RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP15.83■□□□□ 0.121e-6■■□□□ 13.6
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF341Q9BYN7 854 aa15.83■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 TRABDQ9H4I3 376 aa15.83■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 HSPBP1Q9NZL4 362 aa15.83■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 NPTXRO95502 500 aa15.82■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 GCAP28676 217 aa15.82■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 CAP2P40123 477 aa15.82■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 SLC1A1P43005 524 aa15.82■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 CCNG2Q16589 344 aa15.82■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP15.82■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 DNAJC9Q8WXX5 260 aa15.82■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 KIFAP3Q92845 792 aa15.82■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 TLE6Q9H808 572 aa15.82■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 STK32BQ9NY57 414 aa15.82■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 SENP1Q9P0U3 644 aa15.82■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 NFIBO00712 420 aa15.82■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 MAPTP10636 758 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 KLC1Q07866 573 aa15.82■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa15.82■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa15.82■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 TTC8Q8TAM2 541 aa15.82■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 GMLQ99445 158 aa15.82■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 WDR11Q9BZH6 1224 aa15.82■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 DCLRE1BQ9H816 532 aa15.82■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 H0Y3Z8 333 aa15.81■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 GRIN3BO60391 1043 aa15.81■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 CBX6O95503 412 aa15.81■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 PDHA1P08559 390 aa15.81■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 PTPN4P29074 926 aa15.81■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 MXRA7P84157 204 aa15.81■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 SLC30A9Q6PML9 568 aa15.81■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 CFAP61Q8NHU2 1237 aa15.81■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 IL31RAQ8NI17 732 aa15.81■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 SEMA4DQ92854 862 aa15.81■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 TSC22D3Q99576 134 aa15.81■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 KIAA1586Q9HCI6 787 aa15.81■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa15.81■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 GRID1Q9ULK0 1009 aa15.81■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 ITGB5P18084 799 aa15.81■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 RXRBP28702 533 aa15.81■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 PTP4A2Q12974 167 aa15.81■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 SLC45A4Q5BKX6 768 aa15.81■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 FAM160B2Q86V87 743 aa15.81■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa15.81■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 HELQQ8TDG4 1101 aa15.81■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 FAM81BQ96LP2 452 aa15.81■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 SMC6Q96SB8 1091 aa15.81■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 COL20A1Q9P218 1284 aa15.81■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa15.81■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 MROH7Q68CQ1 1323 aa15.81■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 ENTPD5O75356 428 aa15.81■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 RALAP11233 206 aa15.81■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 MARK3P27448 753 aa15.81■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 PADI6Q6TGC4 694 aa15.81■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 MIER3Q7Z3K6 550 aa15.81■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC125Q86Z20 511 aa15.81■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 TTC25Q96NG3 672 aa15.81■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 SAR1AQ9NR31 198 aa15.81■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 FEM1BQ9UK73 627 aa15.81■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF536O15090 1300 aa15.8■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 UPP2O95045 317 aa15.8■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 KLRC2P26717 231 aa15.8■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 TUBP50607 506 aa15.8■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 BIRC2Q13490 618 aa15.8■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 SYT15Q9BQS2 421 aa15.8■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 MXRA8Q9BRK3 442 aa15.8■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 HEMGNQ9BXL5 484 aa15.8■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 SAYSD1Q9NPB0 183 aa15.8■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 CYLDQ9NQC7 956 aa15.8■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 KCNH7Q9NS40 1196 aa15.8■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 ZFP69BQ9UJL9 534 aa15.8■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 SPDYE5A6NIY4 337 aa15.8■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 C2CD2LO14523 706 aa15.8■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 ADRB2P07550 413 aa15.8■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 KRT15P19012 456 aa15.8■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 ADSSP30520 456 aa15.8■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 MUM1Q2TAK8 710 aa15.8■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 P3H1Q32P28 736 aa15.8■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 NLRP9Q7RTR0 991 aa15.8■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa15.8■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 RTKN2Q8IZC4 609 aa15.8■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 STOML1Q9UBI4 398 aa15.8■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.5 ms