RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474160.1

SYF2-203, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 2

Gene SYF2, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-203ENST00000474160 KCTD10Q9H3F6 313 aa20.47■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa20.47■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 I3L4J1 428 aa20.46■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 CALUO43852 315 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 KINO60870 393 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 TMEM191BP0C7N4 346 aa20.46■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 ODC1P11926 461 aa20.46■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 RPL17P18621 184 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 PSMD6Q15008 389 aa20.46■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 SV2CQ496J9 727 aa20.46■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 COBLL1Q53SF7 1204 aa20.46■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 USP37Q86T82 979 aa20.46■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 KREMEN2Q8NCW0 462 aa20.46■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 SPATA20Q8TB22 786 aa20.46■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 DMAC2Q9NW81 257 aa20.46■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 EXOC3O60645 756 aa20.45■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 CYP11A1P05108 521 aa20.45■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP20.45■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 OR1D2P34982 312 aa20.45■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 UBE2HP62256 183 aa20.45■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 DUOXA2Q1HG44 320 aa20.45■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 LIN9Q5TKA1 542 aa20.45■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 TPGS2Q68CL5 300 aa20.45■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 CCDC149Q6ZUS6 474 aa20.45■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 PALB2Q86YC2 1186 aa20.45■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 CBWD2Q8IUF1 395 aa20.45■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 GJD3Q8N144 294 aa20.45■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa20.45■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 SPATA18Q8TC71 538 aa20.45■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 FNBP1Q96RU3 617 aa20.45■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 PDE11AQ9HCR9 933 aa20.45■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 INTS13Q9NVM9 706 aa20.45■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 NR2E1Q9Y466 385 aa20.45■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 CDY1Q9Y6F8 540 aa20.45■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 OR6C75A6NL08 312 aa20.44■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 CLIC2O15247 247 aa20.44■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 MAPK13O15264 365 aa20.44■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 ZMYND10O75800 440 aa20.44■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 TNNC2P02585 160 aa20.44■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 CYP2J2P51589 502 aa20.44■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 GUCY2FP51841 1108 aa20.44■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 AP3M2P53677 418 aa20.44■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 RBP5P82980 135 aa20.44■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 CYP24A1Q07973 514 aa20.44■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 CTXN3Q4LDR2 81 aa20.44■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 CLEC17AQ6ZS10 378 aa20.44■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 C1orf127Q8N9H9 656 aa20.44■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 ZNF461Q8TAF7 563 aa20.44■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 SMARCE1Q969G3 411 aa20.44■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 SENP8Q96LD8 212 aa20.44■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 MFSD14AQ96MC6 490 aa20.44■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 USTQ9Y2C2 406 aa20.44■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 LOC730098B7Z3J9 87 aa20.43■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 ABLIM3O94929 683 aa20.43■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 RPL13P26373 211 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 PPP1R2P41236 205 aa20.43■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 ENPEPQ07075 957 aa20.43■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 PNOCQ13519 176 aa20.43■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 METTL23Q86XA0 190 aa20.43■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 CGRRF1Q99675 332 aa20.43■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 PRKD2Q9BZL6 878 aa20.43■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 FBXL5Q9UKA1 691 aa20.43■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 PLXNA3P51805 1871 aa20.43■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa20.42■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 KPNA7A9QM74 516 aa20.42■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 NR3C1P04150 777 aa20.42■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 ITGB3P05106 788 aa20.42■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 ATF2P15336 505 aa20.42■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 WNT7BP56706 349 aa20.42■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 ROR1Q01973 937 aa20.42■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 MYO1EQ12965 1108 aa20.42■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 OVOS1Q6IE37 1185 aa20.42■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 TMC5Q6UXY8 1006 aa20.42■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 GLYCTKQ8IVS8 523 aa20.42■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa20.42■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 GDAP2Q9NXN4 497 aa20.42■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa20.42■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 PPEF2O14830 753 aa20.41■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 ADAM12O43184 909 aa20.41■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 XYLBO75191 536 aa20.41■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 C8AP07357 584 aa20.41■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 TNNI1P19237 187 aa20.41■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 ELF1P32519 619 aa20.41■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 SMARCB1Q12824 385 aa20.41■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 EDRF1Q3B7T1 1238 aa20.41■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 PPM1LQ5SGD2 360 aa20.41■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
SYF2-203ENST00000474160 TCEAL8Q8IYN2 117 aa20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 134.2 ms