RNA–Protein interactions for RNA: YJR065C

ARP3, Transcript of Essential component of the Arp2/3 complex, yeastyeast

Gene ARP3, Length 1,350 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ARP3YJR065C MPP6P53725 186 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
ARP3YJR065C MRPL1Q04599 285 aa5.78□□□□□ -1.48
ARP3YJR065C NAT3Q06504 195 aa5.78□□□□□ -1.48
ARP3YJR065C YFT2Q06676 274 aa5.78□□□□□ -1.48
ARP3YJR065C ENB1Q08299 606 aa5.78□□□□□ -1.48
ARP3YJR065C PFA4Q12006 378 aa5.78□□□□□ -1.48
ARP3YJR065C PRR2Q12310 699 aa5.78□□□□□ -1.48
ARP3YJR065C COA2Q3E823 68 aa5.78□□□□□ -1.48
ARP3YJR065C COX2P00410 251 aa5.77□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C YLL053CP0CD98 152 aa5.77□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C GLC7P32598 312 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C PMU1P36069 295 aa5.77□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C YAL037WP39728 267 aa5.77□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C CDC40P40968 455 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C TTI2P47168 421 aa5.77□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C HSV2P50079 448 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C MTO1P53070 669 aa5.77□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C ERG13P54839 491 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C YPL077CQ02831 240 aa5.77□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C YPL039WQ03080 316 aa5.77□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C DIG2Q03373 323 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C GIM5Q04493 163 aa5.77□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C CTS2Q06350 511 aa5.77□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C RLM1Q12224 676 aa5.77□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C YMR084WA2P2R3 262 aa5.76□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C DAT1P13483 248 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C SPO7P18410 259 aa5.76□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C PPA2P28239 310 aa5.76□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C SUA7P29055 345 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C ERG2P32352 222 aa5.76□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C PIC2P40035 300 aa5.76□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C SNO3P43544 222 aa5.76□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C SNO2P53823 222 aa5.76□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C PDR17P53844 350 aa5.76□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C CUZ1P53899 274 aa5.76□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C YML053CQ04978 212 aa5.76□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C COQ11Q05892 277 aa5.76□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C YOL029CQ08187 201 aa5.76□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C YPR071WQ12346 211 aa5.76□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C ERV1P27882 189 aa5.75□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C AHT1P29589 182 aa5.75□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C UTR5P32630 166 aa5.75□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C AGA2P32781 87 aa5.75□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C REC114P32841 428 aa5.75□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C YKL187CP34231 750 aa5.75□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C PAU16P35994 123 aa5.75□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C PRY2P36110 329 aa5.75□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C POA1P38218 177 aa5.75□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C PAC2P39937 518 aa5.75□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C SSU72P53538 206 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C AQR1P53943 586 aa5.75□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C NCE101Q02820 53 aa5.75□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C TSA2Q04120 196 aa5.75□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C TRI1Q05024 226 aa5.75□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C CNL1Q06333 122 aa5.75□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C TPT1Q12272 230 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C HUT1Q12520 339 aa5.75□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C Q0182Q9ZZW1 134 aa5.75□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C YDR157WA0A023PZE8 133 aa5.74□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C SAL1D6W196 494 aa5.74□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C QCR9P22289 66 aa5.74□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C YCR025CP25352 136 aa5.74□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C CWP1P28319 239 aa5.74□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C SWD2P36104 329 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C YMR166CQ03829 368 aa5.74□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C UPS3Q04006 179 aa5.74□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C STP4Q07351 490 aa5.74□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C PAM18Q07914 168 aa5.74□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C YOR105WQ08504 108 aa5.74□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C MCP1Q12106 302 aa5.74□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C SMT3Q12306 101 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C GAL7P08431 366 aa5.73□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C RPS22AP0C0W1 130 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C ANB1P19211 157 aa5.73□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C YCR007CP25354 239 aa5.73□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C SPS18P32572 300 aa5.73□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C YJL193WP39542 402 aa5.73□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C BDH1P39714 382 aa5.73□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C XPT1P47165 209 aa5.73□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C YGR017WP53210 297 aa5.73□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C FHN1P53279 174 aa5.73□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C DUG3P53871 357 aa5.73□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C RPL21AQ02753 160 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C DAL4Q04895 635 aa5.73□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C YDR286CQ05530 114 aa5.73□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C HRI1Q05905 244 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C STP3Q05937 343 aa5.73□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C IRC19Q07843 230 aa5.73□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C MIM1Q08176 113 aa5.73□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C TGS1Q12052 315 aa5.73□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C YOR343CQ12484 108 aa5.73□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C RPL21BQ12672 160 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C SHB17P36136 271 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C QDR3P38227 689 aa5.72□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C ALG14P38242 237 aa5.72□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C POP2P39008 433 aa5.72□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C YER134CP40081 178 aa5.72□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C YER188WP40103 239 aa5.72□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C PRE5P40302 234 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
ARP3YJR065C CGI121Q03705 181 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 513.5 ms