RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420504.2

TMEM200B-201, Transcript of transmembrane protein 200B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM200B, Length 2,553 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200B-201ENST00000420504 PIK3CAP42336 1068 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 MGAT5Q09328 741 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 LARGE2Q8N3Y3 721 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 GPRASP2Q96D09 838 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 KIAA1586Q9HCI6 787 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 KCNA2P16389 499 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 TAC1P20366 129 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 MAGEA4P43358 317 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 ADCY1Q08828 1119 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 CUL2Q13617 745 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 P3H1Q32P28 736 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 FNBP1Q96RU3 617 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 CCDC77Q9BR77 488 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 FOXN2P32314 431 aa22.91■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 STRN3Q13033 797 aa22.91■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 MTFR1Q15390 333 aa22.91■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 SWSAP1Q6NVH7 229 aa22.91■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 XRRA1Q6P2D8 792 aa22.91■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 ANKLE1Q8NAG6 615 aa22.91■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 GLIS1Q8NBF1 620 aa22.91■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 USTQ9Y2C2 406 aa22.91■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 RIPK3Q9Y572 518 aa22.91■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 NFASCO94856 1347 aa22.91■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 TLR3O15455 904 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 NR3C2P08235 984 aa22.91■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 GCAP28676 217 aa22.91■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 GJC1P36383 396 aa22.91■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 ACOT2P49753 483 aa22.91■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 LIG4P49917 911 aa22.91■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 WDR4P57081 412 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa22.91■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 TLDC1Q6P9B6 456 aa22.91■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 TMEM270Q6UE05 265 aa22.91■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa22.91■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 FOXP3Q9BZS1 431 aa22.91■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 CYP26B1Q9NR63 512 aa22.91■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 STYXL1Q9Y6J8 313 aa22.91■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 RASA4BC9J798 803 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 WNT10BO00744 389 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 RASA4O43374 803 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 RGS20O76081 388 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 CCND2P30279 289 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 GNA15P30679 374 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 RNF43Q68DV7 783 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 CYP4F22Q6NT55 531 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 ASRGL1Q7L266 308 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 WNK4Q96J92 1243 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 IFT74Q96LB3 600 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 HAPLN2Q9GZV7 340 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 ARHGEF3Q9NR81 526 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 ZBED4O75132 1171 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 POTEJP0CG39 1038 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 KLHL29Q96CT2 875 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 EBF2Q9HAK2 575 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 CNTN6Q9UQ52 1028 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 L3MBTL1Q9Y468 752 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 SCINQ9Y6U3 715 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM200B-201ENST00000420504 LIASO43766 372 aa22.89■■□□□ 1.25
TMEM200B-201ENST00000420504 HSPA1LP34931 641 aa22.89■■□□□ 1.25
TMEM200B-201ENST00000420504 PRKCEQ02156 737 aa22.89■■□□□ 1.25
TMEM200B-201ENST00000420504 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
TMEM200B-201ENST00000420504 TMED2Q15363 201 aa22.89■■□□□ 1.25
TMEM200B-201ENST00000420504 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa22.89■■□□□ 1.25
TMEM200B-201ENST00000420504 GSTA5Q7RTV2 222 aa22.89■■□□□ 1.25
TMEM200B-201ENST00000420504 ANKRD35Q8N283 1001 aa22.89■■□□□ 1.25
TMEM200B-201ENST00000420504 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa22.89■■□□□ 1.25
TMEM200B-201ENST00000420504 KLHL11Q9NVR0 708 aa22.89■■□□□ 1.25
TMEM200B-201ENST00000420504 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
TMEM200B-201ENST00000420504 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
TMEM200B-201ENST00000420504 ZNF541Q9H0D2 1346 aa22.89■■□□□ 1.25
TMEM200B-201ENST00000420504 SIP14410 1827 aa22.89■■□□□ 1.25
TMEM200B-201ENST00000420504 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa22.89■■□□□ 1.25
TMEM200B-201ENST00000420504 FAM47DPA6NHR8 397 aa22.89■■□□□ 1.25
TMEM200B-201ENST00000420504 MAFGO15525 162 aa22.89■■□□□ 1.25
TMEM200B-201ENST00000420504 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.25
TMEM200B-201ENST00000420504 KRT16P08779 473 aa22.89■■□□□ 1.25
TMEM200B-201ENST00000420504 TCF4P15884 667 aa22.89■■□□□ 1.25
TMEM200B-201ENST00000420504 KIF2BQ8N4N8 673 aa22.89■■□□□ 1.25
TMEM200B-201ENST00000420504 RNF146Q9NTX7 359 aa22.89■■□□□ 1.25
TMEM200B-201ENST00000420504 DNPEPQ9ULA0 475 aa22.89■■□□□ 1.25
TMEM200B-201ENST00000420504 H0YCG3 227 aa22.88■■□□□ 1.25
TMEM200B-201ENST00000420504 VWA5AO00534 786 aa22.88■■□□□ 1.25
TMEM200B-201ENST00000420504 PSAPP07602 524 aa22.88■■□□□ 1.25
TMEM200B-201ENST00000420504 RPSAP08865 295 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
TMEM200B-201ENST00000420504 KRT10P13645 584 aa22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms