RNA–Protein interactions for RNA: YER128W

VFA1, Transcript of Protein that interacts with Vps4p and has a role in vacuolar sorting, yeastyeast

Gene VFA1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1YER128W APJ1P53940 528 aa3.01□□□□□ -1.93
VFA1YER128W GPI15P53961 229 aa3.01□□□□□ -1.93
VFA1YER128W AIM11P87275 137 aa3.01□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YMR130WQ04223 302 aa3.01□□□□□ -1.93
VFA1YER128W HNT1Q04344 158 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YPR114WQ06107 315 aa3.01□□□□□ -1.93
VFA1YER128W TAZ1Q06510 381 aa3.01□□□□□ -1.93
VFA1YER128W PLB3Q08108 686 aa3.01□□□□□ -1.93
VFA1YER128W NAT5Q08689 176 aa3.01□□□□□ -1.93
VFA1YER128W SIA1Q12212 622 aa3.01□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YLR118CQ12354 227 aa3.01□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YJR112W-AQ3E743 109 aa3.01□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YEL009C-AA0A023PZF2 135 aa3□□□□□ -1.93
VFA1YER128W RPS25BP0C0T4 108 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YOL163WP0CF20 169 aa3□□□□□ -1.93
VFA1YER128W UBI4P0CG63 381 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YEL076C-AP0CX16 216 aa3□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YLR464WP0CX17 216 aa3□□□□□ -1.93
VFA1YER128W CDC26P14724 124 aa3□□□□□ -1.93
VFA1YER128W ACO1P19414 778 aaKnown RBP RIP-Chip data3□□□□□ -1.93not detected
VFA1YER128W SLM5P25345 492 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YPS1P32329 569 aa3□□□□□ -1.93
VFA1YER128W UTR5P32630 166 aa3□□□□□ -1.93
VFA1YER128W KTI12P34253 313 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
VFA1YER128W TMA19P35691 167 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
VFA1YER128W ASC1P38011 319 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YBR241CP38142 488 aa3□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YEL076CP39971 216 aa3□□□□□ -1.93
VFA1YER128W GLE2P40066 365 aa3□□□□□ -1.93
VFA1YER128W AVT7P40501 490 aa3□□□□□ -1.93
VFA1YER128W PAU15P40585 124 aa3□□□□□ -1.93
VFA1YER128W ERG25P53045 309 aa3□□□□□ -1.93
VFA1YER128W BRR6P53062 197 aa3□□□□□ -1.93
VFA1YER128W MMS2P53152 137 aa3□□□□□ -1.93
VFA1YER128W ALG13P53178 202 aa3□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YGR168CP53293 376 aa3□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YNR048WP53740 393 aa3□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YMR178WQ03219 274 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
VFA1YER128W GRH1Q04410 372 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
VFA1YER128W ERP1Q05359 219 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
VFA1YER128W GRX8Q05926 109 aa3□□□□□ -1.93
VFA1YER128W LOA1Q06508 300 aa3□□□□□ -1.93
VFA1YER128W THP1Q08231 455 aa3□□□□□ -1.93
VFA1YER128W MCT1Q12283 360 aa3□□□□□ -1.93
VFA1YER128W RPS25AQ3E792 108 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
VFA1YER128W MHF1Q3E835 90 aa3□□□□□ -1.93
VFA1YER128W RAS2P01120 322 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
VFA1YER128W RPS21AP0C0V8 87 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
VFA1YER128W PBI2P0CT04 75 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
VFA1YER128W TKL1P23254 680 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
VFA1YER128W OAC1P32332 324 aa2.99□□□□□ -1.93
VFA1YER128W MSS51P32335 436 aa2.99□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YKL187CP34231 750 aa2.99□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YPT10P38146 199 aa2.99□□□□□ -1.93
VFA1YER128W SLM6P38343 150 aa2.99□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YHR177WP38867 453 aa2.99□□□□□ -1.93
VFA1YER128W MET30P39014 640 aa2.99□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YIL059CP40520 121 aa2.99□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YIL054WP40524 105 aa2.99□□□□□ -1.93
VFA1YER128W MSL1P40567 111 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YIR016WP40572 265 aa2.99□□□□□ -1.93
VFA1YER128W SMD3P43321 101 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YGL230CP53074 147 aa2.99□□□□□ -1.93
VFA1YER128W ERG26P53199 349 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
VFA1YER128W SYF2P53277 215 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
VFA1YER128W RPL15BP54780 204 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
VFA1YER128W COF1Q03048 143 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YHM2Q04013 314 aa2.99□□□□□ -1.93
VFA1YER128W FIT1Q04433 528 aa2.99□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YMR320WQ04897 101 aa2.99□□□□□ -1.93
VFA1YER128W POS5Q06892 414 aa2.99□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YGK3Q12222 375 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YOS1Q3E834 85 aa2.99□□□□□ -1.93
VFA1YER128W KTI11Q3E840 82 aa2.99□□□□□ -1.93
VFA1YER128W SUS1Q6WNK7 96 aa2.99□□□□□ -1.93
VFA1YER128W RIF1P29539 1916 aa2.98□□□□□ -1.93
VFA1YER128W MBF1O14467 151 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
VFA1YER128W SIR2P06700 562 aa2.98□□□□□ -1.93
VFA1YER128W HSP26P15992 214 aaKnown RBP RIP-Chip data2.98□□□□□ -1.93not detected
VFA1YER128W YCR007CP25354 239 aa2.98□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YCR100CP25606 316 aa2.98□□□□□ -1.93
VFA1YER128W MRP20P32387 263 aa2.98□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YSC83P32792 385 aa2.98□□□□□ -1.93
VFA1YER128W COX13P32799 129 aa2.98□□□□□ -1.93
VFA1YER128W REC114P32841 428 aa2.98□□□□□ -1.93
VFA1YER128W SOR1P35497 357 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
VFA1YER128W CMC1P36064 111 aa2.98□□□□□ -1.93
VFA1YER128W SHB17P36136 271 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
VFA1YER128W GCV3P39726 170 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
VFA1YER128W MRPL49P40858 161 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YFL065CP43539 102 aa2.98□□□□□ -1.93
VFA1YER128W RPN11P43588 306 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YFR045WP43617 309 aa2.98□□□□□ -1.93
VFA1YER128W GON7P46984 123 aa2.98□□□□□ -1.93
VFA1YER128W TAD2P47058 250 aa2.98□□□□□ -1.93
VFA1YER128W COQ5P49017 307 aa2.98□□□□□ -1.93
VFA1YER128W SBH1P52870 82 aa2.98□□□□□ -1.93
VFA1YER128W PDR17P53844 350 aa2.98□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YIF1P53845 314 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
VFA1YER128W GRX5Q02784 150 aa2.98□□□□□ -1.93
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