RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458294.5

PBRM1-218, Transcript of polybromo 1, humanhuman

TSL 3

Gene PBRM1, Length 476 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1-218ENST00000458294 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
PBRM1-218ENST00000458294 MCL1Q07820 350 aa28.75■■■□□ 2.19
PBRM1-218ENST00000458294 PPP2R5DQ14738 602 aa28.75■■■□□ 2.19
PBRM1-218ENST00000458294 SEZ6Q53EL9 994 aa28.75■■■□□ 2.19
PBRM1-218ENST00000458294 HYIQ5T013 277 aa28.75■■■□□ 2.19
PBRM1-218ENST00000458294 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa28.75■■■□□ 2.19
PBRM1-218ENST00000458294 BEST2Q8NFU1 509 aa28.75■■■□□ 2.19
PBRM1-218ENST00000458294 FAM3CQ92520 227 aa28.75■■■□□ 2.19
PBRM1-218ENST00000458294 ZSWIM3Q96MP5 696 aa28.75■■■□□ 2.19
PBRM1-218ENST00000458294 GPR88Q9GZN0 384 aa28.75■■■□□ 2.19
PBRM1-218ENST00000458294 GPR179Q6PRD1 2367 aa28.74■■■□□ 2.19
PBRM1-218ENST00000458294 M0QZQ0 153 aa28.74■■■□□ 2.19
PBRM1-218ENST00000458294 MAPTP10636 758 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
PBRM1-218ENST00000458294 MYL4P12829 197 aa28.74■■■□□ 2.19
PBRM1-218ENST00000458294 LRPAP1P30533 357 aa28.74■■■□□ 2.19
PBRM1-218ENST00000458294 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
PBRM1-218ENST00000458294 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
PBRM1-218ENST00000458294 KCND2Q9NZV8 630 aa28.74■■■□□ 2.19
PBRM1-218ENST00000458294 CEP250Q9BV73 2442 aa28.74■■■□□ 2.19
PBRM1-218ENST00000458294 OAZ2O95190 189 aa28.73■■■□□ 2.19
PBRM1-218ENST00000458294 CXCL8P10145 99 aa28.73■■■□□ 2.19
PBRM1-218ENST00000458294 NRLP54845 237 aa28.73■■■□□ 2.19
PBRM1-218ENST00000458294 PLD1Q13393 1074 aa28.73■■■□□ 2.19
PBRM1-218ENST00000458294 E2F7Q96AV8 911 aa28.73■■■□□ 2.19
PBRM1-218ENST00000458294 YIPF1Q9Y548 306 aa28.73■■■□□ 2.19
PBRM1-218ENST00000458294 PIAS3Q9Y6X2 628 aa28.73■■■□□ 2.19
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF263O14978 683 aa28.72■■■□□ 2.19
PBRM1-218ENST00000458294 CLTAP09496 248 aa28.72■■■□□ 2.19
PBRM1-218ENST00000458294 VIPR2P41587 438 aa28.72■■■□□ 2.19
PBRM1-218ENST00000458294 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa28.72■■■□□ 2.19
PBRM1-218ENST00000458294 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
PBRM1-218ENST00000458294 MFSD6LQ8IWD5 586 aa28.72■■■□□ 2.19
PBRM1-218ENST00000458294 TTC26A0AVF1 554 aa28.71■■■□□ 2.19
PBRM1-218ENST00000458294 H0YCG3 227 aa28.71■■■□□ 2.19
PBRM1-218ENST00000458294 TDGF1P13385 188 aa28.71■■■□□ 2.19
PBRM1-218ENST00000458294 GJA1P17302 382 aa28.71■■■□□ 2.19
PBRM1-218ENST00000458294 CYP3A5P20815 502 aa28.71■■■□□ 2.19
PBRM1-218ENST00000458294 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP28.71■■■□□ 2.19
PBRM1-218ENST00000458294 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP28.71■■■□□ 2.19
PBRM1-218ENST00000458294 CCR3P51677 355 aa28.71■■■□□ 2.19
PBRM1-218ENST00000458294 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
PBRM1-218ENST00000458294 TEAD2Q15562 447 aa28.71■■■□□ 2.19
PBRM1-218ENST00000458294 KIF12Q96FN5 646 aa28.71■■■□□ 2.19
PBRM1-218ENST00000458294 MSANTD3Q96H12 275 aa28.71■■■□□ 2.19
PBRM1-218ENST00000458294 PNMA5Q96PV4 448 aa28.71■■■□□ 2.19
PBRM1-218ENST00000458294 LMAN1LQ9HAT1 526 aa28.71■■■□□ 2.19
PBRM1-218ENST00000458294 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
PBRM1-218ENST00000458294 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
