RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464395.1

PITRM1-209, Transcript of pitrilysin metallopeptidase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PITRM1, Length 3,240 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1-209ENST00000464395 PICK1Q9NRD5 415 aa11.66□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 KCNG1Q9UIX4 513 aa11.66□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 RASSF9O75901 435 aa11.66□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 ERLIN2O94905 339 aa11.66□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 CREB1P16220 341 aa11.66□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 PTPN7P35236 360 aa11.66□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 RFC5P40937 340 aa11.66□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 PIK3CAP42336 1068 aa11.66□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 LLGL1Q15334 1064 aa11.66□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 GNPTABQ3T906 1256 aa11.66□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 ZPBP2Q6X784 338 aa11.66□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 EXD1Q8NHP7 514 aa11.66□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 CXorf38Q8TB03 319 aa11.66□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 SNF8Q96H20 258 aa11.66□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 PWWP2AQ96N64 755 aa11.66□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 ASAP2O43150 1006 aa11.65□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 LGR5O75473 907 aa11.65□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 ITGA8P53708 1063 aa11.65□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 NOP14P78316 857 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 SP4Q02446 784 aa11.65□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 MPP2Q14168 576 aa11.65□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 SEZ6Q53EL9 994 aa11.65□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 RIOX2Q8IUF8 465 aa11.65□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 GLIS1Q8NBF1 620 aa11.65□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 ZNF606Q8WXB4 792 aa11.65□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 CHMP6Q96FZ7 201 aa11.65□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 XYLT2Q9H1B5 865 aa11.65□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa11.65□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 LGALS13Q9UHV8 139 aa11.65□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 ARIH2O95376 493 aa11.65□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 TTC4O95801 387 aa11.65□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 LDHAP00338 332 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 GNA15P30679 374 aa11.65□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 SNX1Q13596 522 aa11.65□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 PLCB4Q15147 1175 aa11.65□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa11.65□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 CYP4X1Q8N118 509 aa11.65□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 ATL2Q8NHH9 583 aa11.65□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 BICD1Q96G01 975 aa11.65□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 C11orf70Q9BRQ4 267 aa11.65□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 NINJ2Q9NZG7 142 aa11.65□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa11.65□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 EVPLQ92817 2033 aa11.65□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 K7ERI5 159 aa11.65□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 HOXC6P09630 235 aa11.65□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 TNNI1P19237 187 aa11.65□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 MCL1Q07820 350 aa11.65□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa11.65□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 FBXW10Q5XX13 1052 aa11.65□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 TMEM270Q6UE05 265 aa11.65□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa11.65□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 PASD1Q8IV76 773 aa11.65□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa11.65□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 SERPINB12Q96P63 405 aa11.65□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 MSTO1Q9BUK6 570 aa11.65□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 GPRC5DQ9NZD1 345 aa11.65□□□□□ -0.54
PITRM1-209ENST00000464395 IRF6O14896 467 aa11.64□□□□□ -0.55
PITRM1-209ENST00000464395 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PITRM1-209ENST00000464395 ASPAP45381 313 aa11.64□□□□□ -0.55
PITRM1-209ENST00000464395 NSFP46459 744 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PITRM1-209ENST00000464395 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PITRM1-209ENST00000464395 IFFO1Q0D2I5 559 aa11.64□□□□□ -0.55
PITRM1-209ENST00000464395 IFT88Q13099 833 aa11.64□□□□□ -0.55
PITRM1-209ENST00000464395 TAZQ16635 292 aa11.64□□□□□ -0.55
PITRM1-209ENST00000464395 WDR44Q5JSH3 913 aa11.64□□□□□ -0.55
PITRM1-209ENST00000464395 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa11.64□□□□□ -0.55
PITRM1-209ENST00000464395 ARMC9Q7Z3E5 817 aa11.64□□□□□ -0.55
PITRM1-209ENST00000464395 PRUNE1Q86TP1 453 aa11.64□□□□□ -0.55
PITRM1-209ENST00000464395 WDR49Q8IV35 697 aa11.64□□□□□ -0.55
PITRM1-209ENST00000464395 RHOT1Q8IXI2 618 aa11.64□□□□□ -0.55
PITRM1-209ENST00000464395 MICALL1Q8N3F8 863 aa11.64□□□□□ -0.55
PITRM1-209ENST00000464395 NIPA2Q8N8Q9 360 aa11.64□□□□□ -0.55
PITRM1-209ENST00000464395 FEZF2Q8TBJ5 459 aa11.64□□□□□ -0.55
PITRM1-209ENST00000464395 SLITRK1Q96PX8 696 aa11.64□□□□□ -0.55
PITRM1-209ENST00000464395 FOXO6A8MYZ6 492 aa11.64□□□□□ -0.55
PITRM1-209ENST00000464395 ZBTB7AO95365 584 aa11.64□□□□□ -0.55
PITRM1-209ENST00000464395 STRN3Q13033 797 aa11.64□□□□□ -0.55
PITRM1-209ENST00000464395 NCOA4Q13772 614 aa11.64□□□□□ -0.55
PITRM1-209ENST00000464395 DLK2Q6UY11 383 aa11.64□□□□□ -0.55
PITRM1-209ENST00000464395 MAIP1Q8WWC4 291 aa11.64□□□□□ -0.55
PITRM1-209ENST00000464395 TFAP2BQ92481 460 aa11.64□□□□□ -0.55
PITRM1-209ENST00000464395 OSBPL8Q9BZF1 889 aa11.64□□□□□ -0.55
PITRM1-209ENST00000464395 ADAM22Q9P0K1 906 aa11.64□□□□□ -0.55
PITRM1-209ENST00000464395 PCDHGC3Q9UN70 934 aa11.64□□□□□ -0.55
PITRM1-209ENST00000464395 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa11.64□□□□□ -0.55
PITRM1-209ENST00000464395 RASGRF2O14827 1237 aa11.64□□□□□ -0.55
PITRM1-209ENST00000464395 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms