RNA–Protein interactions for RNA: YOR033C

EXO1, Transcript of 5'-3' exonuclease and flap-endonuclease, yeast

Gene EXO1, Length 2,109 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EXO1	YOR033C	MSS51	P32335	436 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	SLC1	P33333	303 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	SAF1	P38352	637 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	YHL026C	P38740	315 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	MEP2	P41948	499 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	PAU5	P43575	122 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	ATG27	P46989	271 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	YJR115W	P47152	169 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	YDL057W	Q07379	328 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	OPI10	Q08202	246 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	PRM3	Q08931	133 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	YKL183C-A	Q3E765	70 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	NFS1	P25374	497 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	MLF3	P32047	452 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	EMC3	P36039	253 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	YNL194C	P40169	301 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	RNH201	P53942	307 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	NUP53	Q03790	475 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	HMRA1	P0CY11	126 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	SCO1	P23833	295 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	VMA3	P25515	160 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	ZRT1	P32804	376 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	YKL107W	P34251	309 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	YBR090C	P38253	122 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	YJR124C	P47159	448 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	HMS2	P47175	358 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	EST3	Q03096	181 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	OAC1	P32332	324 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	FRM2	P37261	193 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	YIL059C	P40520	121 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	CDC14	Q00684	551 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	YMR166C	Q03829	368 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	YLR346C	Q06139	101 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	DAP1	Q12091	152 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	COX19	Q3E731	98 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	YIH1	P25637	258 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	COX13	P32799	129 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	IML3	P38265	245 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	YGL262W	P53054	175 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	YNR040W	P53736	256 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	YOL024W	Q08172	172 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	MCA1	Q08601	432 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	SKN1	P33336	771 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	SDP1	P40479	209 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	PAM16	P42949	149 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	YJL118W	P47022	219 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	ALG13	P53178	202 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	EFM6	P53970	246 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	YOR376W	Q08900	122 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	ATX1	P38636	73 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	MPM1	P40364	252 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	SAS2	P40963	338 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	CIN2	P46670	268 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	YGR039W	P53225	103 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	WSC2	P53832	503 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	ADD37	Q03233	198 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	IZH1	Q03419	316 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	SNO4	Q04902	237 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	HSP32	Q08992	237 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	RAD6	P06104	172 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	CDC43	P18898	376 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	COX10	P21592	462 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	MAK32	P23060	363 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	ERV1	P27882	189 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	SGE1	P33335	543 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	LYS5	P50113	272 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	CDH1	P53197	566 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	YMR320W	Q04897	101 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	TAZ1	Q06510	381 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	ARR3	Q06598	404 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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