RNA–Protein interactions for RNA: YHR199C-A

NBL1, Transcript of Subunit of the conserved chromosomal passenger complex (CPC), yeast

Gene NBL1, Length 222 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NBL1	YHR199C-A	VMR1	P38735	1592 aa		0.77	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	TY1B-DR5	P0C2I2	1755 aa		0.77	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	TY1B-DR6	P0C2I3	1755 aa		0.77	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	TY1B-LR2	P0C2I5	1755 aa		0.77	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	TY1B-LR3	P0C2I6	1755 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	TY1B-PR1	P0C2I9	1755 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	TY1B-PR3	P0C2J1	1755 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	TY1B-JR1	P47098	1755 aa		0.77	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	TY1B-ML2	Q03434	1755 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	TY1B-ER1	Q03612	1755 aa		0.77	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	TY1B-ML1	Q04711	1755 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	TY1B-GR2	Q12269	1755 aa		0.77	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	TY1B-OL	Q12273	1755 aa		0.77	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	TY1B-GR3	Q12316	1755 aa		0.77	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	TY1B-PL	Q12414	1755 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	TY1B-OR	Q92393	1755 aa		0.77	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	TY1B-JR2	P47100	1755 aa	Known RBP	0.76	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	TY1B-ER2	Q03619	1755 aa		0.76	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	TY1B-MR1	Q04214	1755 aa		0.76	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	TY1B-MR2	Q04670	1755 aa	Known RBP	0.76	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	TY1B-LR1	Q12088	1755 aa	Known RBP	0.76	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	TY1B-NL1	Q12112	1755 aa		0.76	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	TY1B-GR1	Q12141	1755 aa		0.76	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	TY1B-BL	Q12490	1755 aa		0.76	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	RPO21	P04050	1733 aa	Known RBP	0.76	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	0.76	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	0.76	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	GPA2	P10823	449 aa		0.76	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	SEN2	P16658	377 aa		0.76	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	YPK2	P18961	677 aa		0.76	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	0.76	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	FZF1	P32805	299 aa		0.76	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	0.76	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	0.76	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	YNL217W	P40152	326 aa		0.76	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	FMC1	P40491	155 aa		0.76	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	YPL162C	Q12042	273 aa		0.76	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	ATG31	Q12421	196 aa		0.76	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	YLR422W	Q06409	1932 aa		0.76	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	KRE5	P22023	1365 aa		0.75	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	0.75	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		0.75	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		0.75	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	ATG22	P25568	528 aa		0.75	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	0.75	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	NUF2	P33895	451 aa		0.75	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	0.75	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	TCD1	P38756	429 aa		0.75	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	DOG2	P38773	246 aa		0.75	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	YER121W	P40076	114 aa		0.75	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	0.75	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	COX15	P40086	486 aa		0.75	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	PEX17	P40155	199 aa		0.75	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	YRB2	P40517	327 aa		0.75	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	MSS2	P40990	351 aa		0.75	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	0.75	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	0.75	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	APS3	P47064	194 aa		0.75	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	SAY1	P53324	424 aa		0.75	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	DID2	P69771	204 aa		0.75	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	SRL4	Q03085	281 aa		0.75	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	0.75	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	0.75	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	GIM5	Q04493	163 aa		0.75	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	0.75	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	PSF1	Q12488	208 aa		0.75	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	YRF1-3	P0CX14	1859 aa		0.75	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	YRF1-7	P0CX15	1859 aa		0.75	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	YRF1-6	P53819	1859 aa		0.75	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	YBT1	P32386	1661 aa		0.75	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	QCR8	P08525	94 aa		0.74	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		0.74	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		0.74	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	KSS1	P14681	368 aa		0.74	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	CBF1	P17106	351 aa		0.74	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	SSO1	P32867	290 aa		0.74	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	0.74	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	YET1	P35723	206 aa		0.74	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	0.74	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	SKG1	P36169	355 aa		0.74	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	0.74	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	MTW1	P39731	289 aa		0.74	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	YER085C	P40058	173 aa		0.74	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	YJR149W	P47177	404 aa		0.74	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	TRM9	P49957	279 aa		0.74	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	BOL2	P53082	120 aa		0.74	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	PRM8	P53174	237 aa		0.74	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	CGR1	P53188	120 aa		0.74	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	ORM1	P53224	222 aa		0.74	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.74	□□□□□ -2.29	not detected
NBL1	YHR199C-A	PGA2	P53903	129 aa		0.74	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29

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