RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557413.5

RPS6KL1-216, Transcript of ribosomal protein S6 kinase like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RPS6KL1, Length 2,425 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1-216ENST00000557413 KIAA1586Q9HCI6 787 aa21.87■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 HOMER2Q9NSB8 354 aa21.87■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa21.86■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 ATP5HO75947 161 aa21.86■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 DSG3P32926 999 aa21.86■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 JAK3P52333 1124 aa21.86■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 LMNB2Q03252 620 aa21.86■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 MAMLD1Q13495 774 aa21.86■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 WDR44Q5JSH3 913 aa21.86■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa21.86■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa21.86■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa21.86■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 DENND1AQ8TEH3 1009 aa21.86■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 ZNF516Q92618 1163 aa21.86■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 LRMDAQ9H2I8 198 aa21.86■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 KIF9Q9HAQ2 790 aa21.86■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa21.86■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 KLHL11Q9NVR0 708 aa21.86■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 CHKBQ9Y259 395 aa21.86■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 USH1CQ9Y6N9 552 aa21.86■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP21.86■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 WFS1O76024 890 aa21.86■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 CFHP08603 1231 aa21.86■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa21.86■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 CPXCR1Q8N123 301 aa21.86■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 GLIS1Q8NBF1 620 aa21.86■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 FAM151AQ8WW52 585 aa21.86■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 SPIRE2Q8WWL2 714 aa21.86■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 CNKSR1Q969H4 720 aa21.86■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 FAXDC2Q96IV6 333 aa21.86■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa21.86■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRT15P19012 456 aa21.85■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 TARSP26639 723 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 HSPA1LP34931 641 aa21.85■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 MOGSQ13724 837 aa21.85■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 BICD1Q96G01 975 aa21.85■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 TTC25Q96NG3 672 aa21.85■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 TMEM237Q96Q45 408 aa21.85■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 SPDYE2BA6NHP3 402 aa21.85■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 TLR3O15455 904 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 SPDYE6P0CI01 402 aa21.85■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 SFNP31947 248 aa21.85■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 PSEN1P49768 467 aa21.85■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 PARP6Q2NL67 630 aa21.85■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 KAZNQ674X7 775 aa21.85■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 TDRPQ86YL5 185 aa21.85■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 LARGE2Q8N3Y3 721 aa21.85■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 TAAR1Q96RJ0 339 aa21.85■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 SMC6Q96SB8 1091 aa21.85■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 DNPEPQ9ULA0 475 aa21.85■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 LIASO43766 372 aa21.84■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa21.84■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRT10P13645 584 aa21.84■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 CETN2P41208 172 aa21.84■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 C4orf33Q8N1A6 199 aa21.84■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 HAO1Q9UJM8 370 aa21.84■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 GRID1Q9ULK0 1009 aa21.84■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 ZNF148Q9UQR1 794 aa21.84■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 PI4K2BG5E9Z4 385 aa21.84■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 GARTP22102 1010 aa21.84■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 CCNG1P51959 295 aa21.84■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 SLC18A1P54219 525 aa21.84■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 NOMO3P69849 1222 aa21.84■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRT76Q01546 638 aa21.84■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 PGM5Q15124 567 aa21.84■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 PDK4Q16654 411 aa21.84■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa21.84■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 SPOPLQ6IQ16 392 aa21.84■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 RGS9BPQ6ZS82 235 aa21.84■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 CAPN12Q6ZSI9 719 aa21.84■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 CDAN1Q8IWY9 1227 aa21.84■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 DCTN3O75935 186 aa21.83■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 NEBLO76041 1014 aa21.83■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 HLA-DRAP01903 254 aa21.83■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 TNNI1P19237 187 aa21.83■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 CDC25CP30307 473 aa21.83■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 ALDH3A1P30838 453 aa21.83■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 ARSEP51690 589 aa21.83■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 LRRC8CQ8TDW0 803 aa21.83■■□□□ 1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 CEP170P1Q96L14 293 aa21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58 ms