PBRM1-218ENST00000458294 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa28.7■■■□□ 2.18
PBRM1-218ENST00000458294 XPOTO43592 962 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
PBRM1-218ENST00000458294 ARHGAP8P85298 464 aa28.7■■■□□ 2.18
PBRM1-218ENST00000458294 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
PBRM1-218ENST00000458294 LMNB2Q03252 620 aa28.7■■■□□ 2.18
PBRM1-218ENST00000458294 ZBTB6Q15916 424 aa28.7■■■□□ 2.18
PBRM1-218ENST00000458294 KYAT1Q16773 422 aa28.7■■■□□ 2.18
PBRM1-218ENST00000458294 RILPL1Q5EBL4 403 aa28.7■■■□□ 2.18
PBRM1-218ENST00000458294 C1orf228Q6PIY5 440 aa28.7■■■□□ 2.18
PBRM1-218ENST00000458294 SHKBP1Q8TBC3 707 aa28.7■■■□□ 2.18
PBRM1-218ENST00000458294 KCNN1Q92952 543 aa28.7■■■□□ 2.18
PBRM1-218ENST00000458294 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa28.7■■■□□ 2.18
PBRM1-218ENST00000458294 F5P12259 2224 aa28.69■■■□□ 2.18
PBRM1-218ENST00000458294 OR6C75A6NL08 312 aa28.69■■■□□ 2.18
PBRM1-218ENST00000458294 HEPACAM2A8MVW5 462 aa28.69■■■□□ 2.18
PBRM1-218ENST00000458294 ARNTLO00327 626 aa28.69■■■□□ 2.18
PBRM1-218ENST00000458294 SLC12A3P55017 1021 aa28.69■■■□□ 2.18
PBRM1-218ENST00000458294 NCKAP1LP55160 1127 aa28.69■■■□□ 2.18
PBRM1-218ENST00000458294 PPP2R3AQ06190 1150 aa28.69■■■□□ 2.18
PBRM1-218ENST00000458294 SPAG1Q07617 926 aa28.69■■■□□ 2.18
PBRM1-218ENST00000458294 USP37Q86T82 979 aa28.69■■■□□ 2.18
PBRM1-218ENST00000458294 BICD1Q96G01 975 aa28.69■■■□□ 2.18
PBRM1-218ENST00000458294 LRRC3Q9BY71 257 aa28.69■■■□□ 2.18
PBRM1-218ENST00000458294 HAPLN2Q9GZV7 340 aa28.69■■■□□ 2.18
PBRM1-218ENST00000458294 GMEB2Q9UKD1 530 aa28.69■■■□□ 2.18
PBRM1-218ENST00000458294 KIF3AQ9Y496 699 aa28.69■■■□□ 2.18
PBRM1-218ENST00000458294 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
PBRM1-218ENST00000458294 NCANO14594 1321 aa28.69■■■□□ 2.18
PBRM1-218ENST00000458294 VNN2O95498 520 aa28.68■■■□□ 2.18
PBRM1-218ENST00000458294 PLA2G4BP0C869 781 aa28.68■■■□□ 2.18
PBRM1-218ENST00000458294 GPR17Q13304 367 aa28.68■■■□□ 2.18
PBRM1-218ENST00000458294 ERICH6BQ5W0A0 696 aa28.68■■■□□ 2.18
PBRM1-218ENST00000458294 TMC8Q8IU68 726 aa28.68■■■□□ 2.18
PBRM1-218ENST00000458294 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa28.68■■■□□ 2.18
PBRM1-218ENST00000458294 PGLYRP2Q96PD5 576 aa28.68■■■□□ 2.18
PBRM1-218ENST00000458294 TSPAN18Q96SJ8 248 aa28.68■■■□□ 2.18
PBRM1-218ENST00000458294 OR4Q2P0C623 313 aa28.67■■■□□ 2.18
PBRM1-218ENST00000458294 CHRNB1P11230 501 aa28.67■■■□□ 2.18
PBRM1-218ENST00000458294 EPHB3P54753 998 aa28.67■■■□□ 2.18
PBRM1-218ENST00000458294 DSTYKQ6XUX3 929 aa28.67■■■□□ 2.18
PBRM1-218ENST00000458294 YAF2Q8IY57 180 aa28.67■■■□□ 2.18
PBRM1-218ENST00000458294 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa28.67■■■□□ 2.18
PBRM1-218ENST00000458294 KIF2CQ99661 725 aa28.67■■■□□ 2.18
PBRM1-218ENST00000458294 DNAJC25Q9H1X3 360 aa28.67■■■□□ 2.18
PBRM1-218ENST00000458294 RAB23Q9ULC3 237 aa28.67■■■□□ 2.18
PBRM1-218ENST00000458294 A0A1W2PRU2 124 aa28.66■■■□□ 2.18
PBRM1-218ENST00000458294 CHADO15335 359 aa28.66■■■□□ 2.18
PBRM1-218ENST00000458294 TYMPP19971 482 aa28.66■■■□□ 2.18
PBRM1-218ENST00000458294 SCP2P22307 547 aa28.66■■■□□ 2.18
PBRM1-218ENST00000458294 CCNE1P24864 410 aa28.66■■■□□ 2.18
PBRM1-218ENST00000458294 TNFSF9P41273 254 aa28.66■■■□□ 2.18
PBRM1-218ENST00000458294 ALDH1A3P47895 512 aa28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.6 ms