RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487548.2

SENP6-210, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-210ENST00000487548 SEPT2Q15019 361 aa4.07□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 PTPRRQ15256 657 aa4.07□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 TOR2AQ5JU69 321 aa4.07□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 MORN5Q5VZ52 161 aa4.07□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 AWAT2Q6E213 333 aa4.07□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 NEK8Q86SG6 692 aa4.07□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 SYNPOQ8N3V7 929 aa4.07□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa4.07□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 USP7Q93009 1102 aa4.07□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 ACAP3Q96P50 834 aa4.07□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 ANLNQ9NQW6 1124 aa4.07□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 FAM30AQ9NZY2 134 aa4.07□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 SH3BP4Q9P0V3 963 aa4.07□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 ZNF580Q9UK33 172 aa4.07□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 DNM3Q9UQ16 869 aa4.07□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 BTBD3Q9Y2F9 522 aa4.07□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 GOLGA8AA7E2F4 631 aa4.06□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 ENDOD1O94919 500 aa4.06□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 AGFG2O95081 481 aa4.06□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 SLC6A9P48067 706 aa4.06□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 CCT8P50990 548 aa4.06□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP4.06□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 ZNF844Q08AG5 666 aa4.06□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 MTM1Q13496 603 aa4.06□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 MUM1Q2TAK8 710 aa4.06□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 SLC18B1Q6NT16 456 aa4.06□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 HOMER1Q86YM7 354 aa4.06□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 ADGRG5Q8IZF4 528 aa4.06□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 SNX19Q92543 992 aa4.06□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 RAB24Q969Q5 203 aa4.06□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 FANCLQ9NW38 375 aa4.06□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 SERGEFQ9UGK8 458 aa4.06□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 SCOCQ9UIL1 159 aa4.06□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 H3BNC9 293 aa4.05□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 MOSPD3O75425 235 aa4.05□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 HAUS5O94927 633 aa4.05□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 AMY1AP04745 511 aa4.05□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 SNHG28P0DPA3 235 aa4.05□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 DDCP20711 480 aa4.05□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 DRD4P21917 467 aa4.05□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 SLC6A4P31645 630 aa4.05□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 SCAND1P57086 179 aa4.05□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 CEP78Q5JTW2 689 aa4.05□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 CNGA4Q8IV77 575 aa4.05□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 ADAMTS15Q8TE58 950 aa4.05□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa4.05□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 KCNU1A8MYU2 1149 aa4.04□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 TARM1B6A8C7 271 aa4.04□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 NEMP1O14524 444 aa4.04□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 PPEF2O14830 753 aa4.04□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 OSMP13725 252 aa4.04□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 ARHGAP25P42331 645 aa4.04□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 MCAMP43121 646 aa4.04□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 MMP13P45452 471 aa4.04□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 MALLQ13021 153 aa4.04□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 DYRK1AQ13627 763 aa4.04□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 RABEP1Q15276 862 aa4.04□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 C16orf86Q6ZW13 317 aa4.04□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 OR2I1PQ8NGU4 316 aa4.04□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 DPF2Q92785 391 aa4.04□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 CAMKK2Q96RR4 588 aa4.04□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa4.04□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 ADGRA2Q96PE1 1338 aa4.03□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 PPP6CO00743 305 aa4.03□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 SUN1O94901 812 aa4.03□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 CERS1P27544 350 aa4.03□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 SESN3P58005 492 aa4.03□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 ITIH3Q06033 890 aa4.03□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 SLC44A4Q53GD3 710 aa4.03□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 APPBP2Q92624 585 aa4.03□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 ADGRE3Q9BY15 652 aa4.03□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 IMPG2Q9BZV3 1241 aa4.03□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 KLC4Q9NSK0 619 aa4.03□□□□□ -1.76
SENP6-210ENST00000487548 CCDC187A0A096LP49 1063 aa4.02□□□□□ -1.77
SENP6-210ENST00000487548 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa4.02□□□□□ -1.77
SENP6-210ENST00000487548 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
SENP6-210ENST00000487548 SBK3P0C264 359 aa4.02□□□□□ -1.77
SENP6-210ENST00000487548 MTHFD2P13995 350 aa4.02□□□□□ -1.77
SENP6-210ENST00000487548 LRRC41Q15345 812 aa4.02□□□□□ -1.77
SENP6-210ENST00000487548 ATP2B3Q16720 1220 aa4.02□□□□□ -1.77
SENP6-210ENST00000487548 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa4.02□□□□□ -1.77
SENP6-210ENST00000487548 RHOT1Q8IXI2 618 aa4.02□□□□□ -1.77
SENP6-210ENST00000487548 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa4.02□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms