RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 CCDC80Q76M96 950 aa8.2□□□□□ -1.1
USP4-211ENST00000485450 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP8.2□□□□□ -1.1
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USP4-211ENST00000485450 TMBIM4Q9HC24 238 aa8.2□□□□□ -1.1
USP4-211ENST00000485450 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa8.2□□□□□ -1.1
USP4-211ENST00000485450 C17orf102A2RUQ5 167 aa8.2□□□□□ -1.1
USP4-211ENST00000485450 LRRD1A4D1F6 860 aa8.2□□□□□ -1.1
USP4-211ENST00000485450 GOLGA6L10A6NI86 522 aa8.2□□□□□ -1.1
USP4-211ENST00000485450 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
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USP4-211ENST00000485450 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
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USP4-211ENST00000485450 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
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USP4-211ENST00000485450 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa8.2□□□□□ -1.1
USP4-211ENST00000485450 STARD7Q9NQZ5 370 aa8.2□□□□□ -1.1
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USP4-211ENST00000485450 ATP2C2O75185 946 aa8.19□□□□□ -1.1
USP4-211ENST00000485450 EYA4O95677 639 aa8.19□□□□□ -1.1
USP4-211ENST00000485450 CKBP12277 381 aa8.19□□□□□ -1.1
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USP4-211ENST00000485450 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa8.19□□□□□ -1.1
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USP4-211ENST00000485450 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa8.19□□□□□ -1.1
USP4-211ENST00000485450 PDXDC2PQ6P474 469 aa8.19□□□□□ -1.1
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USP4-211ENST00000485450 MAIP1Q8WWC4 291 aa8.19□□□□□ -1.1
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USP4-211ENST00000485450 CAMK2BQ13554 666 aa8.19□□□□□ -1.1
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USP4-211ENST00000485450 NFIL3Q16649 462 aa8.19□□□□□ -1.1
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USP4-211ENST00000485450 EFCAB14O75071 495 aa8.18□□□□□ -1.1
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USP4-211ENST00000485450 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
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USP4-211ENST00000485450 KRT83P78385 493 aa8.18□□□□□ -1.1
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