RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482333.5

USP13-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 13, humanhuman

TSL 5

Gene USP13, Length 1,966 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13-202ENST00000482333 ZNF606Q8WXB4 792 aa23.23■■□□□ 1.31
USP13-202ENST00000482333 ZSWIM1Q9BR11 485 aa23.23■■□□□ 1.31
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USP13-202ENST00000482333 TRIP11Q15643 1979 aa23.22■■□□□ 1.31
USP13-202ENST00000482333 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
USP13-202ENST00000482333 COMTP21964 271 aa23.22■■□□□ 1.31
USP13-202ENST00000482333 RRM1P23921 792 aa23.22■■□□□ 1.31
USP13-202ENST00000482333 FLT3LGP49771 235 aa23.22■■□□□ 1.31
USP13-202ENST00000482333 GUCY2FP51841 1108 aa23.22■■□□□ 1.31
USP13-202ENST00000482333 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa23.22■■□□□ 1.31
USP13-202ENST00000482333 LLGL2Q6P1M3 1020 aa23.22■■□□□ 1.31
USP13-202ENST00000482333 TMEM40Q8WWA1 233 aa23.22■■□□□ 1.31
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USP13-202ENST00000482333 HINFPQ9BQA5 517 aa23.22■■□□□ 1.31
USP13-202ENST00000482333 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP23.22■■□□□ 1.312e-6■■□□□ 12.6
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USP13-202ENST00000482333 CXCL16Q9H2A7 254 aa23.22■■□□□ 1.31
USP13-202ENST00000482333 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
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USP13-202ENST00000482333 RAP1GAPP47736 663 aa23.21■■□□□ 1.31
USP13-202ENST00000482333 CAP1Q01518 475 aa23.21■■□□□ 1.31
USP13-202ENST00000482333 WDR72Q3MJ13 1102 aa23.21■■□□□ 1.31
USP13-202ENST00000482333 CCDC70Q6NSX1 233 aa23.21■■□□□ 1.31
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USP13-202ENST00000482333 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
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USP13-202ENST00000482333 ERLIN1O75477 346 aa23.21■■□□□ 1.31
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USP13-202ENST00000482333 ZNF667Q5HYK9 610 aa23.21■■□□□ 1.31
USP13-202ENST00000482333 SLC27A1Q6PCB7 646 aa23.21■■□□□ 1.31
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USP13-202ENST00000482333 C2CD2Q9Y426 696 aa23.21■■□□□ 1.31
USP13-202ENST00000482333 MYBL1P10243 752 aa23.2■■□□□ 1.3
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USP13-202ENST00000482333 TRIM32Q13049 653 aa23.2■■□□□ 1.3
USP13-202ENST00000482333 SNX17Q15036 470 aa23.2■■□□□ 1.3
USP13-202ENST00000482333 MFSD14CQ5VZR4 134 aa23.2■■□□□ 1.3
USP13-202ENST00000482333 C8orf74Q6P047 294 aa23.2■■□□□ 1.3
USP13-202ENST00000482333 C7orf31Q8N865 590 aa23.2■■□□□ 1.3
USP13-202ENST00000482333 TRIM7Q9C029 511 aa23.2■■□□□ 1.3
USP13-202ENST00000482333 SDCBP2Q9H190 292 aa23.2■■□□□ 1.3
USP13-202ENST00000482333 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
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USP13-202ENST00000482333 PRKCZQ05513 592 aa23.2■■□□□ 1.3
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USP13-202ENST00000482333 CD101Q93033 1021 aa23.2■■□□□ 1.3
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USP13-202ENST00000482333 KRT12Q99456 494 aa23.2■■□□□ 1.3
USP13-202ENST00000482333 C11orf70Q9BRQ4 267 aa23.2■■□□□ 1.3
USP13-202ENST00000482333 AP1M1Q9BXS5 423 aa23.2■■□□□ 1.3
USP13-202ENST00000482333 CARD9Q9H257 536 aa23.2■■□□□ 1.3
USP13-202ENST00000482333 SNTG2Q9NY99 539 aa23.2■■□□□ 1.3
USP13-202ENST00000482333 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
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USP13-202ENST00000482333 MCM3P25205 808 aa23.19■■□□□ 1.3
USP13-202ENST00000482333 PTP4A2Q12974 167 aa23.19■■□□□ 1.3
USP13-202ENST00000482333 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP23.19■■□□□ 1.3
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USP13-202ENST00000482333 SMYD3Q9H7B4 428 aa23.19■■□□□ 1.3
USP13-202ENST00000482333 DPP3Q9NY33 737 aa23.19■■□□□ 1.3
USP13-202ENST00000482333 OGFRQ9NZT2 677 aa23.19■■□□□ 1.3
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USP13-202ENST00000482333 L1RE1Q9UN81 338 aa23.19■■□□□ 1.3
USP13-202ENST00000482333 HES2Q9Y543 173 aa23.19■■□□□ 1.3
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USP13-202ENST00000482333 ALDH1A1P00352 501 aa23.18■■□□□ 1.3
USP13-202ENST00000482333 PGK1P00558 417 aa23.18■■□□□ 1.3
USP13-202ENST00000482333 MYBL2P10244 700 aa23.18■■□□□ 1.3
USP13-202ENST00000482333 ATICP31939 592 aa23.18■■□□□ 1.3
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USP13-202ENST00000482333 PEX5P50542 639 aa23.18■■□□□ 1.3
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USP13-202ENST00000482333 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
USP13-202ENST00000482333 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
USP13-202ENST00000482333 CD302Q8IX05 232 aa23.18■■□□□ 1.3
USP13-202ENST00000482333 HPDLQ96IR7 371 aa23.18■■□□□ 1.3
USP13-202ENST00000482333 FAXDC2Q96IV6 333 aa23.18■■□□□ 1.3
USP13-202ENST00000482333 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
USP13-202ENST00000482333 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
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