201ENSMUST00000025262 Dchs2A0A0A6YW72 3346 aa20.57■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Olfr456B2RT27 312 aa20.57■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Speer4f2E9Q366 295 aa20.57■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cldn4O35054 210 aa20.57■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Opn1mwO35599 359 aa20.57■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 IapP03975 557 aa20.57■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fam167bP17257 162 aa20.57■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pax3P24610 479 aa20.57■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Serpinc1P32261 465 aa20.57■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Prdx5P99029 210 aa20.57■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cpne7Q0VE82 557 aa20.57■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ttyh3Q6P5F7 524 aa20.57■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Polr2eQ80UW8 210 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Me3Q8BMF3 604 aa20.57■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Olfr458Q8VF80 313 aa20.57■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Olfr457Q8VGP5 313 aa20.57■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sh2b1Q91ZM2 756 aa20.57■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rassf7Q9DD19 359 aa20.57■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Oxct2bQ9ESL0 520 aa20.57■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Oxct2aQ9JJN4 520 aa20.57■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cpsf3Q9QXK7 684 aa20.57■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Acad12D3Z7X0 555 aa20.56■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Eef2kO08796 724 aa20.56■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 RhoP15409 348 aa20.56■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 CgnP59242 1191 aa20.56■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cracr2aQ3UP38 310 aa20.56■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pik3r5Q5SW28 871 aa20.56■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Slfn5Q8CBA2 884 aa20.56■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mill2Q8HWE5 355 aa20.56■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gga1Q8R0H9 635 aa20.56■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mrps25Q9D125 171 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pex3Q9QXY9 372 aa20.56■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tnfrsf10bQ9QZM4 381 aa20.56■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 AurkbO70126 345 aa20.55■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 MybP06876 636 aa20.55■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ccnd2P30280 289 aa20.55■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Samsn1P57725 372 aa20.55■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 LyarQ08288 388 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Taar7eQ5QD09 358 aa20.55■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 N4bp1Q6A037 893 aa20.55■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Clec4a3Q8JZX6 237 aa20.55■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Slc8a2Q8K596 921 aa20.55■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Hnrnpul1Q8VDM6 859 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pcdhga6Q91XY2 932 aa20.55■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 BrdtQ91Y44 956 aa20.55■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cyp2c55Q9D816 490 aa20.55■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Myl7Q9QVP4 175 aa20.55■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Elf4Q9Z2U4 655 aa20.55■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pds5aQ6A026 1332 aa20.54■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm10110D3Z5M2 615 aa20.54■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Nmt1O70310 496 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Aoc3O70423 765 aa20.54■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mcm4P49717 862 aa20.54■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Shmt1P50431 478 aa20.54■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Dsc3P55850 896 aa20.54■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sox8Q04886 464 aa20.54■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gpbp1Q6NXH3 473 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pabpc4Q6PHQ9 660 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tas2r124Q7M718 309 aa20.54■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 FukQ7TMC8 1090 aa20.54■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 6820408C15RikQ8BJX2 354 aa20.54■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rhpn2Q8BWR8 686 aa20.54■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Wdr27Q8C5V5 780 aa20.54■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pnma3Q8JZW8 466 aa20.54■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sirt3Q8R104 334 aa20.54■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Kremen1Q99N43 473 aa20.54■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 NenfQ9CQ45 171 aa20.54■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Lrp2bpQ9D4C6 346 aa20.54■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ccdc7Q9D541 371 aa20.54■□□□□ 0.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tmem86aQ9D8N3 241 aa20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.9 ms