RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504936.1

PITX1-204, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

TSL 2

Gene PITX1, Length 770 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-204ENST00000504936 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
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PITX1-204ENST00000504936 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
PITX1-204ENST00000504936 ARHGEF37A1IGU5 675 aa20.54■□□□□ 0.88
PITX1-204ENST00000504936 PDXKO00764 312 aa20.54■□□□□ 0.88
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PITX1-204ENST00000504936 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
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PITX1-204ENST00000504936 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa20.54■□□□□ 0.88
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PITX1-204ENST00000504936 GOLGA6L22H0YM25 854 aa20.5■□□□□ 0.87
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PITX1-204ENST00000504936 ELF1P32519 619 aa20.5■□□□□ 0.87
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PITX1-204ENST00000504936 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.877e-7■■□□□ 12.9
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PITX1-204ENST00000504936 KLHL10Q6JEL2 608 aa20.49■□□□□ 0.87
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PITX1-204ENST00000504936 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PITX1-204ENST00000504936 SLC7A14Q8TBB6 771 aa20.49■□□□□ 0.87
PITX1-204ENST00000504936 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PITX1-204ENST00000504936 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa20.49■□□□□ 0.87
PITX1-204ENST00000504936 NECTIN4Q96NY8 510 aa20.49■□□□□ 0.87
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