RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560962.5

USP3-AS1-208, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 1,807 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-208ENST00000560962 CNTN6Q9UQ52 1028 aa19.07■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa19.06■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 NCANO14594 1321 aa19.06■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 ARVCFO00192 962 aa19.06■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 RECQL4O94761 1208 aa19.06■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 GZMAP12544 262 aa19.06■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 MTFR1Q15390 333 aa19.06■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 FBXO47Q5MNV8 452 aa19.06■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 TPCN2Q8NHX9 752 aa19.06■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC35G2Q8TBE7 412 aa19.06■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAXDC2Q96IV6 333 aa19.06■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 OSGEPQ9NPF4 335 aa19.06■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 RNF19AQ9NV58 838 aa19.06■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 DPP3Q9NY33 737 aa19.06■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 ITGA11Q9UKX5 1188 aa19.06■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 OGDHLQ9ULD0 1010 aa19.06■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 IPPQ9Y573 584 aa19.06■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF185O15231 689 aa19.05■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 AKAP5P24588 427 aa19.05■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 GNA15P30679 374 aa19.05■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 ATICP31939 592 aa19.05■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 ASPAP45381 313 aa19.05■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZBTB6Q15916 424 aa19.05■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa19.05■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 WDR72Q3MJ13 1102 aa19.05■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 XKR4Q5GH76 650 aa19.05■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF667Q5HYK9 610 aa19.05■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa19.05■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 RFFLQ8WZ73 363 aa19.05■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 CAPZA3Q96KX2 299 aa19.05■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 DEFB118Q96PH6 123 aa19.05■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 TSPAN18Q96SJ8 248 aa19.05■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRPV6Q9H1D0 765 aa19.05■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 GOLPH3Q9H4A6 298 aa19.05■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 VRTNQ9H8Y1 702 aa19.05■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 ERVK-5Q9HDB9 667 aa19.05■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 CISHQ9NSE2 258 aa19.05■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 SNX12Q9UMY4 172 aa19.05■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 AGAP1Q9UPQ3 857 aa19.05■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 SQORQ9Y6N5 450 aa19.05■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 DNAH12Q6ZR08 3092 aa19.05■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 TADA3O75528 432 aa19.04■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCL5P13501 91 aa19.04■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa19.04■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa19.04■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF394Q53GI3 561 aa19.04■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 USP38Q8NB14 1042 aa19.04■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 PSMB7Q99436 277 aa19.04■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 TLR10Q9BXR5 811 aa19.04■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 PDCL3Q9H2J4 239 aa19.04■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 CFHP08603 1231 aa19.04■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 RAP1GAPP47736 663 aa19.04■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 CDK7P50613 346 aa19.04■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 DNA2P51530 1060 aa19.04■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 LPIN1Q14693 890 aa19.04■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 PTPROQ16827 1216 aa19.04■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF618Q5T7W0 954 aa19.04■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF677Q86XU0 584 aa19.04■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 CEP112Q8N8E3 955 aa19.04■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 OSBPL7Q9BZF2 842 aa19.04■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 RNF208Q9H0X6 261 aa19.04■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 RNF39Q9H2S5 420 aa19.04■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 KLK14Q9P0G3 267 aa19.04■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 PARP2Q9UGN5 583 aa19.04■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 PADI3Q9ULW8 664 aa19.04■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 THAP12O43422 761 aa19.03■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 STAU1O95793 577 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 GHRP10912 638 aa19.03■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 CKBP12277 381 aa19.03■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 KCNE1P15382 129 aa19.03■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF132P52740 706 aa19.03■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 CDH8P55286 799 aa19.03■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 GPC5P78333 572 aa19.03■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 RBP5P82980 135 aa19.03■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 ELF2Q15723 593 aa19.03■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 GLRA4Q5JXX5 417 aa19.03■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 ACAD10Q6JQN1 1059 aa19.03■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 LRRC57Q8N9N7 239 aa19.03■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 HPDLQ96IR7 371 aa19.03■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 EFCAB8A8MWE9 144 aa19.02■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 CD52P31358 61 aa19.02■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 CXCR5P32302 372 aa19.02■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 PAK2Q13177 524 aa19.02■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 MEI1Q5TIA1 1274 aa19.02■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRAF7Q6Q0C0 670 aa19.02■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 PASD1Q8IV76 773 aa19.02■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 CPA5Q8WXQ8 436 aa19.02■□□□□ 0.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 CYFIP2Q96F07 1278 aa19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms