RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476423.5

SZRD1-208, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene SZRD1, Length 567 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-208ENST00000476423 C6orf50Q9HD87 102 aa8.7□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa8.7□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 CHMP5Q9NZZ3 219 aa8.7□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 ADAM28Q9UKQ2 775 aa8.7□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 LAMA1P25391 3075 aa8.7□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa8.7□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 WDR27A2RRH5 827 aa8.69□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 HEPACAM2A8MVW5 462 aa8.69□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 HLA-EP13747 358 aa8.69□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 CD59P13987 128 aa8.69□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 CEBPBP17676 345 aa8.69□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 ELF1P32519 619 aa8.69□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 DNM2P50570 870 aa8.69□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 JAK3P52333 1124 aa8.69□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 RCAN1P53805 252 aa8.69□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 NPEPPSP55786 919 aa8.69□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 RAB33AQ14088 237 aa8.69□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 BMP2KLQ5H9B9 411 aa8.69□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 CATSPER4Q7RTX7 472 aa8.69□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 MIER3Q7Z3K6 550 aa8.69□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 RHPN2Q8IUC4 686 aa8.69□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 ELMOD1Q8N336 334 aa8.69□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 TBCKQ8TEA7 893 aa8.69□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 ACDQ96AP0 544 aa8.69□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 RIT2Q99578 217 aa8.69□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 TTPALQ9BTX7 342 aa8.69□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 TEKT3Q9BXF9 490 aa8.69□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 GPR62Q9BZJ7 368 aa8.69□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 GLT8D2Q9H1C3 349 aa8.69□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 IFT122Q9HBG6 1241 aa8.69□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 SEPT3Q9UH03 358 aa8.69□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 VAV3Q9UKW4 847 aa8.69□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 HES2Q9Y543 173 aa8.69□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 SNX14Q9Y5W7 946 aa8.69□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 THADAQ6YHU6 1953 aa8.69□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 KALRNO60229 2985 aa8.69□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 VWA8A3KMH1 1905 aa8.68□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa8.68□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 M0R2N6 131 aa8.68□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 SH3BP5O60239 455 aa8.68□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 MAFO75444 373 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 CFIP05156 583 aa8.68□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 SERPINF2P08697 491 aa8.68□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 HOXC13P31276 330 aa8.68□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 MLH1P40692 756 aa8.68□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 SOX9P48436 509 aa8.68□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 CCT2P78371 535 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 PLCB2Q00722 1185 aa8.68□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 DSC1Q08554 894 aa8.68□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 FCHO2Q0JRZ9 810 aa8.68□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 PSMD5Q16401 504 aa8.68□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 SLC5A9Q2M3M2 681 aa8.68□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 PRSS36Q5K4E3 855 aa8.68□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 RNF20Q5VTR2 975 aa8.68□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 IQCEQ6IPM2 695 aa8.68□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 TXNDC11Q6PKC3 985 aa8.68□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 MINDY1Q8N5J2 469 aa8.68□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 RABGGTAQ92696 567 aa8.68□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 TMEM143Q96AN5 459 aa8.68□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 ZFP42Q96MM3 310 aa8.68□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 HHIPQ96QV1 700 aa8.68□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 NRBP2Q9NSY0 501 aa8.68□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 DNMT3LQ9UJW3 386 aa8.68□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 TPCN1Q9ULQ1 816 aa8.68□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 DPYSL4O14531 572 aa8.67□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 TRAK2O60296 914 aa8.67□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 ITGA4P13612 1032 aa8.67□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 DRD1P21728 446 aa8.67□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 PTPRBP23467 1997 aa8.67□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 ADSSP30520 456 aa8.67□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 SFNP31947 248 aa8.67□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 VIPR2P41587 438 aa8.67□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 SCNN1GP51170 649 aa8.67□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 TSGA10IPQ3SY00 556 aa8.67□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 Q4G0T1 1027 aa8.67□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 PKDCCQ504Y2 493 aa8.67□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 XKR3Q5GH77 459 aa8.67□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 TMEM196Q5HYL7 178 aa8.67□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 WDR44Q5JSH3 913 aa8.67□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 PCSK4Q6UW60 755 aa8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms