RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551473.5

CS-228, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-228ENST00000551473 GREB1Q4ZG55 1949 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 A0A1W2PRU2 124 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 ARHGEF35A5YM69 484 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 RHOBTB1O94844 696 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 C1QTNF9P0C862 333 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 CYP11B2P19099 503 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 MCM4P33991 863 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 ALDH1A3P47895 512 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 AMPD2Q01433 879 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 ELF2Q15723 593 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 CCDC6Q16204 474 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 TXNDC11Q6PKC3 985 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 PADI6Q6TGC4 694 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 CAMKK1Q8N5S9 505 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 ERMNQ8TAM6 284 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 OXER1Q8TDS5 423 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 KIFAP3Q92845 792 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 EXOC4Q96A65 974 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 EDEM2Q9BV94 578 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 RXFP3Q9NSD7 469 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 ASB3Q9Y575 518 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 K7ERI5 159 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 KCNE1P15382 129 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP13.04□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 ZNF568Q3ZCX4 644 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 ALKAL1Q6UXT8 129 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 BEST2Q8NFU1 509 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 BPIFB1Q8TDL5 484 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 BSNDQ8WZ55 320 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 DDX12PQ92771 950 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 ACAP3Q96P50 834 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 TMEM209Q96SK2 561 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 ADAM33Q9BZ11 813 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 GTSE1Q9NYZ3 720 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 CNTN3Q9P232 1028 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 PCDHB8Q9UN66 801 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 NCANO14594 1321 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 CHD6Q8TD26 2715 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 A0A087WWV3 80 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 EXTL3O43909 919 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 EDN1P05305 212 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 MUTP22033 750 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 WEE1P30291 646 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 FOXC1Q12948 553 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 WDR44Q5JSH3 913 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 NT5DC1Q5TFE4 455 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 ITIH5Q86UX2 942 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 C11orf74Q86VG3 221 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 CATSPER3Q86XQ3 398 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 TMC8Q8IU68 726 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 RSPRY1Q96DX4 576 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 GCNAQ96QF7 691 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 TM6SF1Q9BZW5 370 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 CDT1Q9H211 546 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 ATXN3LQ9H3M9 355 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 C2orf42Q9NWW7 574 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 ZMYM5Q9UJ78 669 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 USP20Q9Y2K6 914 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 BAHCC1Q9P281 2608 aa13.02□□□□□ -0.32
CS-228ENST00000551473 OR6C75A6NL08 312 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-228ENST00000551473 SOBPA7XYQ1 873 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-228ENST00000551473 MCF2P10911 925 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-228ENST00000551473 CEACAM1P13688 526 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-228ENST00000551473 PXNP49023 591 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
CS-228ENST00000551473 MCM2P49736 904 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-228ENST00000551473 NR5A1Q13285 461 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-228ENST00000551473 PLK5Q496M5 336 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-228ENST00000551473 GPR158Q5T848 1215 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-228ENST00000551473 USP37Q86T82 979 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-228ENST00000551473 TTC8Q8TAM2 541 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-228ENST00000551473 TBC1D32Q96NH3 1257 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-228ENST00000551473 MTMR9Q96QG7 549 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-228ENST00000551473 LRRC3Q9BY71 257 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-228ENST00000551473 C4orf47A7E2U8 309 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-228ENST00000551473 MED24O75448 989 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-228ENST00000551473 OAZ2O95190 189 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-228ENST00000551473 CAVIN2O95810 425 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-228ENST00000551473 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
CS-228ENST00000551473 RPA1P27694 616 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-228ENST00000551473 CDC25CP30307 473 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-228ENST00000551473 OSTNP61366 133 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-228ENST00000551473 CREB5Q02930 508 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-228ENST00000551473 SCRN1Q12765 414 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-228ENST00000551473 GPR17Q13304 367 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-228ENST00000551473 FBXO43Q4G163 708 aa13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms