RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558644.2

AKAP13-208, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 1 (best)

Gene AKAP13, Length 1,401 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-208	ENST00000558644	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	GGA3	Q9NZ52	723 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	POGK	Q9P215	609 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	SUN2	Q9UH99	717 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	VAV3	Q9UKW4	847 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	PADI4	Q9UM07	663 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	USP19	O94966	1318 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644		A0A088AWK7	358 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644		A0A0A6YYJ9	748 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644		A0A1W2PQ27	194 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644		A0A1W2PQ64	194 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644		A0A1W2PQC6	194 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644		A0A1W2PQD8	194 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644		F8W8V4	182 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	N4BP3	O15049	544 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	ADAMTS3	O15072	1205 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	COQ9	O75208	318 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	BBOX1	O75936	387 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	MED26	O95402	600 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	PAPLN	O95428	1278 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	MT-ND3	P03897	115 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	SFTPC	P11686	197 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	XBP1	P17861	261 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	PRPH	P41219	470 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	STAT5A	P42229	794 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	TEC	P42680	631 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	SLC6A9	P48067	706 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	LIMK1	P53667	647 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	CYP4F8	P98187	520 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	PRKG1	Q13976	671 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	IRGC	Q6NXR0	463 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	RNF152	Q8N8N0	203 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	UCMA	Q8WVF2	138 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	GAB3	Q8WWW8	586 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	ASB12	Q8WXK4	309 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	TAF4B	Q92750	862 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	ITFG2	Q969R8	447 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	FAM210A	Q96ND0	272 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	HPF1	Q9NWY4	346 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	DACT1	Q9NYF0	836 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	AASS	Q9UDR5	926 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		4.34	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	ZNF839	A8K0R7	811 aa		4.34	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	SRGAP3	O43295	1099 aa		4.34	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	STARD3NL	O95772	234 aa		4.34	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	TGFB1	P01137	390 aa		4.34	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	POLB	P06746	335 aa		4.34	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	ATP1A3	P13637	1013 aa		4.34	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	KRT13	P13646	458 aa		4.34	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	ALOX12	P18054	663 aa		4.34	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	HSPA4	P34932	840 aa		4.34	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	PHKA1	P46020	1223 aa		4.34	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	ANTXR2	P58335	489 aa		4.34	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	UBXN1	Q04323	297 aa		4.34	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	MGAT2	Q10469	447 aa		4.34	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	4.34	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	PMS2P11	Q13670	270 aa		4.34	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		4.34	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		4.34	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	FAM209B	Q5JX69	171 aa		4.34	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	PHF19	Q5T6S3	580 aa		4.34	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		4.34	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	RAPH1	Q70E73	1250 aa		4.34	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	SLC51A	Q86UW1	340 aa		4.34	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	CABP7	Q86V35	215 aa		4.34	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		4.34	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		4.34	□□□□□ -1.71
AKAP13-208	ENST00000558644	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		4.34	□□□□□ -1.71

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